243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0060 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0060  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  100 
 
 
311 aa  621  1e-177  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2410  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  82.96 
 
 
310 aa  497  1e-140  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.372916 
 
 
-
 
NC_004310  BR1342  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  70.07 
 
 
309 aa  402  1e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1831  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  69.12 
 
 
309 aa  401  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4849  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  56.13 
 
 
317 aa  342  4e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0999053  normal  0.0394517 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1691  sugar ABC transporter  53.69 
 
 
304 aa  311  1e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0126828  normal  0.746229 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2690  sugar ABC transporter  53.68 
 
 
341 aa  302  6.000000000000001e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2409  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  52.84 
 
 
314 aa  278  9e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1721  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  43.71 
 
 
329 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.525383  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1711  sugar ABC transporter periplasmic component-like protein  46.39 
 
 
324 aa  224  1e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1590  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  41.61 
 
 
319 aa  224  2e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4035  sugar ABC transporter  45.58 
 
 
327 aa  221  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0387168  normal  0.03522 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1724  twin-arginine translocation pathway signal  37.19 
 
 
337 aa  204  2e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1274  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.89 
 
 
325 aa  204  2e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.031802  normal  0.351389 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3343  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.1 
 
 
316 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  unclonable  0.000000000331055  normal  0.275562 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1425  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.04 
 
 
316 aa  198  1.0000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  unclonable  0.00000000184688  normal  0.493371 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6851  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  39.45 
 
 
335 aa  191  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.200483  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6778  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  34.55 
 
 
347 aa  178  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.158372 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4054  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  37.37 
 
 
333 aa  173  2.9999999999999996e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.86065 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0916  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  35.62 
 
 
349 aa  169  5e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.989133  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1834  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  35.62 
 
 
349 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0433  carbohydrate ABC transporter periplasmic sugar-binding protein  35.62 
 
 
349 aa  169  5e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0336223  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1658  carbohydrate ABC transporter periplasmic sugar-binding protein  35.62 
 
 
349 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.952286  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0729  carbohydrate ABC transporter periplasmic sugar-binding protein  35.62 
 
 
349 aa  169  5e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.691367  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1447  carbohydrate ABC transporter periplasmic sugar-binding protein  35.62 
 
 
370 aa  169  6e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.476916  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1680  carbohydrate ABC transporter periplasmic sugar-binding protein  35.62 
 
 
370 aa  169  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.824085  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2644  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  35.29 
 
 
349 aa  169  7e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0801718  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2806  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  35.74 
 
 
348 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0779562  normal  0.469954 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1806  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.81 
 
 
333 aa  165  8e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.599386 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3602  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.21 
 
 
345 aa  165  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.786544  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1329  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  35.74 
 
 
348 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0656  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  37.09 
 
 
326 aa  162  6e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2427  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  36.24 
 
 
351 aa  161  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.436825 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1597  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  35.12 
 
 
351 aa  161  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2318  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  34.72 
 
 
320 aa  159  4e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4615  secreted solute binding protein  37.23 
 
 
335 aa  159  7e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2471  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.54 
 
 
331 aa  157  2e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.105701  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0830  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.54 
 
 
314 aa  156  4e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.84032  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0113  putative ABC-type sugar transport system  35.89 
 
 
331 aa  154  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4011  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.69 
 
 
328 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.131793  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2772  putative ABC transporter substrate-binding protein  34.31 
 
 
358 aa  150  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2605  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.32 
 
 
328 aa  150  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1208  sugar binding protein of ABC transporter  33.33 
 
 
320 aa  150  3e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0308996  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1358  putative ABC transporter substrate-binding protein  36.39 
 
 
337 aa  149  5e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4537  sugar ABC transporter  33.1 
 
 
337 aa  146  6e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4492  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.67 
 
 
354 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122435  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0045  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.79 
 
 
327 aa  127  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.765358  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1643  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.09 
 
 
338 aa  103  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00121645  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0833  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.79 
 
