171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_1631 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1821  outer membrane porin, putative  79.16 
 
 		 398 aa  634    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2468  porin  83.13 
 
 		 402 aa  686    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000293387  hitchhiker  0.000118178 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2536  porin  82.88 
 
 		 402 aa  683    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000566311  unclonable  0.0000300208 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3603  porin  76.92 
 
 		 402 aa  658    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000908733  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2628  porin  82.88 
 
 		 402 aa  678    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000106502  hitchhiker  0.00000892589 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1251  outer membrane porin, putative  75.93 
 
 		 402 aa  645    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000429036  hitchhiker  0.000137517 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1631  porin  100 
 
 		 403 aa  821    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000133613  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2723  porin Gram-negative type  99.5 
 
 		 403 aa  818    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000866519  hitchhiker  0.00000818773 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3084  porin  76.3 
 
 		 402 aa  638    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000611786  decreased coverage  0.00000268212 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1515  porin  85.36 
 
 		 402 aa  714    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000337456  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1620  porin  98.01 
 
 		 403 aa  808    Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000207941  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1654  porin  97.52 
 
 		 403 aa  806    Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000730706  normal  0.12603 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2557  porin  73.09 
 
 		 402 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.40328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2481  porin  70.1 
 
 		 403 aa  589  1e-167  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000211873  hitchhiker  0.0000558993 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2654  porin  63.73 
 
 		 403 aa  523  1e-147  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.157647  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1568  porin  63.29 
 
 		 403 aa  500  1e-140  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000403403  hitchhiker  0.00000152354 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0680  porin  54.81 
 
 		 388 aa  444  1e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.424836  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2229  porin  48.14 
 
 		 382 aa  358  7e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.218103  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0276  porin  34.79 
 
 		 384 aa  234  3e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3873  porin  34.79 
 
 		 384 aa  234  3e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0642035 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3669  porin  34.55 
 
 		 384 aa  232  9e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0312  outer membrane porin, putative  34.06 
 
 		 384 aa  231  2e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3681  porin  33.82 
 
 		 384 aa  231  2e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4086  porin  33.9 
 
 		 384 aa  230  3e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4055  porin  33.9 
 
 		 384 aa  229  5e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4173  porin  34.38 
 
 		 384 aa  229  8e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3977  porin Gram-negative type  34.38 
 
 		 384 aa  229  1e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1487  porin  34.77 
 
 		 389 aa  225  9e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.911374 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2283  porin  35.84 
 
 		 385 aa  223  4e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3060  outer membrane porin, putative  34.21 
 
 		 389 aa  222  7e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3366  porin  34.87 
 
 		 385 aa  222  8e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2434  porin  32.85 
 
 		 389 aa  218  2e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.775403  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3336  outer membrane porin, putative  36.08 
 
 		 384 aa  202  8e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04813  hypothetical protein  28.26 
 
 		 365 aa  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0427  putative outer membrane pore protein  28.09 
 
 		 340 aa  93.6  6e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0666  porin  34.29 
 
 		 324 aa  88.6  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00111405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001437  non-specific porin  25.92 
 
 		 352 aa  87  5e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.524484  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06284  hypothetical protein  27.81 
 
 		 352 aa  83.2  0.000000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2839  outer membrane porin protein C  25.54 
 
 		 371 aa  77  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2761  outer membrane porin protein C  25.54 
 
 		 371 aa  77  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000019147  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1444  outer membrane porin protein C  25.54 
 
 		 371 aa  77  0.0000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000996913  normal  0.640308 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2197  outer membrane protein  24.88 
 
 		 357 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000111535  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1679  porin  24.64 
 
 		 357 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.512961  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1458  porin  24.36 
 
 		 365 aa  65.9  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2354  outer membrane porin protein C  24.15 
 
 		 368 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00268594  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3264  outer membrane porin protein C  24.47 
 
 		 370 aa  65.1  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00668257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0824  outer membrane porin protein LC  23.82 
 
 		 360 aa  64.7  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.166078  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1443  porin Gram-negative type  24.52 
 
 		 367 aa  63.2  0.000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00990421  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0724  outer membrane porin protein C  23.24 
 
 		 376 aa  62.4  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.140015  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1221  porin family protein  24.23 
 
 		 387 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.263748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1124  outer membrane protein N  23.72 
 
