More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2295 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_2295  hypothetical protein  100 
 
 		 316 aa  632  1e-180  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.491669  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0567  hypothetical protein  71.1 
 
 		 329 aa  454  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3576  hypothetical protein  65.03 
 
 		 330 aa  426  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.37147  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4467  hypothetical protein  65.41 
 
 		 328 aa  401  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0114308  normal  0.0574707 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5792  hypothetical protein  56.7 
 
 		 326 aa  334  9e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4082  hypothetical protein  51.89 
 
 		 291 aa  291  7e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1801  hypothetical protein  40.85 
 
 		 343 aa  236  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.939675  normal  0.361643 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5978  hypothetical protein  38.78 
 
 		 327 aa  205  7e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665972  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2943  hypothetical protein  36.27 
 
 		 333 aa  203  3e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.357737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2451  hypothetical protein  37.14 
 
 		 330 aa  194  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1950  hypothetical protein  34.22 
 
 		 327 aa  193  4e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0031153 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  36.73 
 
 		 335 aa  191  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5624  hypothetical protein  35.16 
 
 		 321 aa  191  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.614615  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0286  hypothetical protein  34.35 
 
 		 334 aa  191  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3194  hypothetical protein  35.37 
 
 		 328 aa  190  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.195792  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0198  twin-arginine translocation pathway signal  36.33 
 
 		 328 aa  189  5.999999999999999e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.297337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4788  hypothetical protein  34.06 
 
 		 328 aa  189  7e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0126294  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0236  hypothetical protein  35.03 
 
 		 329 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3657  hypothetical protein  35.24 
 
 		 322 aa  187  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4796  hypothetical protein  35.74 
 
 		 331 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0805  hypothetical protein  35.86 
 
 		 328 aa  186  6e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0136  hypothetical protein  36 
 
 		 355 aa  186  6e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  38.22 
 
 		 328 aa  185  9e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3311  hypothetical protein  34.01 
 
 		 324 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.187965 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2663  hypothetical protein  34.01 
 
 		 324 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  33.12 
 
 		 332 aa  183  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0073  hypothetical protein  36.33 
 
 		 330 aa  182  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.614615  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5315  hypothetical protein  33.56 
 
 		 332 aa  179  7e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.248972  normal  0.736345 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  35.67 
 
 		 324 aa  178  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4305  hypothetical protein  33.44 
 
 		 327 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1838  hypothetical protein  32.17 
 
 		 330 aa  175  8e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2502  hypothetical protein  35.17 
 
 		 333 aa  174  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0326182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2752  hypothetical protein  33.77 
 
 		 325 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.299516 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3116  twin-arginine translocation pathway signal  33.99 
 
 		 331 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.143461  normal  0.765055 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  33.9 
 
 		 328 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  33.9 
 
 		 328 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0604  hypothetical protein  36.3 
 
 		 329 aa  172  5e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.492978 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  33.54 
 
 		 322 aa  172  5e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  33.33 
 
 		 337 aa  172  5e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  33.85 
 
 		 331 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  35.16 
 
 		 335 aa  172  6.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  31.51 
 
 		 327 aa  171  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  31.83 
 
 		 325 aa  172  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  35.15 
 
 		 339 aa  171  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  33.56 
 
 		 330 aa  171  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4405  hypothetical protein  34.47 
 
 		 329 aa  170  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.631102  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  33.56 
 
 		 339 aa  169  5e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  33.79 
 
 		 328 aa  169  5e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3470  hypothetical protein  33.22 
 
 		 330 aa  169  5e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  33.33 
 
 		 328 aa  169  7e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  34.59 
 
 		 330 aa  168  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  34.69 
 
 		 314 aa  167  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  31.19 
 
 		 323 aa  168  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0522  hypothetical protein  34.13 
 
 		 324 aa  168  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3678  hypothetical protein  34.36 
 
 		 327 aa  167  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0710  hypothetical protein  34.33 
 
 		 331 aa  167  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  32.41 
 
 		 330 aa  167  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  31.33 
 
 		 328 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4638  hypothetical protein  32.75 
 
 		 326 aa  167  2.9999999999999998e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  32.88 
 
 		 348 aa  166  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  32.41 
 
 		 330 aa  166  4e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  35.31 
 
 		 334 aa  166  5.9999999999999996e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2249  hypothetical protein  31.62 
 
 		 325 aa  165  6.9999999999999995e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.570594 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  32.65 
 
 		 323 aa  166  6.9999999999999995e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3329  hypothetical protein  36.46 
 
 		 323 aa  166  6.9999999999999995e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.422296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1508  hypothetical protein  31.62 
 
 		 322 aa  166  6.9999999999999995e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1625  hypothetical protein  31.62 
 
 		 325 aa  166  6.9999999999999995e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.354122  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2429  hypothetical protein  31.31 
 
 		 326 aa  165  8e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0710  hypothetical protein  33.21 
 
 		 328 aa  165  9e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3566  hypothetical protein  32.89 
 
 		 330 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00357296  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2422  hypothetical protein  34.73 
 
 		 698 aa  164  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403526 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  29.97 
 
 		 325 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3827  hypothetical protein  32.8 
 
 		 330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  33.9 
 
 		 355 aa  163  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  30.48 
 
 		 322 aa  163  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  34.72 
 
 		 327 aa  163  3e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  34.72 
 
 		 325 aa  164  3e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  31.74 
 
 		 332 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  32.7 
 
 		 318 aa  163  4.0000000000000004e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  33.45 
 
 		 353 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  33.12 
 
 		 328 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3665  hypothetical protein  30.84 
 
 		 326 aa  162  7e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.155683  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2570  hypothetical protein  33.54 
 
 		 339 aa  161  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.052781 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3548  hypothetical protein  34.8 
 
 		 334 aa  161  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0576712  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1316  hypothetical protein  31.27 
 
 		 334 aa  161  1e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.293847  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5514  hypothetical protein  33.56 
 
 		 330 aa  161  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  31.55 
 
 		 328 aa  160  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  31.99 
 
 		 331 aa  160  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4082  hypothetical protein  33.66 
 
 		 331 aa  160  3e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  31.38 
 
 		 322 aa  160  3e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0208  hypothetical protein  33.22 
 
 		 335 aa  160  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1449  twin-arginine translocation pathway signal  32.82 
 
 		 331 aa  160  3e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0404058  normal  0.58438 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2820  hypothetical protein  33.45 
 
 		 359 aa  160  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.407557  normal  0.294179 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4337  extra-cytoplasmic solute receptor  31.67 
 
 		 335 aa  160  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1769  hypothetical protein  29.21 
 
 		 330 aa  160  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.416782  normal  0.417571 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3101  hypothetical protein  32.91 
 
 		 322 aa  159  5e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  33.92 
 
 		 318 aa  159  6e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  31.11 
 
 		 327 aa  159  8e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4494  hypothetical protein  32.92 
 
 		 330 aa  159  8e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125803 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  32.42 
 
 		 323 aa  158  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>