174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2602 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_2602  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  100 
 
 
363 aa  746    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1150  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  69.86 
 
 
359 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6225  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  67.67 
 
 
362 aa  471  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0844  hypothetical protein  70.65 
 
 
336 aa  432  1e-120  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.655414  normal  0.0599894 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0550  hypothetical protein  61.11 
 
 
364 aa  393  1e-108  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0452037  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5835  putative ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  30.39 
 
 
324 aa  118  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1208  sugar binding protein of ABC transporter  27.08 
 
 
320 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0308996  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0916  putative simple sugar transport system substrate-binding protein  29.14 
 
 
331 aa  106  6e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0438  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.56 
 
 
331 aa  106  7e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.681459  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1721  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.01 
 
 
329 aa  96.3  8e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.525383  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1342  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  26.99 
 
 
309 aa  94.4  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5241  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.21 
 
 
316 aa  94  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.635479 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0393  sugar ABC transporter (sugar-binding protein)  25.61 
 
 
321 aa  93.6  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2690  sugar ABC transporter  27.82 
 
 
341 aa  92  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1831  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.08 
 
 
309 aa  91.7  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1890  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.44 
 
 
351 aa  90.1  6e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0916  putative periplasmic binding ABC transporter protein  28.67 
 
 
340 aa  89.4  9e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1668  ABC transporter sugar-binding protein  26.87 
 
 
331 aa  88.2  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2902  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.06 
 
 
349 aa  87.4  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3158  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.36 
 
 
337 aa  87  5e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3307  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.84 
 
 
337 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0810  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.8 
 
 
323 aa  85.1  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.869205  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0833  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.8 
 
 
323 aa  85.1  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1794  monosaccharide-transporting ATPase  28.42 
 
 
295 aa  81.3  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.37883  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1643  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.97 
 
 
338 aa  81.6  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00121645  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2264  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.85 
 
 
345 aa  81.3  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000366985  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1590  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  22.48 
 
 
319 aa  80.1  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1425  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.48 
 
 
316 aa  79  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  unclonable  0.00000000184688  normal  0.493371 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5154  putative ABC transporter periplasmic sugar-binding protein  26.76 
 
 
342 aa  79.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0997977  normal  0.778027 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2717  putative sugar (D-ribose) ABC transporter (periplasmic binding protein)  27.04 
 
 
311 aa  78.6  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.903227  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4615  secreted solute binding protein  28.23 
 
 
335 aa  77  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1601  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.78 
 
 
345 aa  77  0.0000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.101113  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4006  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  26.2 
 
 
327 aa  76.6  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.82922 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3602  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.67 
 
 
345 aa  75.9  0.0000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.786544  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1274  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.89 
 
 
325 aa  75.9  0.0000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.031802  normal  0.351389 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5339  ABC transporter substrate binding protein (ribose)  24.74 
 
 
329 aa  75.9  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2318  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  30.18 
 
 
320 aa  75.1  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19860  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.57 
 
 
318 aa  74.7  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6778  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  26.03 
 
 
347 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.158372 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1358  putative ABC transporter substrate-binding protein  27.02 
 
 
337 aa  74.3  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4054  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.19 
 
 
333 aa  74.3  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.86065 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5744  putative ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  30.15 
 
 
323 aa  73.9  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3072  putative ABC transporter periplasmic sugar-binding protein  26.06 
 
 
343 aa  73.9  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00067059  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1711  sugar ABC transporter periplasmic component-like protein  24.2 
 
 
324 aa  73.6  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3603  putative ABC transporter periplasmic sugar-binding protein  25.65 
 
 
342 aa  73.2  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4011  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.42 
 
 
328 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.131793  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1691  sugar ABC transporter  23.91 
 
 
304 aa  72  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0126828  normal  0.746229 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2605  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.42 
 
 
328 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0923  monosaccharide-transporting ATPase  28.83 
 
 
289 aa  71.2  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0222  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.67 
 
 
324 aa  70.9  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0973  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.32 
 
 
343 aa  71.2  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000623082  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4035  sugar ABC transporter  23.63 
 
