More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1175 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1175  Integral membrane protein TerC  100 
 
 		 271 aa  546  1e-155  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1776  integral membrane protein TerC  64.37 
 
 		 259 aa  355  2.9999999999999997e-97  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.221136  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1856  Integral membrane protein TerC  62.92 
 
 		 266 aa  343  2e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00332833  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1726  hypothetical protein  61.69 
 
 		 255 aa  316  3e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.185755  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2770  Integral membrane protein TerC  61.22 
 
 		 255 aa  312  3.9999999999999997e-84  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0990  Integral membrane protein TerC  42.86 
 
 		 245 aa  184  1.0000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1296  Integral membrane protein TerC  43.42 
 
 		 245 aa  168  9e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0964782  normal  0.506232 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2785  membrane protein TerC  40.09 
 
 		 284 aa  150  3e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000011101  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0443  tellurium resistance protein TerC  41.44 
 
 		 281 aa  149  5e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.850021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0382  integral membrane protein TerC  42.72 
 
 		 263 aa  148  8e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0339  integral membrane protein TerC  40.09 
 
 		 255 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4213  tellurium resistance protein TerC  40.54 
 
 		 285 aa  146  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.537903  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1297  Integral membrane protein TerC  42.16 
 
 		 235 aa  145  6e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.798982  normal  0.308093 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4857  putative tellurium resistance protein  40.27 
 
 		 263 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.002558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0387  integral membrane protein TerC  41.4 
 
 		 262 aa  145  9e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.518334  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0578  Integral membrane protein TerC  38.81 
 
 		 247 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.592878 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0388  tellurium resistance protein  42.25 
 
 		 263 aa  143  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000390174  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0379  TerC family integral membrane protein  42.25 
 
 		 263 aa  143  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000163216  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0402  tellurium resistance protein  42.25 
 
 		 263 aa  143  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.221092  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0446  putative tellurium resistance protein  42.25 
 
 		 263 aa  143  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0516  putative tellurium resistance protein  42.25 
 
 		 263 aa  142  4e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000032211  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0467  putative tellurium resistance protein  42.25 
 
 		 263 aa  142  4e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000225895  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0376  TerC family integral membrane protein  42.25 
 
 		 263 aa  142  5e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499103  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0516  tellurium resistance protein, putative  41.78 
 
 		 263 aa  142  7e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0610  TerC family integral membrane protein  33.73 
 
 		 268 aa  135  5e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00407754  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1298  Integral membrane protein TerC  32.2 
 
 		 242 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.843516  normal  0.300897 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0992  Integral membrane protein TerC  43.22 
 
 		 233 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1036  integral membrane protein TerC  34.63 
 
 		 267 aa  127  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1019  integral membrane protein TerC  33.59 
 
 		 267 aa  124  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.192115  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1038  integral membrane protein TerC  33.59 
 
 		 267 aa  124  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00785586  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1224  integral membrane protein TerC  34.35 
 
 		 264 aa  124  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.391014  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1462  membrane protein, TerC family  34.05 
 
 		 264 aa  123  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1824  integral membrane protein TerC  39.5 
 
 		 251 aa  123  3e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1422  hypothetical protein  34.35 
 
 		 264 aa  122  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1200  TerC family integral membrane protein  34.35 
 
 		 264 aa  123  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1202  TerC family integral membrane protein  34.05 
 
 		 264 aa  123  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0439285  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1398  membrane protein, TerC family  34.35 
 
 		 264 aa  122  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3984  membrane protein, TerC family  34.35 
 
 		 264 aa  123  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1360  membrane protein, TerC family  34.35 
 
 		 264 aa  123  4e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1223  hypothetical protein  34.35 
 
 		 266 aa  122  6e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1322  hypothetical protein  34.35 
 
 		 264 aa  122  6e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2572  tellurium resistance protein TerC  36.1 
 
 		 295 aa  113  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0089  hypothetical protein  38.94 
 
 		 260 aa  113  3e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0183454 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1171  TerC family protein  33.8 
 
 		 246 aa  109  4.0000000000000004e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.674887  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2829  Integral membrane protein TerC  32.67 
 
 		 245 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0867019  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2235  integral membrane protein TerC  33.18 
 
 		 274 aa  104  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10491  tellurium resistance protein TerC  33.83 
 
 		 240 aa  102  5e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.120538  hitchhiker  0.00269947 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1304  TerC family protein  33.03 
 
