More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0751 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4251  ABC transporter related  71.67 
 
 
558 aa  751    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1617  ABC transporter-related protein  77.53 
 
 
547 aa  823    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.683358  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0751  ABC transporter related  100 
 
 
557 aa  1115    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5294  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  61.08 
 
 
549 aa  655    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.26421  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0668  ABC transporter related  60.38 
 
 
534 aa  616  1e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3218  ABC transporter related  59.89 
 
 
585 aa  609  1e-173  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5232  ABC transporter related  59.59 
 
 
552 aa  598  1e-169  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1648  ABC transporter related  57.74 
 
 
538 aa  597  1e-169  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0423  ABC transporter related  59.48 
 
 
554 aa  596  1e-169  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1149  ABC transporter related  57.91 
 
 
546 aa  596  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.108293 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2574  ABC transporter related  57.65 
 
 
552 aa  595  1e-169  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3317  ABC transporter related  56.59 
 
 
545 aa  597  1e-169  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0279839  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4377  ABC transporter related  60 
 
 
534 aa  592  1e-168  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3657  ABC transporter related  60.19 
 
 
540 aa  590  1e-167  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1038  ABC transporter related  57.36 
 
 
545 aa  587  1e-166  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448383  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2011  ABC transporter component  58.35 
 
 
560 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3130  ABC transporter related  55.96 
 
 
552 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.713797  normal  0.141253 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2915  ABC transporter related  56.64 
 
 
540 aa  584  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0265985  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2970  ABC transporter related  60.38 
 
 
538 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.382736  normal  0.018129 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0403  ABC transporter related  57.88 
 
 
550 aa  579  1e-164  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1510  ABC transporter related  57.66 
 
 
534 aa  581  1e-164  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.706226  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7555  ABC transporter, ATP-binding protein  56.47 
 
 
544 aa  579  1e-164  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.665329  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0982  ABC transporter component  55.31 
 
 
541 aa  571  1e-161  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.616195  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1510  ABC transporter related  55.95 
 
 
539 aa  567  1e-160  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3487  ABC transporter related  55.37 
 
 
552 aa  561  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4330  putative ABC transporter, ATP-binding protein  56.58 
 
 
540 aa  550  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2207  ABC transporter related  59.08 
 
 
549 aa  550  1e-155  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252505  normal  0.194829 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5258  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.84 
 
 
548 aa  544  1e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.170302 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1195  Sulfate-transporting ATPase  53.61 
 
 
552 aa  537  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0560  ABC transporter related  52.82 
 
 
542 aa  529  1e-149  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000861738  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1407  ABC transporter related  52.64 
 
 
550 aa  525  1e-148  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.288538  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1222  ABC transporter related  53.37 
 
 
553 aa  527  1e-148  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1076  ABC transporter related  49.54 
 
 
546 aa  518  1e-146  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.123056 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4026  ABC transporter related  53.47 
 
 
557 aa  520  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2005  ABC transporter related  51.09 
 
 
552 aa  514  1e-144  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.664447 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1496  ABC transporter related  50.09 
 
 
532 aa  509  1e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  49.91 
 
 
549 aa  499  1e-140  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3803  ABC transporter related  52.95 
 
 
556 aa  499  1e-140  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1838  ABC transporter related  49.55 
 
 
556 aa  484  1e-135  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1185  ABC transporter related  47.45 
 
 
547 aa  480  1e-134  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5904  ABC transporter related  46.21 
 
 
555 aa  476  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.969657  normal  0.702258 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6678  ABC transporter related  48.37 
 
 
562 aa  475  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03560  ABC-type dipeptide transport system, ATPase component  43.77 
 
 
564 aa  472  1e-132  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4143  ABC transporter related  46.11 
 
 
556 aa  474  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.538724 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0247  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  48.41 
 
 
542 aa  469  1.0000000000000001e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7051  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  49.25 
 
 
545 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1933  ABC transporter related  49.53 
 
 
542 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120655  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7329  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  46.45 
 
 
626 aa  471  1.0000000000000001e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.148864  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2209  ABC transporter related  49.24 
 
 
542 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.326804  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1824  ABC transporter related  49.62 
 
