147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_0729 on replicon NC_009080
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA0916  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  100 
 
 
349 aa  715    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.989133  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1834  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  100 
 
 
349 aa  715    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1447  carbohydrate ABC transporter periplasmic sugar-binding protein  100 
 
 
370 aa  716    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.476916  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0433  carbohydrate ABC transporter periplasmic sugar-binding protein  100 
 
 
349 aa  715    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0336223  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1658  carbohydrate ABC transporter periplasmic sugar-binding protein  100 
 
 
349 aa  715    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.952286  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1680  carbohydrate ABC transporter periplasmic sugar-binding protein  99.71 
 
 
370 aa  714    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.824085  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0729  carbohydrate ABC transporter periplasmic sugar-binding protein  100 
 
 
349 aa  715    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.691367  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2644  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  97.99 
 
 
349 aa  626  1e-178  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0801718  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1329  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  84.24 
 
 
348 aa  577  1e-164  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2806  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  84.53 
 
 
348 aa  580  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0779562  normal  0.469954 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1597  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  80.63 
 
 
351 aa  546  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2427  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  77.27 
 
 
351 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.436825 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6778  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  56.1 
 
 
347 aa  396  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.158372 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1590  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  50.59 
 
 
319 aa  359  3e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1425  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  49.53 
 
 
316 aa  323  2e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  unclonable  0.00000000184688  normal  0.493371 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3343  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  48.43 
 
 
316 aa  323  3e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  unclonable  0.000000000331055  normal  0.275562 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1274  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  48.41 
 
 
325 aa  316  4e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.031802  normal  0.351389 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1711  sugar ABC transporter periplasmic component-like protein  36.01 
 
 
324 aa  208  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2690  sugar ABC transporter  32.96 
 
 
341 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4035  sugar ABC transporter  34.87 
 
 
327 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0387168  normal  0.03522 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1721  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.95 
 
 
329 aa  189  8e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.525383  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1691  sugar ABC transporter  34.19 
 
 
304 aa  184  2.0000000000000003e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0126828  normal  0.746229 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0060  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.71 
 
 
311 aa  183  4.0000000000000006e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1342  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  36.62 
 
 
309 aa  181  1e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2410  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.46 
 
 
310 aa  178  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.372916 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1831  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.92 
 
 
309 aa  175  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4849  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.98 
 
 
317 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0999053  normal  0.0394517 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6851  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.61 
 
 
335 aa  171  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.200483  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1724  twin-arginine translocation pathway signal  31.41 
 
 
337 aa  159  5e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2471  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.66 
 
 
331 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.105701  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4054  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.25 
 
 
333 aa  144  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.86065 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2409  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.49 
 
 
314 aa  142  7e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1806  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.66 
 
 
333 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.599386 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0830  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.08 
 
 
314 aa  135  8e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.84032  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0113  putative ABC-type sugar transport system  31.82 
 
 
331 aa  131  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0656  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.48 
 
 
326 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4615  secreted solute binding protein  28.7 
 
 
335 aa  130  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1208  sugar binding protein of ABC transporter  29.01 
 
 
320 aa  129  6e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0308996  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2318  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  29.19 
 
 
320 aa  125  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4537  sugar ABC transporter  33.46 
 
 
337 aa  122  7e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4011  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.52 
 
 
328 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.131793  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1358  putative ABC transporter substrate-binding protein  27.33 
 
 
337 aa  120  4.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2605  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.21 
 
 
328 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3602  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.97 
 
 
345 aa  116  5e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.786544  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4492  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.39 
 
 
354 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122435  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2772  putative ABC transporter substrate-binding protein  30 
 
 
358 aa  109  6e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5241  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.99 
 
 
316 aa  91.7  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.635479 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0810  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25 
 
 
323 aa  81.6  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.869205  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0833  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25 
 
 
323 aa  81.6  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0916  putative simple sugar transport system substrate-binding protein  27.42 
 
 
331 aa  81.3  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5835  putative ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  23.45 
 
 
324 aa  80.5  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3307  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.07 
 
 
337 aa  79.7  0.00000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0045  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.8 
 
