More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5309 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5309  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 353 aa  704    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.203818  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2063  iron-containing alcohol dehydrogenase  68.09 
 
 		 352 aa  474  1e-133  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00184979  normal  0.72371 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0837  iron-containing alcohol dehydrogenase  65.9 
 
 		 356 aa  459  9.999999999999999e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4129  Iron-containing alcohol dehydrogenase  65.81 
 
 		 357 aa  456  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.323723  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3335  iron-containing alcohol dehydrogenase  65.24 
 
 		 358 aa  454  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.330592  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4484  Iron-containing alcohol dehydrogenase  66.19 
 
 		 355 aa  449  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3908  iron-containing alcohol dehydrogenase  62.93 
 
 		 362 aa  446  1.0000000000000001e-124  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0347674 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1325  iron-containing alcohol dehydrogenase  66.09 
 
 		 355 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.397668 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1589  Iron-containing alcohol dehydrogenase  62.71 
 
 		 355 aa  436  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6132  iron-containing alcohol dehydrogenase  67.51 
 
 		 355 aa  430  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.980292  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2737  Iron-containing alcohol dehydrogenase  63.38 
 
 		 355 aa  428  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.413551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6061  iron-containing alcohol dehydrogenase  66.95 
 
 		 352 aa  427  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4611  iron-containing alcohol dehydrogenase  62.5 
 
 		 353 aa  423  1e-117  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.557195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3432  iron-containing alcohol dehydrogenase  61.97 
 
 		 355 aa  418  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6071  iron-containing alcohol dehydrogenase  60.28 
 
 		 355 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4694  Iron-containing alcohol dehydrogenase  63.82 
 
 		 352 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4085  iron-containing alcohol dehydrogenase  61.41 
 
 		 355 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0871083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5215  iron-containing alcohol dehydrogenase  62.25 
 
 		 355 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5063  maleylacetate reductase  60.17 
 
 		 355 aa  408  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0529248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3377  iron-containing alcohol dehydrogenase  61.41 
 
 		 355 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5623  iron-containing alcohol dehydrogenase  59.89 
 
 		 355 aa  395  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.19032 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1126  maleylacetate reductase  57.43 
 
 		 352 aa  388  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1418  iron-containing alcohol dehydrogenase  53.28 
 
 		 351 aa  381  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.93105 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3908  maleylacetate reductase  60.45 
 
 		 355 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4891  iron-containing alcohol dehydrogenase  54.29 
 
 		 356 aa  367  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.592699  normal  0.0411098 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05178  maleylacetate reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07090)  50.7 
 
 		 357 aa  360  2e-98  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.516162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7440  maleylacetate reductase  53.69 
 
 		 357 aa  357  1.9999999999999998e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6463  Iron-containing alcohol dehydrogenase  50.57 
 
 		 354 aa  351  1e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5727  iron-containing alcohol dehydrogenase  53.3 
 
 		 352 aa  351  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5062  iron-containing alcohol dehydrogenase  52.41 
 
 		 352 aa  347  2e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5540  iron-containing alcohol dehydrogenase  52.3 
 
 		 352 aa  342  4e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0827042  hitchhiker  0.0000079765 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1960  iron-containing alcohol dehydrogenase  58.12 
 
 		 355 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.929327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6471  Iron-containing alcohol dehydrogenase  51.13 
 
 		 359 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.312726  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4405  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.44 
 
 		 351 aa  291  2e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.162053  normal  0.536437 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4574  iron-containing alcohol dehydrogenase  47.7 
 
 		 354 aa  277  2e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.807648 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1936  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.02 
 
 		 358 aa  263  4e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4592  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.16 
 
 		 354 aa  253  4.0000000000000004e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4672  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.29 
 
 		 363 aa  250  2e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5825  homogentisate 1,2-dioxygenase  44.57 
 
 		 848 aa  250  3e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0876183  normal  0.90273 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4565  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.59 
 
