53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1635 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_1635  hypothetical protein  100 
 
 
323 aa  645    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0346  hypothetical protein  55.56 
 
 
309 aa  340  2e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1629  hypothetical protein  57.98 
 
 
307 aa  323  3e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.458622  normal  0.0210196 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2120  hypothetical protein  56.68 
 
 
308 aa  316  4e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1043  hypothetical protein  53.24 
 
 
294 aa  300  2e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.3637 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1706  hypothetical protein  34.1 
 
 
355 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0961  hypothetical protein  32.38 
 
 
350 aa  126  6e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.107414  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6115  hypothetical protein  34.19 
 
 
353 aa  125  8.000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1465  hypothetical protein  33.22 
 
 
353 aa  124  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2476  hypothetical protein  33.96 
 
 
339 aa  124  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3310  hypothetical protein  29.71 
 
 
380 aa  123  4e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.584963  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1419  hypothetical protein  32.89 
 
 
319 aa  121  9.999999999999999e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3332  hypothetical protein  31.38 
 
 
363 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.643264  normal  0.318214 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2380  hypothetical protein  33.12 
 
 
361 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.393268 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2112  hypothetical protein  32.51 
 
 
360 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13660  hypothetical protein  32.18 
 
 
365 aa  119  6e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00606112 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3632  hypothetical protein  32.7 
 
 
363 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0459  hypothetical protein  32.51 
 
 
360 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0312  hypothetical protein  33.87 
 
 
364 aa  119  9e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1846  hypothetical protein  33.55 
 
 
341 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2044  hypothetical protein  30.77 
 
 
355 aa  115  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2208  hypothetical protein  31.52 
 
 
356 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0358  hypothetical protein  31.25 
 
 
324 aa  112  6e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0783627  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4388  hypothetical protein  32.26 
 
 
365 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2194  hypothetical protein  30.99 
 
 
348 aa  109  8.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0136744  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0534  hypothetical protein  30.82 
 
 
345 aa  107  3e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0740403  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4201  protein of unknown function DUF475  29.27 
 
 
364 aa  107  3e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0472  hypothetical protein  30.82 
 
 
345 aa  106  4e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0017  hypothetical protein  33.96 
 
 
325 aa  107  4e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3015  hypothetical protein  29.62 
 
 
379 aa  106  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000228142  decreased coverage  0.0000469398 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1007  hypothetical protein  30.82 
 
 
333 aa  105  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02894  hypothetical protein  29.9 
 
 
341 aa  105  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1056  hypothetical protein  29.27 
 
 
422 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4752  protein of unknown function DUF475  29.5 
 
 
380 aa  104  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1294  hypothetical protein  33.46 
 
 
355 aa  103  4e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3676  hypothetical protein  30.63 
 
 
390 aa  102  9e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.721107 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2516  hypothetical protein  33.8 
 
 
354 aa  101  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0244  hypothetical protein  33.46 
 
 
348 aa  100  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1193  hypothetical protein  34.17 
 
 
339 aa  100  4e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.622103  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3191  protein of unknown function DUF475  28.17 
 
 
383 aa  100  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0757781  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0764  hypothetical protein  30.14 
 
 
355 aa  99  1e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.599399  normal  0.114508 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5505  hypothetical protein  29.11 
 
 
359 aa  98.2  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.324013  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1787  hypothetical protein  29.79 
 
 
355 aa  95.9  8e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0307879 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0770  hypothetical protein  29.79 
 
 
355 aa  95.9  8e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4653  hypothetical protein  27.76 
 
 
359 aa  94  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.219524  normal  0.625872 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0047  hypothetical protein  31.43 
 
 
348 aa  91.3  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0076  hypothetical protein  29.55 
 
 
362 aa  90.1  5e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000415937  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33950  hypothetical protein  38.71 
 
 
419 aa  60.8  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.144001  normal  0.695383 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2489  protein of unknown function DUF475  49.21 
 
 
374 aa  54.7  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.384164  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4372  integral membrane protein TerC  30.33 
 
 
341 aa  44.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18139  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2699  deoxyhypusine synthase-like protein  34.88 
 
 
349 aa  43.5  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0339  integral membrane protein TerC  29.11 
 
 
255 aa  42.7  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2770  Integral membrane protein TerC  37.5 
 
 
255 aa  42.7  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>