More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2795 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2795  ferrous iron efflux protein F  100 
 
 		 301 aa  612  9.999999999999999e-175  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00102947  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00146  ferrous iron efflux protein F  70.37 
 
 		 302 aa  439  9.999999999999999e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002221  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  70.03 
 
 		 302 aa  432  1e-120  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000518265  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2262  ferrous iron efflux protein F  66.78 
 
 		 302 aa  424  1e-117  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000896639  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4394  ferrous iron efflux protein F  61.69 
 
 		 300 aa  364  1e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4057  ferrous iron efflux protein F  61.03 
 
 		 300 aa  363  2e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.3408  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03800  ferrous iron efflux protein F  61.36 
 
 		 300 aa  362  4e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.769582  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4070  cation diffusion facilitator family transporter  61.36 
 
 		 300 aa  362  4e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03749  hypothetical protein  61.36 
 
 		 300 aa  362  4e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.859371  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4103  ferrous iron efflux protein F  61.36 
 
 		 300 aa  362  4e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5369  ferrous iron efflux protein F  61.36 
 
 		 300 aa  362  4e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4448  ferrous iron efflux protein F  61.36 
 
 		 300 aa  362  4e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4145  ferrous iron efflux protein F  61.36 
 
 		 300 aa  362  4e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4355  ferrous iron efflux protein F  61.36 
 
 		 300 aa  362  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.363052 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4278  ferrous iron efflux protein F  60 
 
 		 300 aa  356  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.546202  normal  0.887398 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4390  ferrous iron efflux protein F  60 
 
 		 300 aa  356  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.228028 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4392  ferrous iron efflux protein F  60 
 
 		 300 aa  356  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4459  ferrous iron efflux protein F  60 
 
 		 300 aa  356  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.709567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4307  ferrous iron efflux protein F  60 
 
 		 300 aa  356  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3813  ferrous iron efflux protein F  63.45 
 
 		 298 aa  350  2e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.70191  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0139  ferrous iron efflux protein F  59.93 
 
 		 300 aa  350  2e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.205512  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4127  ferrous iron efflux protein F  60.69 
 
 		 300 aa  341  7e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4020  ferrous iron efflux protein F  62.41 
 
 		 300 aa  341  7e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0087  ferrous iron efflux protein F  60.69 
 
 		 300 aa  341  7e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0088  ferrous iron efflux protein F  60.34 
 
 		 300 aa  339  2.9999999999999998e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4808  ferrous iron efflux protein F  60.34 
 
 		 300 aa  339  4e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0137  ferrous iron efflux protein F  58.92 
 
 		 300 aa  338  5.9999999999999996e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3300  iron and zinc efflux system protein  50 
 
 		 318 aa  296  3e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.831799  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0484  cation efflux protein  50.34 
 
 		 298 aa  295  7e-79  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4333  cation efflux protein  48.1 
 
 		 297 aa  271  7e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0256  cation diffusion facilitator family transporter  49.83 
 
 		 290 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.015822  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3931  cation diffusion facilitator family transporter  49.65 
 
 		 289 aa  270  2e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146752  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0263  cation diffusion facilitator family transporter  49.3 
 
 		 296 aa  267  1e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000665998  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0263  cation diffusion facilitator family transporter  49.13 
 
 		 296 aa  267  2e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0258  cation diffusion facilitator family transporter  49.13 
 
 		 296 aa  266  2e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0238617  decreased coverage  0.0000137847 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3430  cation efflux family protein  49.3 
 
 		 289 aa  267  2e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.038315  normal  0.371724 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4385  cation efflux family protein  44.64 
 
 		 301 aa  264  1e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.592721  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0369  cation diffusion facilitator family transporter  48.61 
 
 		 293 aa  263  2e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000868845  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0314  cation diffusion facilitator family transporter  47.9 
 
 		 289 aa  263  2e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000499164  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4937  cation efflux protein  45.33 
 
 		 298 aa  261  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4790  cation efflux family protein  46.02 
 
 		 297 aa  259  3e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3459  cation diffusion facilitator family transporter  47.39 
 
 		 295 aa  259  4e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000668227  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3767  cation diffusion facilitator family transporter  48.61 
 
 		 297 aa  254  9e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0281724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1146  putative transporter  45.8 
 
 		 298 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2871  cation efflux protein  46.18 
 
 		 317 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12610  putative transporter  46.5 
 
 		 298 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.686969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0255  cation diffusion facilitator family transporter  48.26 
 
 		 299 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000211411  hitchhiker  0.0000000259918 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0281  cation diffusion facilitator family transporter  47.9 
 
 		 289 aa  253  3e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000230949  unclonable  0.000000000100578 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4774  cation diffusion facilitator family transporter  46.13 
 
 		 290 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437993 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0254  cation diffusion facilitator family transporter  48.26 
 
