More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0712 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0712  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
302 aa  573  1.0000000000000001e-162  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.900284  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.65 
 
 
321 aa  311  1e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2814  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.84 
 
 
320 aa  305  5.0000000000000004e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00107512 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1232  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.48 
 
 
319 aa  303  3.0000000000000004e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4302  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.5 
 
 
441 aa  272  4.0000000000000004e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0502009  hitchhiker  0.0000630788 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4372  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.6 
 
 
300 aa  265  5e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.292938  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7382  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.53 
 
 
294 aa  256  4e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.916295 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10010  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  48.63 
 
 
307 aa  239  5.999999999999999e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00312857  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9278  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.04 
 
 
291 aa  220  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.87 
 
 
291 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.806375  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.92 
 
 
345 aa  202  7e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0917022  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1174  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.58 
 
 
367 aa  186  5e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0829949  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1283  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  39.22 
 
 
252 aa  172  5.999999999999999e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0507526 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0407  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.52 
 
 
263 aa  171  2e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0827  ABC aliphatic sulfonate transporter, inner membrane subunit  38.02 
 
 
252 aa  170  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.819281  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4113  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.89 
 
 
245 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0627503  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4139  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.33 
 
 
245 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0428  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.13 
 
 
254 aa  159  7e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0356148  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1295  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.84 
 
 
259 aa  156  3e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1184  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.71 
 
 
264 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0191984  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0998  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.93 
 
 
260 aa  138  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.944594 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3998  ABC transporter, inner membrane subunit  42.79 
 
 
253 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451031  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1982  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.82 
 
 
266 aa  132  9e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.187248  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6203  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.82 
 
 
284 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.780444  normal  0.280504 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30900  ABC transporter, permease protein  35.71 
 
 
288 aa  121  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3601  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.89 
 
 
292 aa  117  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.475828  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.19 
 
 
263 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1412  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.75 
 
 
277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.72654  normal  0.222261 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.88 
 
 
255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2515  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.56 
 
 
282 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.313862  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0153  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.4 
 
 
277 aa  112  7.000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.589472  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2358  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  30.65 
 
 
269 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.540869 
 
 
-
 
NC_003296  RS03033  transmembranee ABC transporter protein  31.39 
 
 
298 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.744864  normal  0.0870544 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
277 aa  112  9e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750363  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2787  ABC transporter, permease protein  31.51 
 
 
282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0328614  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2679  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.87 
 
 
290 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6691  putative ABC transporter  32.28 
 
 
288 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4373  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.24 
 
 
308 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.69 
 
 
252 aa  109  5e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000799696  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1974  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  27.84 
 
 
261 aa  108  7.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000226251  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5058  ABC transporter permease protein  28.37 
 
 
289 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.987794  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0514  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.38 
 
 
300 aa  107  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.563541  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3160  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.93 
 
 
274 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.913146  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3295  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.92 
 
 
279 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3451  ABC transporter related  36.94 
 
 
578 aa  107  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.90461  hitchhiker  0.00285782 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.05 
 
 
292 aa  106  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0652457 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.01 
 
 
289 aa  106  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.608365 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0438  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.16 
 
 
251 aa  105  7e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.46 
 
 
298 aa  105  8e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.281805  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19510  ABC transporter permease  32.94 
 
 
274 aa  105  8e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4123  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.46 
 
 
298 aa  105  8e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0673  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.68 
 
 
275 aa  105  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0666321  normal  0.331074 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1679  ABC transporter permease  32.54 
 
 
274 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.451747  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.72 
 
 
276 aa  104  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.936191 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2553  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.7 
 
 
275 aa  103  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.04 
 
 
296 aa  104  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.45 
 
 
292 aa  104  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1031  sulfonate ABC transporter, permease protein  31.4 
 
 
261 aa  103  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6047  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.43 
 
 
292 aa  103  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.309315 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1869  ABC transporter, permease protein  34.98 
 
 
323 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1584  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.54 
 
 
288 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4564  taurine transporter subunit  31.56 
 
 
279 aa  102  6e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0208  nitrate ABC transporter, permease protein, putative  33.76 
 
 
260 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.473726 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0821  permease  34.84 
 
 
313 aa  102  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00555891  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0340  permease  34.84 
 
 
313 aa  102  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1881  ABC transporter, permease protein  34.84 
 
 
323 aa  102  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.259597  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1684  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, permease protein  34.84 
 
 
323 aa  102  8e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.483892  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00317  taurine transporter subunit  36.06 
 
 
275 aa  102  9e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2036  permease  34.84 
 
 
323 aa  102  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3261  taurine transporter subunit  36.06 
 
 
275 aa  102  9e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00321  hypothetical protein  36.06 
 
 
275 aa  102  9e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3526  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  31.08 
 
 
280 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.471487 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1473  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.12 
 
 
306 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0411979  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2172  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  32.21 
 
 
292 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.287546  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0156  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  32.69 
 
 
292 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.557075  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1242  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.97 
 
 
295 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3150  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30 
 
 
273 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6590  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.97 
 
 
295 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.446699 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3153  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  36.53 
 
 
303 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3890  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.53 
 
 
303 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.451363  normal  0.0367857 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3613  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.72 
 
 
377 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0193  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.44 
 
 
287 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.778332  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2935  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.09 
 
 
252 aa  100  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2566  ABC transporter, membrane subunit  29.18 
 
 
252 aa  100  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2085  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.38 
 
 
319 aa  100  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0787698 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6102  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.48 
 
 
291 aa  99.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4890  putative ABC transporter (permease protein)  32 
 
 
281 aa  100  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.2612 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1975  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.48 
 
 
291 aa  99.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.690359  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.54 
 
 
287 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6194  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.35 
 
 
295 aa  99.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19350  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  29.86 
 
 
293 aa  99.8  6e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.449157  normal  0.837307 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5196  ABC transporter, permease protein  31.78 
 
 
288 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.54 
 
 
305 aa  99.4  6e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0191  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.54 
 
 
287 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.466577  normal  0.686195 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0339  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.78 
 
 
311 aa  99  8e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.461583 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3693  taurine transporter subunit  31.78 
 
 
284 aa  99  8e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3936  taurine transporter subunit  31.78 
 
 
284 aa  99  8e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0260  taurine transporter subunit  31.78 
 
 
284 aa  99  8e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2132  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  29.39 
 
 
262 aa  99  8e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.29 
 
 
285 aa  99  9e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.987071 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>