 
327 aa  70.5  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0387168  normal  0.03522 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2603  twin-arginine translocation pathway signal  26.33 
 
 
338 aa  70.1  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.912871  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4991  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.52 
 
 
385 aa  70.5  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.575468  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0354  putative simple sugar transport system substrate-binding protein  26.74 
 
 
357 aa  70.5  0.00000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0988695 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1365  ribose ABC transporter, periplasmic binding protein  27.15 
 
 
312 aa  69.7  0.00000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1806  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.8 
 
 
333 aa  69.7  0.00000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.599386 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1724  twin-arginine translocation pathway signal  23.95 
 
 
337 aa  69.3  0.00000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4849  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.47 
 
 
317 aa  69.3  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0999053  normal  0.0394517 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3343  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.89 
 
 
316 aa  68.2  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  unclonable  0.000000000331055  normal  0.275562 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0948  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.02 
 
 
311 aa  68.6  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09540  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.31 
 
 
320 aa  68.2  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0566218  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6851  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.64 
 
 
335 aa  67.8  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.200483  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0113  putative ABC-type sugar transport system  24.5 
 
 
331 aa  67.4  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0045  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.59 
 
 
327 aa  66.2  0.0000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.765358  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3277  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.2 
 
 
310 aa  65.9  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0377359  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1187  sugar ABC transporter (sugar-binding protein)  22.05 
 
 
337 aa  65.1  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.287912  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3430  ABC transporter binding protein  27.4 
 
 
316 aa  65.1  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0397056  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0767  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25.31 
 
 
312 aa  64.3  0.000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000000173406  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0656  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.7 
 
 
326 aa  64.3  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3087  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.64 
 
 
343 aa  62.8  0.000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.154884  normal  0.401469 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2409  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.72 
 
 
314 aa  62.4  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4492  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.57 
 
 
354 aa  62.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122435  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3971  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.74 
 
 
350 aa  61.2  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.182523  normal  0.0264597 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1984  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.26 
 
 
348 aa  60.8  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2772  putative ABC transporter substrate-binding protein  23.71 
 
 
358 aa  61.2  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3320  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.56 
 
 
311 aa  60.5  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.478639 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1618  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.59 
 
 
316 aa  60.1  0.00000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2410  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.47 
 
 
310 aa  59.7  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.372916 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1366  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.68 
 
 
329 aa  59.7  0.00000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.450849  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0373  sugar ABC transporter  24.73 
 
 
346 aa  59.7  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0060  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.78 
 
 
311 aa  59.3  0.00000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1272  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.71 
 
 
330 aa  59.3  0.00000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.269718  normal  0.414933 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4537  sugar ABC transporter  26.14 
 
 
337 aa  58.2  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1060  LacI family transcription regulator  30.56 
 
 
352 aa  58.2  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.234055  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1110  transcriptional regulator, periplasmic binding protein of LacI family protein  24.01 
 
 
334 aa  57  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.963711  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9127  sugar ABC transporter (sugar-binding protein)  25.79 
 
 
371 aa  57  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.392658  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1681  putative secreted solute-binding lipoprotein  23.83 
 
 
344 aa  55.8  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.156663  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_54411  predicted protein  25.75 
 
 
626 aa  55.8  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0187117  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1611  sugar-binding protein, putative  30 
 
 
336 aa  55.1  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.677108  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0778  ribose ABC transporter periplasmic-binding protein  27.64 
 
 
353 aa  54.7  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.481404  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2427  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  23.77 
 
 
351 aa  54.3  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.436825 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3533  sugar-binding protein, putative  30.34 
 
 
336 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4704  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  26.19 
 
 
382 aa  53.9  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.51682  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3714  sugar-binding protein, putative  29.52 
 
 
336 aa  53.5  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0830  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.91 
 
 
314 aa  53.5  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.84032  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3328  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.81 
 
 
311 aa  52.4  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2413  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.84 
 
 
347 aa  52.8  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.50663 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7477  sugar ABC transporter  23.65 
 
 
345 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2685  Monosaccharide-transporting ATPase  24.07 
 
 
306 aa  51.2  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.450778  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>