 		 403 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0181987  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3353  outer membrane porin protein C  23.54 
 
 		 367 aa  60.8  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.128498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  34.75 
 
 		 380 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1435  outer membrane porin protein C  23.91 
 
 		 376 aa  60.5  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.974185  normal  0.210914 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2493  outer membrane porin protein C  23 
 
 		 378 aa  60.5  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2403  outer membrane porin protein C  23.5 
 
 		 378 aa  59.7  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00624536  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06741  hypothetical protein  26.01 
 
 		 330 aa  59.3  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2649  porin  24.64 
 
 		 360 aa  58.5  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000040387  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2451  outer membrane porin protein C  22.77 
 
 		 378 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0487875 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2610  outer membrane porin protein C  22.77 
 
 		 378 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.440954 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1968  porin  23.06 
 
 		 378 aa  58.2  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2507  outer membrane porin protein C  22.77 
 
 		 378 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0209108 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2514  outer membrane porin protein C  23.3 
 
 		 363 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000192905  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1641  outer membrane protein N  24.58 
 
 		 383 aa  57.4  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.150346  normal  0.976453 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2155  outer membrane protein F  24.83 
 
 		 400 aa  57  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.977291  normal  0.673078 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2364  outer membrane porin protein C  23.26 
 
 		 364 aa  56.6  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0333811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000832  outer membrane protein C precursor  30.32 
 
 		 331 aa  56.6  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0331596  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2212  outer membrane protein N  24.77 
 
 		 398 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.466216  normal  0.580794 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2159  outer membrane protein N  24.19 
 
 		 398 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.142593 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1979  outer membrane protein F  23.93 
 
 		 360 aa  54.7  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000261923  normal  0.629044 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02142  outer membrane porin protein C  25.63 
 
 		 311 aa  53.9  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02101  hypothetical protein  25.63 
 
 		 329 aa  53.5  0.000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2559  outer membrane protein F  24.11 
 
 		 360 aa  53.5  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000037634  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  32.62 
 
 		 380 aa  53.1  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2115  outer membrane protein N  23.38 
 
 		 360 aa  53.1  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.829511  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2514  outer membrane protein N  23.38 
 
 		 360 aa  53.1  0.000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.127891 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2224  porin  23.38 
 
 		 360 aa  53.1  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0575083  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0008  OmpC family outer membrane porin  31.48 
 
 		 365 aa  52.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2795  outer membrane porin protein C  22.14 
 
 		 372 aa  52.8  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00922509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2839  porin  22.68 
 
 		 360 aa  51.6  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00468418 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1006  outer membrane protein F  23.74 
 
 		 363 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00715949  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1114  outer membrane protein F  23.74 
 
 		 363 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0339552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1032  outer membrane protein F  23.74 
 
 		 363 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.847393  normal  0.0115184 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1090  outer membrane protein F  24.58 
 
 		 362 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000211589  normal  0.385308 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1064  outer membrane protein F  23.74 
 
 		 363 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000219898 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1582  outer membrane protein N  24.47 
 
 		 383 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.640646  normal  0.720278 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0588  major outer membrane protein OmpU  28.65 
 
 		 333 aa  50.8  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0116995  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1097  outer membrane protein F  23.74 
 
 		 363 aa  50.4  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.918744 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  26.5 
 
 		 381 aa  50.1  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1702  porin family protein  23 
 
 		 366 aa  50.1  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0189246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0295  outer membrane phosphoporin protein E  23.23 
 
 		 351 aa  49.7  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00372368 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1770  outer membrane porin protein LC  24.22 
 
 		 362 aa  49.7  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.895795 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00933  outer membrane porin 1a (Ia;b;F)  24.11 
 
 		 362 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000151629  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2714  porin Gram-negative type  24.11 
 
 		 362 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000119637  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2389  outer membrane protein F  24.11 
 
 		 362 aa  49.7  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00716646  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1870  outer membrane protein N  24.58 
 
 		 383 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.098119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1750  outer membrane porin protein LC  24.22 
 
 		 362 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.778273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1687  outer membrane porin protein LC  24.22 
 
 		 362 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.535168 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00940  hypothetical protein  24.11 
 
 		 362 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000170376  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1029  outer membrane protein F  24.11 
 
 		 362 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00117634  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>