More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0230 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0230  hypothetical protein  100 
 
 
325 aa  656    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.297897  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  41.01 
 
 
332 aa  255  8e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  41.25 
 
 
321 aa  252  6e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  39.53 
 
 
330 aa  251  1e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  39.33 
 
 
330 aa  250  2e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  41.08 
 
 
339 aa  249  5e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  37.83 
 
 
356 aa  249  5e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  41.61 
 
 
339 aa  247  2e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  39.4 
 
 
335 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  39.61 
 
 
345 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  39.61 
 
 
345 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  38.58 
 
 
331 aa  243  3e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  38.27 
 
 
331 aa  241  7.999999999999999e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  39.73 
 
 
335 aa  241  9e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  40.76 
 
 
331 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  40.58 
 
 
333 aa  241  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  39.87 
 
 
322 aa  241  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  42.11 
 
 
333 aa  240  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  37.54 
 
 
336 aa  240  2.9999999999999997e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  41.72 
 
 
304 aa  239  2.9999999999999997e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  39.31 
 
 
325 aa  239  4e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  39.74 
 
 
328 aa  239  5.999999999999999e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3798  hypothetical protein  40.37 
 
 
326 aa  238  6.999999999999999e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.226331  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  35.89 
 
 
325 aa  238  8e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  38.6 
 
 
336 aa  238  9e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  40.06 
 
 
328 aa  238  1e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  38.49 
 
 
333 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  37.42 
 
 
332 aa  238  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  39.74 
 
 
339 aa  237  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  39.29 
 
 
360 aa  237  2e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  38.76 
 
 
332 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0522  hypothetical protein  39.66 
 
 
324 aa  237  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1726  hypothetical protein  39.94 
 
 
337 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.183123  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  39.06 
 
 
328 aa  237  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0208  hypothetical protein  38.98 
 
 
335 aa  236  6e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  41.67 
 
 
325 aa  235  6e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4271  hypothetical protein  38.34 
 
 
339 aa  235  7e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  41.67 
 
 
327 aa  235  8e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  35.88 
 
 
330 aa  235  9e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4970  hypothetical protein  38.75 
 
 
321 aa  234  1.0000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  39.94 
 
 
338 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  37.83 
 
 
325 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  41.29 
 
 
323 aa  232  5e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5968  hypothetical protein  40.57 
 
 
344 aa  232  8.000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  39.87 
 
 
325 aa  232  8.000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  37.54 
 
 
328 aa  231  9e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  36.81 
 
 
335 aa  231  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2828  hypothetical protein  39.13 
 
 
328 aa  230  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.384643  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  37.21 
 
 
328 aa  230  2e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  38.94 
 
 
333 aa  231  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5153  extra-cytoplasmic solute receptor  39.37 
 
 
329 aa  230  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.415379 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  37.92 
 
 
338 aa  229  4e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  37.38 
 
 
349 aa  229  4e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0125  hypothetical protein  38.8 
 
 
332 aa  229  5e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  39.5 
 
 
326 aa  229  6e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  38.83 
 
 
336 aa  229  6e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  38.65 
 
 
358 aa  228  7e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  40.6 
 
 
323 aa  228  9e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  36 
 
 
322 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  38.23 
 
 
327 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  38.93 
 
 
335 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  41.14 
 
 
321 aa  228  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  40 
 
 
322 aa  228  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  37.67 
 
 
330 aa  227  2e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  38.41 
 
 
334 aa  227  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  37.46 
 
 
324 aa  227  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  39.6 
 
 
324 aa  227  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  37.04 
 
 
327 aa  227  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3987  hypothetical protein  37.05 
 
 
334 aa  227  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.700334  normal  0.0774583 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  38.46 
 
 
324 aa  227  2e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  41.03 
 
 
318 aa  227  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  40.33 
 
 
323 aa  227  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  37.34 
 
 
348 aa  227  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  37.67 
 
 
330 aa  227  2e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3124  hypothetical protein  42.05 
 
 
340 aa  227  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.65371  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  38.59 
 
 
322 aa  226  3e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  38.8 
 
 
331 aa  227  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3537  hypothetical protein  36.89 
 
 
322 aa  226  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  39.32 
 
 
322 aa  226  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2114  hypothetical protein  44.75 
 
 
325 aa  226  3e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00328294 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  39.74 
 
 
314 aa  226  4e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4631  hypothetical protein  36.79 
 
 
325 aa  226  5.0000000000000005e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4444  extra-cytoplasmic solute receptor  40.39 
 
 
323 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.402017 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3913  extra-cytoplasmic solute receptor  38.75 
 
 
332 aa  226  6e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.107287  normal  0.463561 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3347  hypothetical protein  38.67 
 
 
330 aa  225  6e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.261888  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1904  hypothetical protein  39.13 
 
 
326 aa  226  6e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  36.65 
 
 
325 aa  225  7e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  38 
 
 
324 aa  225  7e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0795  hypothetical protein  37.5 
 
 
346 aa  225  7e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  40.6 
 
 
322 aa  225  8e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  39.33 
 
 
327 aa  225  8e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  38.46 
 
 
328 aa  224  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1197  hypothetical protein  41.39 
 
 
324 aa  224  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  39.53 
 
 
335 aa  224  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  37.12 
 
 
332 aa  225  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2142  hypothetical protein  39.31 
 
 
332 aa  224  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.980907  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  37.8 
 
 
344 aa  224  1e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3086  hypothetical protein  39.12 
 
 
332 aa  224  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  38.66 
 
 
326 aa  225  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2249  hypothetical protein  37 
 
 
325 aa  223  3e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.570594 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>