 
323 aa  99.4  7e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0810  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.79 
 
 
323 aa  99.4  7e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.869205  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2902  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.02 
 
 
349 aa  88.2  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4006  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  28.73 
 
 
327 aa  80.5  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.82922 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0916  putative simple sugar transport system substrate-binding protein  30.98 
 
 
331 aa  80.5  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3294  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.71 
 
 
318 aa  78.2  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5835  putative ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  25.23 
 
 
324 aa  75.9  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3971  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.57 
 
 
350 aa  75.1  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.182523  normal  0.0264597 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5241  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.37 
 
 
316 aa  72.8  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.635479 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2264  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.24 
 
 
345 aa  72.4  0.000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000366985  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2603  twin-arginine translocation pathway signal  24.88 
 
 
338 aa  69.3  0.00000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.912871  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0973  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.84 
 
 
343 aa  69.3  0.00000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000623082  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1890  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.37 
 
 
351 aa  68.6  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1600  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.72 
 
 
342 aa  68.2  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3714  sugar-binding protein, putative  27.08 
 
 
336 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0877  sugar-binding protein, putative  28.12 
 
 
336 aa  67  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.222726 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09540  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.37 
 
 
320 aa  67.4  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0566218  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3533  sugar-binding protein, putative  28.18 
 
 
336 aa  65.5  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3158  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  22.39 
 
 
337 aa  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3307  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.03 
 
 
337 aa  65.1  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0550  hypothetical protein  22.71 
 
 
364 aa  64.3  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0452037  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2717  putative sugar (D-ribose) ABC transporter (periplasmic binding protein)  33.11 
 
 
311 aa  64.3  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.903227  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0222  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.58 
 
 
324 aa  63.9  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4136  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.3 
 
 
322 aa  63.5  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0393  sugar ABC transporter (sugar-binding protein)  25.93 
 
 
321 aa  63.5  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0916  putative periplasmic binding ABC transporter protein  27.66 
 
 
340 aa  63.9  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1611  sugar-binding protein, putative  27.89 
 
 
336 aa  63.2  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.677108  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2251  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.57 
 
 
320 aa  63.2  0.000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3102  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.57 
 
 
326 aa  62.4  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.75738  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3345  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.71 
 
 
313 aa  61.6  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.341454  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5595  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.42 
 
 
313 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2767  transcriptional regulator, LacI family  26.33 
 
 
347 aa  61.6  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.948388  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2906  Monosaccharide-transporting ATPase  26.43 
 
 
308 aa  60.5  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0655902 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19860  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.11 
 
 
318 aa  59.7  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1940  sugar-binding protein, putative  27.67 
 
 
334 aa  59.3  0.00000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2602  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.78 
 
 
363 aa  59.3  0.00000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3330  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.96 
 
 
313 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.740967  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5037  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.96 
 
 
313 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.680261  normal  0.889502 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6343  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.52 
 
 
319 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0293175  normal  0.309769 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7477  sugar ABC transporter  26.45 
 
 
345 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1668  ABC transporter sugar-binding protein  32.81 
 
 
331 aa  58.2  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1984  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.14 
 
 
348 aa  57.4  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3327  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.44 
 
 
321 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.888575  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0354  putative simple sugar transport system substrate-binding protein  26.5 
 
 
357 aa  57.4  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0988695 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5247  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.09 
 
 
313 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.949354 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2490  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.26 
 
 
340 aa  57  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1132  putative solute-binding component of ABC transporter  30.63 
 
 
334 aa  57  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0041819  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0844  hypothetical protein  26.69 
 
 
336 aa  57  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.655414  normal  0.0599894 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5320  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.43 
 
 
315 aa  57  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.940655  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4347  ribose ABC transporter, substrate binding protein  28.05 
 
 
340 aa  56.6  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1150  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.1 
 
 
359 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0166  monosaccharide-transporting ATPase  28 
 
 
307 aa  56.2  0.0000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>