121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0427 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0427  putative outer membrane pore protein  100 
 
 		 340 aa  680    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06284  hypothetical protein  61.21 
 
 		 352 aa  403  1e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001437  non-specific porin  58.24 
 
 		 352 aa  387  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.524484  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000832  outer membrane protein C precursor  54.1 
 
 		 331 aa  330  2e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0331596  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0666  porin  51.02 
 
 		 324 aa  308  9e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00111405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06741  hypothetical protein  41.92 
 
 		 330 aa  241  1e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3669  porin  28.28 
 
 		 384 aa  104  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1515  porin  30.37 
 
 		 402 aa  104  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000337456  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0276  porin  28.03 
 
 		 384 aa  103  6e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3873  porin  28.03 
 
 		 384 aa  103  6e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0642035 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4173  porin  28.79 
 
 		 384 aa  98.6  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3977  porin Gram-negative type  28.79 
 
 		 384 aa  98.2  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4055  porin  28.79 
 
 		 384 aa  96.7  5e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4086  porin  28.35 
 
 		 384 aa  96.3  7e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0312  outer membrane porin, putative  27.27 
 
 		 384 aa  95.1  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1631  porin  28.09 
 
 		 403 aa  93.6  5e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000133613  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1620  porin  28.4 
 
 		 403 aa  93.2  6e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000207941  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3681  porin  27.95 
 
 		 384 aa  92.4  9e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1654  porin  28.09 
 
 		 403 aa  92  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000730706  normal  0.12603 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2723  porin Gram-negative type  27.78 
 
 		 403 aa  91.7  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000866519  hitchhiker  0.00000818773 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0680  porin  25.51 
 
 		 388 aa  89  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.424836  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3084  porin  27.52 
 
 		 402 aa  88.6  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000611786  decreased coverage  0.00000268212 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2628  porin  27.6 
 
 		 402 aa  85.9  9e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000106502  hitchhiker  0.00000892589 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2536  porin  27.27 
 
 		 402 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000566311  unclonable  0.0000300208 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1821  outer membrane porin, putative  26.19 
 
 		 398 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2468  porin  27.6 
 
 		 402 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000293387  hitchhiker  0.000118178 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2481  porin  25 
 
 		 403 aa  84  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000211873  hitchhiker  0.0000558993 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2283  porin  26.26 
 
 		 385 aa  82  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3603  porin  26.69 
 
 		 402 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000908733  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1251  outer membrane porin, putative  28.75 
 
 		 402 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000429036  hitchhiker  0.000137517 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2557  porin  26.46 
 
 		 402 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.40328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3366  porin  25.95 
 
 		 385 aa  79.3  0.00000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3060  outer membrane porin, putative  24.81 
 
 		 389 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1487  porin  24.81 
 
 		 389 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.911374 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2654  porin  24.72 
 
 		 403 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.157647  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3336  outer membrane porin, putative  26.18 
 
 		 384 aa  77  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04813  hypothetical protein  28.11 
 
 		 365 aa  77  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2229  porin  26.04 
 
 		 382 aa  77  0.0000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.218103  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2434  porin  25.13 
 
 		 389 aa  75.9  0.0000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.775403  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1568  porin  24.03 
 
 		 403 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000403403  hitchhiker  0.00000152354 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2839  porin  26.59 
 
 		 360 aa  63.2  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00468418 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1474  porin  27.38 
 
 		 311 aa  62.4  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.989546 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3366  porin Gram-negative type  24.59 
 
 		 351 aa  56.6  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0767  outer membrane phosphoporin protein E  23.3 
 
 		 350 aa  56.6  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0774266 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0295  outer membrane phosphoporin protein E  24.86 
 
 		 351 aa  56.6  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00372368 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0273  outer membrane phosphoporin protein E  24.59 
 
 		 351 aa  56.2  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.664027  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0640  porin  27.89 
 
 		 355 aa  56.2  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0286  outer membrane phosphoporin protein E  24.59 
 
 		 351 aa  56.2  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.172379  normal  0.530203 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1702  porin family protein  23.59 
 
 		 366 aa  56.2  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0189246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0238  outer membrane phosphoporin protein E  24.31 
 
