186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3366 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3060  outer membrane porin, putative  78.15 
 
 		 389 aa  642    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1487  porin  78.92 
 
 		 389 aa  645    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.911374 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2283  porin  85.19 
 
 		 385 aa  680    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3366  porin  100 
 
 		 385 aa  779    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2434  porin  75.06 
 
 		 389 aa  626  1e-178  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.775403  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3669  porin  68.31 
 
 		 384 aa  555  1e-157  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0276  porin  68.57 
 
 		 384 aa  556  1e-157  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3873  porin  68.57 
 
 		 384 aa  556  1e-157  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0642035 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0312  outer membrane porin, putative  67.27 
 
 		 384 aa  550  1e-155  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4086  porin  67.79 
 
 		 384 aa  549  1e-155  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3977  porin Gram-negative type  67.79 
 
 		 384 aa  549  1e-155  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3681  porin  67.27 
 
 		 384 aa  550  1e-155  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4055  porin  67.53 
 
 		 384 aa  547  1e-155  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4173  porin  67.53 
 
 		 384 aa  547  1e-154  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3336  outer membrane porin, putative  63.24 
 
 		 384 aa  486  1e-136  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3084  porin  37.32 
 
 		 402 aa  241  2e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000611786  decreased coverage  0.00000268212 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2557  porin  36.89 
 
 		 402 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.40328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2481  porin  35.77 
 
 		 403 aa  233  6e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000211873  hitchhiker  0.0000558993 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3603  porin  36.32 
 
 		 402 aa  232  9e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000908733  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1515  porin  35.35 
 
 		 402 aa  230  2e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000337456  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1568  porin  33.73 
 
 		 403 aa  230  3e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000403403  hitchhiker  0.00000152354 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2723  porin Gram-negative type  34.87 
 
 		 403 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000866519  hitchhiker  0.00000818773 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1620  porin  34.38 
 
 		 403 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000207941  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1631  porin  34.87 
 
 		 403 aa  222  7e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000133613  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1251  outer membrane porin, putative  35.35 
 
 		 402 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000429036  hitchhiker  0.000137517 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1654  porin  33.9 
 
 		 403 aa  220  3e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000730706  normal  0.12603 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2468  porin  34.78 
 
 		 402 aa  218  1e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000293387  hitchhiker  0.000118178 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1821  outer membrane porin, putative  34.55 
 
 		 398 aa  217  2e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2536  porin  34.78 
 
 		 402 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000566311  unclonable  0.0000300208 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2628  porin  34.78 
 
 		 402 aa  216  4e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000106502  hitchhiker  0.00000892589 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2654  porin  35.04 
 
 		 403 aa  216  4e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.157647  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2229  porin  35.7 
 
 		 382 aa  195  1e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.218103  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0680  porin  34.41 
 
 		 388 aa  194  3e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.424836  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04813  hypothetical protein  27.72 
 
 		 365 aa  118  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1641  outer membrane protein N  27.42 
 
 		 383 aa  97.1  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.150346  normal  0.976453 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2197  outer membrane protein  25.94 
 
 		 357 aa  87.4  4e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000111535  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1679  porin  25.62 
 
 		 357 aa  86.7  7e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.512961  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2795  outer membrane porin protein C  27.78 
 
 		 372 aa  85.9  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00922509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3264  outer membrane porin protein C  26.41 
 
 		 370 aa  85.1  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00668257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1582  outer membrane protein N  27.66 
 
 		 383 aa  84  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.640646  normal  0.720278 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0666  porin  24.04 
 
 		 324 aa  83.6  0.000000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00111405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1870  outer membrane protein N  27.42 
 
 		 383 aa  82  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.098119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2839  outer membrane porin protein C  29.65 
 
 		 371 aa  81.6  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2761  outer membrane porin protein C  29.65 
 
 		 371 aa  81.6  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000019147  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1444  outer membrane porin protein C  29.65 
 
 		 371 aa  81.6  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000996913  normal  0.640308 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1221  porin family protein  26.4 
 
 		 387 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.263748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0427  putative outer membrane pore protein  25.95 
 
 		 340 aa  79.3  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2507  outer membrane porin protein C  30.67 
 
 		 378 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0209108 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2451  outer membrane porin protein C  30.67 
 
 		 378 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0487875 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2493  outer membrane porin protein C  30.67 
 
 		 378 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2610  outer membrane porin protein C  30.67 
 