 
327 aa  77.8  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.765358  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1643  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.6 
 
 
338 aa  74.7  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00121645  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3158  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.65 
 
 
337 aa  73.6  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2264  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.68 
 
 
345 aa  69.3  0.00000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000366985  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1890  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.38 
 
 
351 aa  67  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0008  D-ribose transporter subunit RbsB  23.29 
 
 
294 aa  61.2  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09540  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.51 
 
 
320 aa  60.8  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0566218  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3294  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  21.91 
 
 
318 aa  60.8  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2009  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  20.13 
 
 
325 aa  60.5  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0550  hypothetical protein  20.22 
 
 
364 aa  60.1  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0452037  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3430  ABC transporter binding protein  24.62 
 
 
316 aa  59.3  0.00000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0397056  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0166  monosaccharide-transporting ATPase  26.43 
 
 
307 aa  59.3  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1150  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  22.48 
 
 
359 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000339  ribose ABC transport system ribose-binding protein RbsB  23.66 
 
 
292 aa  58.5  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2602  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  20.59 
 
 
363 aa  58.2  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1226  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.59 
 
 
315 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.805886  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1252  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.59 
 
 
315 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2685  Monosaccharide-transporting ATPase  22.22 
 
 
306 aa  57  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.450778  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0686  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.24 
 
 
307 aa  57  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4167  D-ribose transporter subunit RbsB  26.2 
 
 
296 aa  56.6  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4217  D-ribose transporter subunit RbsB  26.2 
 
 
296 aa  56.6  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.730139  normal  0.765182 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4096  D-ribose transporter subunit RbsB  26.2 
 
 
296 aa  56.6  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4111  D-ribose transporter subunit RbsB  26.2 
 
 
296 aa  56.6  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.817672  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06143  D-ribose transporter subunit RbsB  25.11 
 
 
292 aa  55.8  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5133  ABC transporter substrate binding protein (ribose)  22.65 
 
 
313 aa  55.5  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.533317  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4276  D-ribose transporter subunit RbsB  26.2 
 
 
296 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0343  D-ribose transporter subunit RbsB  22.36 
 
 
292 aa  55.5  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4188  regulatory protein, LacI  23.81 
 
 
332 aa  54.7  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.615532  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1853  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.61 
 
 
339 aa  55.5  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6343  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.56 
 
 
319 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0293175  normal  0.309769 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5473  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  22.93 
 
 
315 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.433436  normal  0.94425 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4704  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  23.53 
 
 
382 aa  54.7  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.51682  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1060  LacI family transcription regulator  21.66 
 
 
352 aa  53.9  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.234055  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0973  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  22.49 
 
 
343 aa  53.5  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000623082  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03637  D-ribose transporter subunit  25.46 
 
 
296 aa  53.1  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00458293  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03582  hypothetical protein  25.46 
 
 
296 aa  53.1  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00518541  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3967  D-ribose transporter subunit RbsB  25.46 
 
 
294 aa  53.1  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.56483  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4267  D-ribose transporter subunit RbsB  25.46 
 
 
294 aa  53.1  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00505283  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4243  D-ribose transporter subunit RbsB  25.46 
 
 
296 aa  53.1  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00260164 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4119  D-ribose transporter subunit RbsB  25.46 
 
 
296 aa  53.1  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.161287 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5187  D-ribose transporter subunit RbsB  25.46 
 
 
296 aa  53.1  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0574953  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6472  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  22.22 
 
 
315 aa  53.1  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.555546  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6707  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  22.22 
 
 
315 aa  53.1  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.2634  normal  0.288503 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6313  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  22.22 
 
 
315 aa  53.1  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.330305 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1369  D-ribose transporter subunit RbsB  22.27 
 
 
292 aa  52.8  0.000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.470278  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4235  D-ribose transporter subunit RbsB  25.51 
 
 
295 aa  52.4  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000930744  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3345  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.41 
 
 
313 aa  52.4  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.341454  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4898  D-ribose transporter subunit RbsB  25.11 
 
 
296 aa  52.4  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00612951  hitchhiker  0.000000869292 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>