 		 245 aa  102  6e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.666261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0367  membrane protein TerC  32.84 
 
 		 240 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1844  Integral membrane protein TerC  30.66 
 
 		 239 aa  100  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0960  hypothetical protein  36.27 
 
 		 236 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0967888  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2338  Integral membrane protein TerC  29.84 
 
 		 277 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1578  integral membrane protein TerC  31.05 
 
 		 258 aa  97.1  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.22538  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3425  hypothetical protein  31.43 
 
 		 240 aa  97.8  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10281  membrane protein TerC  35.78 
 
 		 236 aa  97.8  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.919914  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1024  Integral membrane protein TerC  34.25 
 
 		 233 aa  96.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0081641 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10291  membrane protein TerC  35.78 
 
 		 232 aa  96.3  5e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0549  hypothetical protein  31.79 
 
 		 253 aa  95.9  6e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2735  Integral membrane protein TerC  33.33 
 
 		 247 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3367  Integral membrane protein TerC  33.33 
 
 		 247 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.50286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09161  tellurium resistance protein TerC  35.2 
 
 		 236 aa  92.8  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4409  Integral membrane protein TerC  31.77 
 
 		 254 aa  90.1  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4472  Integral membrane protein TerC  31.91 
 
 		 254 aa  87  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.919859 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09251  tellurium resistance protein TerC  31.69 
 
 		 236 aa  86.3  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0654271  hitchhiker  0.00000817994 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3826  integral membrane protein TerC  27.88 
 
 		 238 aa  72.8  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000678399  normal  0.474132 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2343  integral membrane protein TerC  28.05 
 
 		 324 aa  70.9  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.912158  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1293  Integral membrane protein TerC  25 
 
 		 528 aa  68.9  0.00000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3390  Integral membrane protein TerC  28.11 
 
 		 227 aa  68.9  0.00000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.114305  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4045  integral membrane protein TerC  28.11 
 
 		 227 aa  68.9  0.00000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0388  Integral membrane protein TerC  30.05 
 
 		 228 aa  68.2  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.10914  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3020  Integral membrane protein TerC  25.55 
 
 		 238 aa  68.2  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000258386  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0901  Integral membrane protein TerC  25.83 
 
 		 238 aa  68.2  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00975959  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3943  integral membrane protein TerC  28.5 
 
 		 232 aa  67.8  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.209057  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0194  integral membrane protein TerC  27.18 
 
 		 247 aa  67.8  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0070  hypothetical protein  25.39 
 
 		 234 aa  67  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.693932  normal  0.419682 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3200  Integral membrane protein TerC  24.34 
 
 		 238 aa  67  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2993  integral membrane protein TerC  23.9 
 
 		 339 aa  66.6  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2677  integral membrane protein TerC  28.27 
 
 		 527 aa  66.2  0.0000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.15378 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3038  Integral membrane protein TerC  24 
 
 		 577 aa  65.1  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10498  membrane protein, TerC family protein  24.03 
 
 		 322 aa  65.1  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0747324  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3448  Integral membrane protein TerC  27.64 
 
 		 360 aa  64.3  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000597859  hitchhiker  0.00065247 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02680  predicted inner membrane protein  27.1 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000474889  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0858  Integral membrane protein TerC  27.1 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000383082  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2980  TerC family integral membrane protein  27.1 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000029602  normal  0.0103566 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0883  integral membrane protein TerC  27.1 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0104396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2979  TerC family integral membrane protein  27.1 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000702037  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4099  integral membrane protein, TerC family  27.1 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000012685  hitchhiker  0.00127098 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1266  Integral membrane protein TerC  30.05 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3152  TerC family integral membrane protein  27.1 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000251436  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0806  Integral membrane protein TerC  23.08 
 
 		 353 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3030  integral membrane protein, TerC family  27.1 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130968  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02641  hypothetical protein  27.1 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000421681  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0880  integral membrane protein TerC  23.56 
 
 		 341 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.148289 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3219  hypothetical protein  24.41 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0516172  hitchhiker  0.00113241 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3153  protein YegH  24.41 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000196217  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3171  protein YegH  24.41 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00710454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3334  hypothetical protein  24.41 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00486837  hitchhiker  0.00634804 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3234  hypothetical protein  24.41 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00228616  hitchhiker  0.000000995784 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2138  hypothetical protein  24.5 
 
 		 317 aa  62.8  0.000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0479  hypothetical protein  27.45 
 
 		 318 aa  62.8  0.000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000001102  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>