98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1214 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1214  putative mobile metallo-beta-lactamase  100 
 
 		 248 aa  513  1e-144  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.621321  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3414  Beta-lactamase  51.15 
 
 		 272 aa  252  3e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.062557 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3595  Beta-lactamase  48.64 
 
 		 272 aa  240  1e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0822  Beta-lactamase  40.91 
 
 		 269 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252294  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3154  Beta-lactamase  35.81 
 
 		 237 aa  169  3e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1178  Beta-lactamase  36.28 
 
 		 238 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.188267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0887  Beta-lactamase  41.18 
 
 		 261 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.528185  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3485  Beta-lactamase  30 
 
 		 248 aa  129  4.0000000000000003e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6144  Beta-lactamase  31.6 
 
 		 278 aa  129  6e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.768175 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3152  Beta-lactamase  34.01 
 
 		 257 aa  124  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0137675  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3473  beta-lactamase II  34.78 
 
 		 256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00878467  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3447  beta-lactamase II  35.52 
 
 		 257 aa  119  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3460  beta-lactamase II  34.24 
 
 		 256 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0354  Beta-lactamase  29.63 
 
 		 258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3218  beta-lactamase II  34.76 
 
 		 256 aa  116  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.109297  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3452  beta-lactamase II  34.43 
 
 		 257 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000101739  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3500  beta-lactamase II  33.7 
 
 		 256 aa  115  5e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3245  beta-lactamase II  33.7 
 
 		 256 aa  115  5e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0138707  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0380  Beta-lactamase  27.38 
 
 		 260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.572749  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0371  Beta-lactamase  27.06 
 
 		 260 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.941543  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2056  Beta-lactamase  26.7 
 
 		 246 aa  109  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.53906 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3261  Beta-lactamase  29.84 
 
 		 249 aa  108  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.611903  normal  0.804971 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1371  Beta-lactamase  29.88 
 
 		 244 aa  107  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0265267  normal  0.207163 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3155  beta-lactamase II  37.86 
 
 		 171 aa  103  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0949519  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1802  beta-lactamase 2  37.14 
 
 		 158 aa  102  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0666  beta-lactamase-like  29.67 
 
 		 329 aa  55.5  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.257894  normal  0.323841 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  27.78 
 
 		 319 aa  55.5  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  27.78 
 
 		 319 aa  55.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  27.78 
 
 		 319 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4551  beta-lactamase domain-containing protein  35.62 
 
 		 332 aa  55.1  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  24.68 
 
 		 318 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  27.27 
 
 		 319 aa  53.9  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1300  beta-lactamase domain-containing protein  21.52 
 
 		 264 aa  53.5  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.862456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  24.68 
 
 		 318 aa  53.1  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  27.78 
 
 		 319 aa  53.1  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4534  beta-lactamase-like  23.46 
 
 		 319 aa  53.1  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000147099  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  27.78 
 
 		 319 aa  53.1  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  26.77 
 
 		 319 aa  51.2  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  26.77 
 
 		 319 aa  51.6  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  26.77 
 
 		 319 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  26.77 
 
 		 336 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  26.77 
 
 		 319 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  26.26 
 
 		 319 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000219811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3721  beta-lactamase domain-containing protein  27.27 
 
 		 339 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  23.38 
 
 		 318 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0922  beta-lactamase-like  20.31 
 
 		 318 aa  50.8  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0736  beta-lactamase domain-containing protein  28.43 
 
 		 266 aa  50.1  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0019476  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  25.25 
 
 		 319 aa  50.4  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4197  beta-lactamase domain-containing protein  26.77 
 
 		 339 aa  50.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  25.83 
 
 		 318 aa  50.1  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2964  beta-lactamase-like  22.67 
 
 		 292 aa  49.7  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.410641  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2060  metallo-beta-lactamase family protein  36.99 
 
 		 318 aa  49.7  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3232  metallo-beta-lactamase family protein  36.99 
 
