More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5726 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5726  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 286 aa  577  1e-164  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3415  AraC family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 266 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4452  AraC family transcriptional regulator  41.15 
 
 		 275 aa  179  7e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.686924 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3802  AraC family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 264 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00614706 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4183  AraC family transcriptional regulator  44.11 
 
 		 264 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.928352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4705  AraC family transcriptional regulator  44.49 
 
 		 264 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.974796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5480  AraC family transcriptional regulator  43.73 
 
 		 264 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280485 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3564  AraC family transcriptional regulator  43.73 
 
 		 264 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.682974  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4803  AraC family transcriptional regulator  43.73 
 
 		 264 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0040  transcriptional regulator, AraC family  38.81 
 
 		 268 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.451948  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4209  transcriptional regulator, AraC family  41.83 
 
 		 275 aa  161  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0776695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0007  AraC family transcriptional regulator  40.29 
 
 		 272 aa  161  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4319  transcriptional regulator, AraC family  41.83 
 
 		 259 aa  161  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.15706 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3066  AraC family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 275 aa  159  6e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.324544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2371  AraC family transcriptional regulator  42.21 
 
 		 263 aa  158  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0360277  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2692  transcriptional regulator, AraC family  38.71 
 
 		 268 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3557  AraC family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 269 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4288  transcriptional regulator, AraC family  43.51 
 
 		 273 aa  155  7e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.170174 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0901  AraC family transcriptional regulator  43.35 
 
 		 264 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2007  AraC family transcriptional regulator  43.46 
 
 		 266 aa  152  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2143  AraC family transcriptional regulator  43.46 
 
 		 266 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0635753  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2950  transcriptional regulator, AraC family  37.14 
 
 		 268 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0105763  normal  0.912836 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1126  AraC family transcriptional regulator  43.46 
 
 		 266 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.209854  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0931  AraC family transcriptional regulator  43.46 
 
 		 266 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.846737  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1568  AraC family transcriptional regulator  43.46 
 
 		 266 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0287073  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0228  AraC family transcriptional regulator  43.46 
 
 		 266 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1986  AraC family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 266 aa  149  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01763  transcription regulator protein  38.52 
 
 		 274 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.246898 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0321  transcriptional regulator, AraC family  41.24 
 
 		 264 aa  146  5e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141392  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0617  AraC family transcriptional regulator  40.77 
 
 		 273 aa  142  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0294699 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1357  transcriptional regulator, AraC family  35.69 
 
 		 277 aa  122  7e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0918  transcriptional regulator, AraC family  35.57 
 
 		 283 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.473523  normal  0.595819 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05420  putative transcriptional regulator  35.82 
 
 		 264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1509  transcriptional regulator AraC family  33.07 
 
 		 284 aa  116  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2537  AraC family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 312 aa  117  3e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1895  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 277 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2383  AraC family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 281 aa  116  6e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.499508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3312  AraC family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 281 aa  116  6e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.403912 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0516  putative transcriptional regulator  35.91 
 
 		 264 aa  115  6e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001441  L-rhamnose operon transcriptional activator RhaR  30.47 
 
 		 275 aa  115  8.999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21720  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0805  AraC family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 275 aa  114  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000161693  normal  0.19096 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2781  transcriptional regulator, AraC family  33.07 
 
 		 271 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.109963 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1852  putative transcriptional regulator  33.72 
 
 		 284 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0479  AraC family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 279 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109362 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1989  AraC family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 277 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.753386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1568  AraC family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 278 aa  112  5e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2300  AraC family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 274 aa  112  6e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.457981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1562  AraC family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1599  AraC family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000366861  normal  0.399443 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1472  transcriptional regulator, AraC family  33.98 
 
 		 269 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.462639  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2527  AraC family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1551  transcriptional regulator, AraC family  29.69 
 
 		 281 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06279  hypothetical protein  30.62 
 
 		 275 aa  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1762  AraC/XylS family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1047  transcriptional regulator, AraC family  32.4 
 
 		 273 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5342  AraC family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 276 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.975436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1460  AraC family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2442  AraC family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0043  AraC family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2911  transcriptional regulator, AraC family  29.3 
 
 		 277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2594  AraC family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 278 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26330  AraC family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643276  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1137  transcriptional regulator, AraC family  32.03 
 
 		 270 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2237  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1463  AraC family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 279 aa  110  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0731  AraC family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 285 aa  109  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0743378  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2693  AraC family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 278 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2935  transcriptional regulator, AraC family  33.2 
 
 		 276 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000465121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3138  AraC family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.606385 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1383  AraC family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 290 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.108127  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0954  AraC family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 290 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.809333  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0977  AraC family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000786642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2165  AraC family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 277 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2795  AraC family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 275 aa  107  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0973  AraC family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000577914  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0342  transcriptional regulatory protein  31.4 
 
 		 432 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606755  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1878  AraC family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 432 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0305888  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1049  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 276 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000110999  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3327  AraC family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 279 aa  107  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.414693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0424  AraC family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 432 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1793  AraC family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 432 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0220  AraC family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 432 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.15358  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1477  transcriptional regulator, AraC family  32.41 
 
 		 278 aa  106  4e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000537918  unclonable  0.00000296813 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4315  AraC family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 270 aa  106  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.627035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2719  AraC family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 276 aa  106  5e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.894112  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1262  AraC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 290 aa  106  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1906  AraC family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 308 aa  106  5e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2453  AraC family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 279 aa  105  8e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.00000000000537916  normal  0.591211 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2399  transcriptional regulator, AraC family  32.71 
 
 		 277 aa  105  8e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2206  AraC family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 303 aa  104  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000287978  normal  0.709471 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1757  transcriptional regulator, AraC family  24.8 
 
 		 278 aa  103  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000137432  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2552  transcriptional regulator, AraC family  32.13 
 
 		 288 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.974489  normal  0.68822 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1801  AraC family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 278 aa  102  6e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2287  transcriptional regulator, AraC family  28.79 
 
 		 300 aa  102  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3801  transcriptional regulator, AraC family  30.71 
 
 		 278 aa  102  8e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2749  putative transcriptional regulator  31.87 
 
 		 271 aa  102  8e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0766  AraC/XylS family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 273 aa  100  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1688  AraC family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 280 aa  99.8  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6409  AraC family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 258 aa  99.8  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.586073  normal  0.525784 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>