 		 358 aa  237  2e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.573153 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4409  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.03 
 
 		 417 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.417322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5309  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.76 
 
 		 379 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2681  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.02 
 
 		 405 aa  125  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4699  Iron-containing alcohol dehydrogenase  30.24 
 
 		 380 aa  124  4e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1395  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.93 
 
 		 407 aa  121  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3267  alcetaldehyde dehydrogenase or NADPH-dependent butanol dehydrogenase  27.45 
 
 		 369 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1233  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.95 
 
 		 387 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1244  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.07 
 
 		 382 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2082  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.76 
 
 		 388 aa  119  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2430  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.67 
 
 		 384 aa  119  6e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.528301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.29 
 
 		 389 aa  119  6e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2455  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.79 
 
 		 392 aa  117  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  25.87 
 
 		 382 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  25.87 
 
 		 382 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1786  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.08 
 
 		 388 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2506  alcohol dehydrogenase, class IV  27.73 
 
 		 387 aa  117  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.75007e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1359  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.09 
 
 		 382 aa  117  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.759734  hitchhiker  0.000832338 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1851  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.9 
 
 		 383 aa  117  3e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05412  alcohol dehydrogenase  26.67 
 
 		 382 aa  115  8.999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4348  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.44 
 
 		 385 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.159902  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1258  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.39 
 
 		 382 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0709057 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2579  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.85 
 
 		 368 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0885  alcohol dehydrogenase, iron-containing  27.12 
 
 		 376 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1421  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.45 
 
 		 378 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001472  alcohol dehydrogenase  26.39 
 
 		 382 aa  114  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1756  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.03 
 
 		 377 aa  114  3e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0953887  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1321  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.43 
 
 		 382 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0521  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.7 
 
 		 383 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000118982 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1348  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.43 
 
 		 382 aa  113  5e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1495  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.32 
 
 		 393 aa  113  5e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102085  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2762  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.43 
 
 		 382 aa  113  5e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2840  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.43 
 
 		 382 aa  113  5e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2938  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.43 
 
 		 382 aa  113  6e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5121  Iron-containing alcohol dehydrogenase  27.23 
 
 		 382 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493266  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1490  alcohol dehydrogenase II  28.43 
 
 		 382 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1312  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.1 
 
 		 382 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1353  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.88 
 
 		 387 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.959336  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2344  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.1 
 
 		 432 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1481  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.81 
 
 		 382 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1180  1,3-propanediol dehydrogenase  28.49 
 
 		 385 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.440796  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1011  1,3-propanediol dehydrogenase  28.49 
 
 		 385 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000128902  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3038  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.1 
 
 		 382 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0219975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2510  1,3-propanediol dehydrogenase  30.56 
 
 		 383 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.4448e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1734  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.54 
 
 		 373 aa  111  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1051  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.31 
 
 		 340 aa  110  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0705172  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1046  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.07 
 
 		 382 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1166  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.4 
 
 		 382 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.134341 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2798  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.27 
 
 		 382 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1048  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.62 
 
 		 395 aa  110  5e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.155251  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2932  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.61 
 
 		 387 aa  110  5e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0199  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.04 
 
 		 393 aa  110  5e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07980  Iron-containing alcohol dehydrogenase  25.99 
 
 		 382 aa  109  7.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0904  Iron-containing alcohol dehydrogenase  29.29 
 
 		 386 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.445883  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4285  alcohol dehydrogenase II  26.19 
 
 		 382 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1788  alcohol dehydrogenase 2  26.43 
 
 		 381 aa  109  9.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1152  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.45 
 
 		 382 aa  108  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.305094  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1584  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.3 
 
 		 383 aa  108  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.140068  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2674  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.21 
 
 		 371 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000116662  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0321  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.33 
 
 		 393 aa  108  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.529761 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0825  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.58 
 
 		 393 aa  108  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.313783  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>