 		 297 aa  251  1e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00100286  hitchhiker  0.000434478 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0646  cation diffusion facilitator family transporter  45.8 
 
 		 289 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.186266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0283  cation diffusion facilitator family transporter  47.9 
 
 		 289 aa  250  2e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000135254  hitchhiker  0.000000557586 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4475  cation efflux family protein  48.26 
 
 		 296 aa  249  3e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3741  cation diffusion facilitator family transporter  46.9 
 
 		 292 aa  250  3e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4650  cation diffusion facilitator family transporter  46.13 
 
 		 290 aa  248  7e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.188299 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3568  cation diffusion facilitator family transporter  46.15 
 
 		 289 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000153022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0791  cation diffusion facilitator family transporter  45.74 
 
 		 312 aa  238  8e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0241  cation diffusion facilitator family transporter  44.97 
 
 		 310 aa  233  3e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000961232  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09970  Cation efflux protein  45.42 
 
 		 293 aa  231  1e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.907578  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4828  cation diffusion facilitator family transporter  45.42 
 
 		 290 aa  228  7e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2628  cation efflux protein  41.84 
 
 		 325 aa  226  4e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.620911  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0047  cation diffusion facilitator family transporter  42.47 
 
 		 325 aa  215  8e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.408108  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4753  cation diffusion facilitator family transporter  40.77 
 
 		 296 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.36054  decreased coverage  0.00983844 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1177  cation diffusion facilitator family transporter  42.01 
 
 		 308 aa  197  1.0000000000000001e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0116  cation diffusion facilitator family transporter  38.64 
 
 		 323 aa  186  3e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.358203  normal  0.378394 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4947  cation diffusion facilitator family transporter  37.41 
 
 		 312 aa  187  3e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723787  normal  0.395043 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1026  cation efflux family protein  33.22 
 
 		 295 aa  173  2.9999999999999996e-42  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0972  cation efflux family protein  33.22 
 
 		 295 aa  173  2.9999999999999996e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1171  cation efflux family protein  32.89 
 
 		 295 aa  171  1e-41  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0847  cation efflux protein  34.17 
 
 		 297 aa  167  2e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1582  cation diffusion facilitator family transporter  33.79 
 
 		 299 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1509  putative transport system permease protein  33.56 
 
 		 314 aa  159  4e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073133  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1521  cation diffusion facilitator family transporter  31.88 
 
 		 309 aa  155  9e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0896  cation efflux family protein  30.74 
 
 		 304 aa  152  7e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0221423  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1801  cation efflux family protein  32.88 
 
 		 376 aa  150  2e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0942158  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07750  cation diffusion facilitator family transporter  30.22 
 
 		 330 aa  150  3e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2073  cation diffusion facilitator family transporter  29.23 
 
 		 308 aa  146  5e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1483  cation diffusion facilitator family transporter  29.79 
 
 		 308 aa  145  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0225  cation diffusion facilitator family transporter  31.07 
 
 		 312 aa  143  3e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1113  hypothetical protein  32.62 
 
 		 307 aa  143  3e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.416676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1850  cation diffusion facilitator family transporter  31.25 
 
 		 315 aa  143  5e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1770  cation diffusion facilitator family transporter  30.9 
 
 		 315 aa  142  6e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1683  cation diffusion facilitator family transporter  33.57 
 
 		 308 aa  141  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000676071  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0532  ferrous-iron efflux pump FieF  35.88 
 
 		 291 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.800383  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5513  cation diffusion facilitator family transporter  30.6 
 
 		 295 aa  140  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.281094  normal  0.363198 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1954  cation diffusion facilitator family transporter  30.18 
 
 		 328 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0806665 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2294  cation diffusion facilitator family transporter  31 
 
 		 306 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38282  normal  0.177312 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3075  cation diffusion facilitator family transporter  30.08 
 
 		 304 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2000  cation diffusion facilitator family transporter  35.29 
 
 		 285 aa  139  6e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.7679  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1731  cation diffusion facilitator family transporter  28.97 
 
 		 315 aa  139  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.560975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2658  cation diffusion facilitator family transporter  30.96 
 
 		 295 aa  138  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2025  cation diffusion facilitator family transporter  28.06 
 
 		 313 aa  138  1e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0165078  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3476  putative cation efflux family protein, CzcD-like protein  30.74 
 
 		 296 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606573  normal  0.771262 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1114  cation efflux protein  30.27 
 
 		 305 aa  137  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0974  cation diffusion facilitator family transporter  30.95 
 
 		 466 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  29.82 
 
 		 311 aa  135  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2198  cation diffusion facilitator family transporter  29.72 
 
 		 293 aa  135  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.776966  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0980  cation diffusion facilitator family transporter  29.86 
 
 		 305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  29.35 
 
 		 285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000134664  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1123  ferrous-iron efflux pump FieF  30.94 
 
 		 289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00791465  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>