More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3079 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3079  Sel1 domain-containing protein  100 
 
 		 384 aa  756    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0573421  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4775  Sel1-like  43.98 
 
 		 368 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4319  Sel1  49.29 
 
 		 367 aa  246  3e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.754604  normal  0.455844 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4473  Sel1-like protein  46.67 
 
 		 366 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3536  Sel1  40.27 
 
 		 357 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1008  Sel1 domain protein repeat-containing protein  47.45 
 
 		 363 aa  229  6e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3521  Sel1 domain-containing protein  41.76 
 
 		 387 aa  223  6e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.894704  normal  0.280761 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2739  Sel1 repeat-containing protein  40.91 
 
 		 346 aa  222  8e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0269187  normal  0.433518 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6931  putative Beta-lactamase  40.87 
 
 		 368 aa  217  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.565773 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2371  Sel1 domain-containing protein  43.53 
 
 		 372 aa  208  1e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.312198 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2648  Sel1 domain protein repeat-containing protein  43.68 
 
 		 347 aa  205  1e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0668923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0312  Sel1 domain protein repeat-containing protein  46.74 
 
 		 322 aa  204  3e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.109575 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2327  Sel1 domain protein repeat-containing protein  48.91 
 
 		 382 aa  202  7e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.239652  normal  0.179053 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7281  Sel1 domain protein repeat-containing protein  47.52 
 
 		 319 aa  200  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00795685  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0154  Sel1 domain-containing protein  48.87 
 
 		 350 aa  196  6e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0876617 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6006  Sel1 domain-containing protein  47.21 
 
 		 321 aa  195  9e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687417 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3268  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.14 
 
 		 360 aa  158  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.561586 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3183  Sel1 repeat-containing protein  34.82 
 
 		 337 aa  157  3e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.440754  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2666  Sel1 domain-containing protein  32.89 
 
 		 381 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0163222  normal  0.379262 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3567  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.41 
 
 		 360 aa  153  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0755433 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.91 
 
 		 341 aa  149  6e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  38.25 
 
 		 416 aa  149  6e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3674  enhanced entry protein  34.29 
 
 		 540 aa  148  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203101  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  39.65 
 
 		 1402 aa  148  2.0000000000000003e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  39.91 
 
 		 489 aa  145  9e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  37.04 
 
 		 831 aa  145  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  36.75 
 
 		 684 aa  140  3.9999999999999997e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  39.23 
 
 		 961 aa  139  7e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1207  Sel1 domain-containing protein  34.28 
 
 		 350 aa  139  7e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.838617  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  35.78 
 
 		 789 aa  136  6.0000000000000005e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  34.3 
 
 		 393 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  36.89 
 
 		 557 aa  134  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  38.67 
 
 		 685 aa  133  5e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.09 
 
 		 528 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  37.8 
 
 		 448 aa  129  8.000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  37.38 
 
 		 305 aa  128  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  35.62 
 
 		 256 aa  127  4.0000000000000003e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  34.25 
 
 		 425 aa  126  6e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  42.52 
 
 		 380 aa  126  7e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  34.94 
 
 		 1032 aa  126  7e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  35.29 
 
 		 373 aa  125  1e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  34.9 
 
 		 373 aa  123  5e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.93 
 
 		 318 aa  122  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1651  hypothetical protein  34.08 
 
 		 362 aa  122  9.999999999999999e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.563504  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0203  Sel1 domain-containing protein  39.53 
 
 		 358 aa  122  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1708  hypothetical protein  34.08 
 
 		 362 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  31.07 
 
 		 376 aa  121  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  31.07 
 
 		 376 aa  120  3e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1053  Sel1-like  35.34 
 
 		 679 aa  119  6e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  34.65 
 
 		 680 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  41.24 
 
 		 274 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  33.09 
 
 		 1002 aa  117  3.9999999999999997e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 		 976 aa  117  3.9999999999999997e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  34.96 
 
 		 329 aa  116  6e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  36.93 
 
 		 359 aa  116  6e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  37.77 
 
 		 255 aa  116  6e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  32.31 
 
 		 1493 aa  115  8.999999999999998e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1617  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  41.49 
 
 		 798 aa  114  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154049  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  35.41 
 
 		 490 aa  114  3e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  34.62 
 
 		 303 aa  114  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  34.59 
 
 		 271 aa  113  7.000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.27 
 
 		 346 aa  113  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.17 
 
 		 380 aa  112  8.000000000000001e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  35.41 
 
 		 490 aa  112  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4028  Sel1 domain-containing protein  39.34 
 
 		 301 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.530844  normal  0.391512 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  34.29 
 
 		 342 aa  111  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  37.07 
 
 		 464 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  33.33 
 
 		 838 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  34.62 
 
 		 232 aa  110  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6186  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.41 
 
 		 316 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  29.08 
 
 		 1037 aa  109  8.000000000000001e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  33.66 
 
 		 235 aa  109  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1127  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.18 
 
 		 272 aa  107  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111937  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  32.29 
 
 		 380 aa  107  4e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.65 
 
 		 392 aa  106  8e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0449  Sel1 domain-containing protein  36.67 
 
 		 276 aa  105  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  36.31 
 
 		 185 aa  105  1e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  32.02 
 
 		 245 aa  105  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1116  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.07 
 
 		 321 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0560927  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0661  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.56 
 
 		 512 aa  104  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  33.94 
 
 		 267 aa  104  3e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0874  hypothetical protein  28.81 
 
 		 399 aa  103  5e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4233  Sel1  33.62 
 
 		 315 aa  103  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3497  caspase-1, p20  34.62 
 
 		 971 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3142  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.55 
 
 		 971 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.089148 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  31.8 
 
 		 264 aa  101  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0954  Sel1 domain-containing protein  32.11 
 
 		 478 aa  100  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.683818  normal  0.302016 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3235  AAA ATPase  34.43 
 
 		 839 aa  100  5e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2103  Sel1 domain-containing protein  32.98 
 
 		 357 aa  100  6e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0952151  normal  0.0177116 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  31.75 
 
 		 1877 aa  99.8  7e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1987  Sel1 domain-containing protein  34.29 
 
 		 505 aa  99  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.461505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27845  predicted protein  34.38 
 
 		 536 aa  99  1e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.437559  normal  0.166245 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  34.9 
 
 		 208 aa  99  1e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.08 
 
 		 865 aa  99.4  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4237  peptidoglycan-binding LysM  37.92 
 
 		 1910 aa  98.2  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618664  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1107  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.2 
 
 		 270 aa  98.6  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00367364  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.36 
 
 		 278 aa  97.8  2e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  37.5 
 
 		 254 aa  98.2  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2457  Sel1  32.54 
 
 		 348 aa  97.4  4e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.32 
 
 		 255 aa  97.4  4e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>