 
542 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.160839  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3363  ABC transporter related  47.46 
 
 
542 aa  470  1.0000000000000001e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3919  ABC transporter related  48.69 
 
 
543 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3646  ABC transporter related  46.96 
 
 
609 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4080  ABC transporter related  48.03 
 
 
542 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  45.68 
 
 
612 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00796  fused predicted peptide transport subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  47.5 
 
 
612 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.885832  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2813  ABC transporter related protein  47.5 
 
 
623 aa  465  9.999999999999999e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.666718  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6874  ABC transporter related  45.29 
 
 
555 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00813  hypothetical protein  47.5 
 
 
612 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.991571  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1323  glutathione transporter ATP-binding protein  48.9 
 
 
623 aa  468  9.999999999999999e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0900  glutathione transporter ATP-binding protein  47.68 
 
 
623 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0980  glutathione transporter ATP-binding protein  47.68 
 
 
629 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4026  ABC transporter related  47.26 
 
 
546 aa  467  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  0.697509 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5116  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  44.42 
 
 
555 aa  468  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4108  ABC transporter related  45.52 
 
 
623 aa  466  9.999999999999999e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.486076  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2402  ABC transporter related  47.25 
 
 
615 aa  468  9.999999999999999e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3489  glutathione import ATP-binding protein GsiA  49.24 
 
 
537 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0854  glutathione transporter ATP-binding protein  47.68 
 
 
623 aa  464  1e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4135  ABC transporter related  47.84 
 
 
545 aa  463  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0011  ABC transporter related  46.52 
 
 
553 aa  464  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0887  glutathione transporter ATP-binding protein  47.5 
 
 
623 aa  462  1e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0292  ABC transporter, ATPase subunit  48.96 
 
 
545 aa  464  1e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2519  glutathione transporter ATP-binding protein  47.5 
 
 
623 aa  464  1e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.503965  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2815  glutathione transporter ATP-binding protein  47.5 
 
 
623 aa  462  1e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.990596  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0817  ABC transporter related  51.12 
 
 
545 aa  464  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252314  normal  0.0669471 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2452  ABC transporter related  46.65 
 
 
571 aa  465  1e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000520728 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3723  ABC transporter related  48.96 
 
 
545 aa  463  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3131  ABC transporter related  46.46 
 
 
640 aa  463  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.022829  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3377  ABC transporter related  45.32 
 
 
575 aa  464  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.169433  normal  0.0551648 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4449  ABC transporter related  48.03 
 
 
545 aa  464  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.875798 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5362  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  45.65 
 
 
611 aa  464  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1268  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  48.23 
 
 
540 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1351  ABC transporter related  47.25 
 
 
544 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3002  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.38 
 
 
625 aa  459  9.999999999999999e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0889  glutathione transporter ATP-binding protein  46.78 
 
 
623 aa  460  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.448185  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2498  ABC transporter related  46.8 
 
 
544 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000299365  normal  0.0176936 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1868  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  46.58 
 
 
633 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.425351  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0916  glutathione transporter ATP-binding protein  46.78 
 
 
623 aa  459  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5135  ABC transporter related  48.5 
 
 
571 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.423456  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4397  ABC transporter related protein  45.34 
 
 
623 aa  461  9.999999999999999e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0655491  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5758  ABC transporter related  47.42 
 
 
611 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0214  ABC transporter related  49.91 
 
 
586 aa  460  9.999999999999999e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0229291  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3002  ABC transporter related  48.96 
 
 
531 aa  459  9.999999999999999e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0382  ABC transporter related  48.59 
 
 
543 aa  460  9.999999999999999e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0245  ABC transporter related  47.17 
 
 
542 aa  461  9.999999999999999e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0463  ABC transporter, ATP-binding protein  43.05 
 
 
609 aa  461  9.999999999999999e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3570  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.58 
 
 
633 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.15689 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1353  ABC transporter related  47.94 
 
 
613 aa  458  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0999  glutathione transporter ATP-binding protein  46.61 
 
 
623 aa  458  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.666718  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1272  ABC transporter-related protein  48.08 
 
 
548 aa  455  1e-127  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000618356 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>