 		 351 aa  56.2  0.0000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0268  outer membrane phosphoporin protein E  24.31 
 
 		 351 aa  55.8  0.0000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2083  gram-negative porin family protein  23.59 
 
 		 366 aa  56.2  0.0000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3752  porin  26.87 
 
 		 355 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000389124  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0635  outer membrane insertion C-terminal signal  26.87 
 
 		 355 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0351  outer membrane phosphoporin protein E  24.58 
 
 		 350 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3340  outer membrane phosphoporin protein E  24.59 
 
 		 351 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0360  outer membrane phosphoporin protein E  24.58 
 
 		 350 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0369  outer membrane phosphoporin protein E  24.58 
 
 		 350 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0354  outer membrane phosphoporin protein E  24.58 
 
 		 350 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.52263  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00238  outer membrane phosphoporin protein E  24.58 
 
 		 345 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.86907  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0613  porin  27.05 
 
 		 355 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00241  hypothetical protein  24.58 
 
 		 345 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.693331  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1641  outer membrane protein N  27.71 
 
 		 383 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.150346  normal  0.976453 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1979  outer membrane protein F  23.39 
 
 		 360 aa  53.9  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000261923  normal  0.629044 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05099  porin  24.23 
 
 		 321 aa  53.5  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2649  porin  23.39 
 
 		 360 aa  53.5  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000040387  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1679  porin  23.97 
 
 		 357 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.512961  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2197  outer membrane protein  24.07 
 
 		 357 aa  53.1  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000111535  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0361  outer membrane phosphoporin protein E  24.72 
 
 		 350 aa  52.8  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000741681 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002599  outer membrane protein OmpU  26.32 
 
 		 336 aa  52  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0233564  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2472  porin  31.78 
 
 		 358 aa  51.6  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0827968  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1968  porin  24.1 
 
 		 378 aa  51.2  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2057  porin  21.78 
 
 		 359 aa  51.6  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2115  outer membrane protein N  24.55 
 
 		 360 aa  51.6  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.829511  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2559  outer membrane protein F  23.38 
 
 		 360 aa  52  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000037634  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1806  outer membrane protein N  25 
 
 		 372 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0174534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2514  outer membrane protein N  24.55 
 
 		 360 aa  51.6  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.127891 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2224  porin  24.55 
 
 		 360 aa  51.6  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0575083  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1641  outer membrane protein N  25 
 
 		 372 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00375551  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1642  outer membrane protein N  25 
 
 		 372 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1701  outer membrane protein N  25 
 
 		 372 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1634  outer membrane protein N  25 
 
 		 372 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.952827  normal  0.939851 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1701  outer membrane protein N  28.14 
 
 		 388 aa  50.4  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.265921  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1582  outer membrane protein N  27.71 
 
 		 383 aa  50.4  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.640646  normal  0.720278 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001232  outer membrane protein OmpU  24.79 
 
 		 319 aa  49.7  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0870457  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1448  porin  26.09 
 
 		 368 aa  49.3  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0593743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1870  outer membrane protein N  27.71 
 
 		 383 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.098119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0824  outer membrane porin protein LC  22.38 
 
 		 360 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.166078  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1458  porin  25.99 
 
 		 365 aa  48.5  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1572  outer membrane protein N  24.44 
 
 		 380 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0737338 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3264  outer membrane porin protein C  25 
 
 		 370 aa  47  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00668257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1322  outer membrane protein C2  23.04 
 
 		 371 aa  47  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3847  porin  23.88 
 
 		 354 aa  47  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1589  outer membrane porin protein LC  22.77 
 
 		 333 aa  46.6  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.810656  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03408  hypothetical protein  25.37 
 
 		 337 aa  46.6  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1730  porin  23.47 
 
 		 369 aa  46.2  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00293132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0677  porin  25.91 
 
 		 350 aa  45.8  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.127595  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1770  outer membrane porin protein LC  22.7 
 
 		 362 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.895795 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1750  outer membrane porin protein LC  23.36 
 
 		 362 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.778273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1689  outer membrane porin protein LC  23.36 
 
 		 362 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.808726 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>