 		 318 aa  49.7  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1394  metallo-beta-lactamase family protein  36.99 
 
 		 318 aa  49.3  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0989  beta-lactamase domain-containing protein  24.74 
 
 		 249 aa  49.3  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1925  metallo-beta-lactamase family protein  36.99 
 
 		 318 aa  49.7  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0966006  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3217  metallo-beta-lactamase family protein  36.99 
 
 		 318 aa  49.7  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3178  metallo-beta-lactamase family protein  36.99 
 
 		 318 aa  49.7  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2684  metallo-beta-lactamase family protein  36.99 
 
 		 318 aa  49.7  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0852  metallo-beta-lactamase family protein  36.99 
 
 		 318 aa  49.7  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0410  beta-lactamase domain protein  30.94 
 
 		 488 aa  48.9  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0813  beta-lactamase domain protein  32.94 
 
 		 322 aa  48.5  0.00009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5154  beta-lactamase domain protein  19.76 
 
 		 317 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.692962  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0580  beta-lactamase domain-containing protein  21.43 
 
 		 321 aa  48.1  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00690  hypothetical protein  25.63 
 
 		 295 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.696824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0248  beta-lactamase domain-containing protein  26.04 
 
 		 246 aa  48.1  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1866  beta-lactamase domain protein  34.52 
 
 		 320 aa  47.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.914687  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  34.25 
 
 		 335 aa  47.4  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4299  beta-lactamase domain-containing protein  19.49 
 
 		 321 aa  47.4  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  34.25 
 
 		 335 aa  47.4  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0565  putative metallo-beta-lactamase family protein  18.97 
 
 		 318 aa  47.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.612107  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0250  beta-lactamase domain-containing protein  26.04 
 
 		 246 aa  47.8  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1308  beta-lactamase domain-containing protein  25.49 
 
 		 246 aa  47  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  24.68 
 
 		 323 aa  46.2  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4662  beta-lactamase domain protein  26.99 
 
 		 313 aa  46.6  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1197  beta-lactamase domain protein  29.11 
 
 		 317 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00755  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  21.13 
 
 		 296 aa  45.8  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168876  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25410  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  25.64 
 
 		 259 aa  45.8  0.0006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0966  hydroxyacylglutathione hydrolase  25.79 
 
 		 249 aa  45.4  0.0008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0890  beta-lactamase-like  18.58 
 
 		 317 aa  45.4  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434485  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0292  beta-lactamase domain protein  35.62 
 
 		 319 aa  45.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0157  Beta-lactamase-like  22.51 
 
 		 314 aa  44.7  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1700  Beta-lactamase-like  28.3 
 
 		 382 aa  44.7  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0462  beta-lactamase-like  24.16 
 
 		 292 aa  44.7  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0057  hypothetical protein  24.54 
 
 		 295 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1030  beta-lactamase domain protein  24.5 
 
 		 312 aa  44.3  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.932178  normal  0.324338 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0906  Beta-lactamase-like  24.75 
 
 		 316 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1017  beta-lactamase-like  18.97 
 
 		 316 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.751913  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1902  beta-lactamase domain-containing protein  34.07 
 
 		 287 aa  43.5  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.392348  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  23.38 
 
 		 318 aa  43.5  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1475  hypothetical protein  25.91 
 
 		 317 aa  43.5  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18970  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  26.44 
 
 		 319 aa  42.7  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0850103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1880  Beta-lactamase-like  26.89 
 
 		 367 aa  42.4  0.007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000360179  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1415  beta-lactamase-like protein  24.31 
 
 		 288 aa  42.4  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0489899 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1168  metallo-beta-lactamase superfamily protein  27.38 
 
 		 390 aa  42.4  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0415868  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5541  beta-lactamase domain protein  27.63 
 
 		 264 aa  42  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.101502 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1709  beta-lactamase-like  28.57 
 
 		 353 aa  42  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.587452  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5107  beta-lactamase domain protein  32.53 
 
 		 321 aa  42  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.065858  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>