 		 378 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.440954 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06284  hypothetical protein  26.25 
 
 		 352 aa  79.3  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1701  outer membrane protein N  27.04 
 
 		 388 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.265921  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2403  outer membrane porin protein C  30.67 
 
 		 378 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00624536  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1124  outer membrane protein N  26.48 
 
 		 403 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0181987  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1458  porin  26.77 
 
 		 365 aa  75.1  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2354  outer membrane porin protein C  26.39 
 
 		 368 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00268594  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001437  non-specific porin  25.25 
 
 		 352 aa  74.3  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.524484  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2057  porin  26.11 
 
 		 359 aa  73.9  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2514  outer membrane porin protein C  24.06 
 
 		 363 aa  73.9  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000192905  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1435  outer membrane porin protein C  30.15 
 
 		 376 aa  73.2  0.000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.974185  normal  0.210914 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0724  outer membrane porin protein C  30.15 
 
 		 376 aa  73.2  0.000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.140015  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1448  porin  25.18 
 
 		 368 aa  72.8  0.000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0593743  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1443  porin Gram-negative type  29.02 
 
 		 367 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00990421  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1701  outer membrane protein N  26.48 
 
 		 372 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1572  outer membrane protein N  26.63 
 
 		 380 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0737338 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1642  outer membrane protein N  26.48 
 
 		 372 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1634  outer membrane protein N  26.48 
 
 		 372 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.952827  normal  0.939851 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1806  outer membrane protein N  26.48 
 
 		 372 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0174534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0238  outer membrane phosphoporin protein E  26.18 
 
 		 351 aa  70.5  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1641  outer membrane protein N  27.06 
 
 		 372 aa  70.5  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00375551  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1784  porin Gram-negative type  24.57 
 
 		 373 aa  70.9  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00154811  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2553  porin  23.76 
 
 		 373 aa  70.5  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.437604 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3353  outer membrane porin protein C  24.01 
 
 		 367 aa  70.1  0.00000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.128498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2224  porin  26.11 
 
 		 360 aa  68.6  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0575083  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2115  outer membrane protein N  26.11 
 
 		 360 aa  68.6  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.829511  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2514  outer membrane protein N  26.11 
 
 		 360 aa  68.6  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.127891 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2649  porin  26.54 
 
 		 360 aa  67.8  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000040387  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1979  outer membrane protein F  26.54 
 
 		 360 aa  67.8  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000261923  normal  0.629044 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2559  outer membrane protein F  26.2 
 
 		 360 aa  67.4  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000037634  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2056  porin Gram-negative type  24.63 
 
 		 368 aa  66.6  0.0000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0706527  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0268  outer membrane phosphoporin protein E  26.18 
 
 		 351 aa  66.2  0.0000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2191  outer membrane protein F  24.12 
 
 		 357 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.145959  normal  0.466733 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2212  outer membrane protein N  25.59 
 
 		 398 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.466216  normal  0.580794 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1968  porin  25.36 
 
 		 378 aa  65.5  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2364  outer membrane porin protein C  30.1 
 
 		 364 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0333811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0824  outer membrane porin protein LC  25.67 
 
 		 360 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.166078  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2155  outer membrane protein F  26.27 
 
 		 400 aa  64.7  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.977291  normal  0.673078 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3366  porin Gram-negative type  26.18 
 
 		 351 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2159  outer membrane protein N  25.36 
 
 		 398 aa  63.9  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.142593 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2857  porin  24.44 
 
 		 371 aa  64.3  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.454817  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2778  outer membrane protein N  27.59 
 
 		 371 aa  63.9  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.704962  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1322  outer membrane protein C2  27.59 
 
 		 371 aa  63.9  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0295  outer membrane phosphoporin protein E  25.94 
 
 		 351 aa  63.9  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00372368 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0273  outer membrane phosphoporin protein E  25.94 
 
 		 351 aa  63.5  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.664027  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0286  outer membrane phosphoporin protein E  25.94 
 
 		 351 aa  63.5  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.172379  normal  0.530203 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1687  outer membrane porin protein LC  24.75 
 
 		 362 aa  63.5  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.535168 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1689  outer membrane porin protein LC  24.75 
 
 		 362 aa  63.5  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.808726 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2667  outer membrane protein F  23.02 
 
 		 362 aa  63.5  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000513703  normal  0.141925 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1037  outer membrane protein F  23.02 
 
 		 362 aa  63.5  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000488881  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>