281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06579 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06579  hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  311  1.9999999999999998e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1187  ankyrin repeat-containing protein  59.6 
 
 
188 aa  183  7e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0126  ankyrin  61.54 
 
 
192 aa  150  4e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3395  ankyrin  55.81 
 
 
187 aa  149  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.837562  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0254  ankyrin  49.04 
 
 
168 aa  142  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0251  ankyrin  49.04 
 
 
168 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3252  AnkB protein  58.26 
 
 
124 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0103832  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02831  ankyrin AnkB  50 
 
 
187 aa  124  5e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3583  ankyrin domain protein  45.6 
 
 
184 aa  123  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381632  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3354  ankyrin  45.38 
 
 
189 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0944137  normal  0.0422301 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3136  ankyrin  46.67 
 
 
201 aa  118  3.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.311886  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5252  hypothetical protein  48.74 
 
 
185 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.626004  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61020  hypothetical protein  48.28 
 
 
183 aa  114  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0972  Ankyrin  42.75 
 
 
197 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2031  ankyrin  43.8 
 
 
203 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.137275  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2195  ankyrin repeat-containing protein  40.87 
 
 
203 aa  97.1  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00731252  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3630  ankyrin  38.26 
 
 
203 aa  93.6  9e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4469  ankyrin  38.26 
 
 
203 aa  93.6  9e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.607669  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3897  ankyrin  38.26 
 
 
203 aa  93.6  9e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.497005 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1108  ankyrin  34.19 
 
 
197 aa  93.2  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0116329  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6867  hypothetical protein  37.4 
 
 
130 aa  81.3  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.883944  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2325  ankyrin  34.92 
 
 
125 aa  77.8  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.202101 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5249  ankyrin  36.44 
 
 
190 aa  72.8  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2346  Ankyrin  35.65 
 
 
173 aa  72  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.176279  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2451  Ankyrin  36.97 
 
 
155 aa  70.5  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2449  Ankyrin  35.14 
 
 
155 aa  70.1  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21530  ankyrin domain-containing protein  32.82 
 
 
171 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.190597  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2707  Ankyrin  35.9 
 
 
128 aa  69.7  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.217591  normal  0.216365 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0458  Ankyrin  34.21 
 
 
161 aa  68.6  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510961  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1618  Ankyrin  31.03 
 
 
187 aa  67.8  0.00000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5572  Ankyrin  33.06 
 
 
157 aa  67.4  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.43275  normal  0.999489 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1535  ankyrin  31.01 
 
 
137 aa  66.2  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.180065  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2718  Ankyrin  38.95 
 
 
145 aa  65.9  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000951266 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2256  ankyrin  35.09 
 
 
187 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.410202  normal  0.75483 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4432  Ankyrin  36.46 
 
 
195 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0179  Ankyrin  34.21 
 
 
140 aa  65.1  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.241008  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1831  hypothetical protein  31.3 
 
 
171 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22650  ankyrin repeat-containing protein  34.38 
 
 
135 aa  65.1  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1284  ankyrin  37.14 
 
 
870 aa  64.3  0.0000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.226002  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3007  ankyrin  32.23 
 
 
139 aa  64.3  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.81586  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4065  ankyrin  35.42 
 
 
194 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.361262  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0378  ankyrin  36.52 
 
 
186 aa  63.2  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00324909  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11740  ankyrin repeat-containing protein  35.35 
 
 
149 aa  62.8  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.261749  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4177  ankyrin  35.23 
 
 
175 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0807  ankyrin  40.51 
 
 
192 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.393764 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2051  ankyrin domain protein  29.23 
 
 
181 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0348951  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5275  Ankyrin  34.83 
 
 
178 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.667111 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1071  hypothetical protein  31.25 
 
 
347 aa  62  0.000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0274  conserved hypothetical protein, ankyrin repeat family protein  28.15 
 
 
162 aa  61.6  0.000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4179  Ankyrin  35.14 
 
 
132 aa  61.2  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0287767  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2134  Ankyrin  35.45 
 
 
136 aa  61.2  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4546  Ankyrin  35.42 
 
 
200 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1343  ankyrin domain-containing protein  34.09 
 
 
178 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0374452 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0149  ankyrin  35.45 
 
 
237 aa  59.7  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21100  ankyrin repeat-containing protein  38.2 
 
 
128 aa  60.1  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.697064  normal  0.168349 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3164  ankyrin  29.41 
 
 
173 aa  59.7  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.139563  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1860  ankyrin  27.07 
 
 
181 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.43131 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2151  Ankyrin  42.86 
 
 
490 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.712677 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0519  hypothetical protein  28.91 
 
 
278 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.682563 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1834  ankyrin domain-containing protein  26.4 
 
 
174 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.268175  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06230  ankyrin repeat protein  31.54 
 
 
138 aa  56.6  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1442  ankyrin  27.2 
 
 
174 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.858603  normal  0.0446187 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4103  ankyrin  32.99 
 
 
238 aa  57  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3876  ankyrin  26.4 
 
 
174 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0424681  normal  0.353602 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0219  Ankyrin  31.09 
 
 
382 aa  56.2  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.41533e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3262  Ankyrin  29.17 
 
 
163 aa  55.8  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00689099  normal  0.0238683 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1056  ankyrin repeat-containing protein  29.92 
 
 
172 aa  55.5  0.0000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.82457  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0264  ankyrin repeat-containing protein  27.56 
 
 
156 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5600  hypothetical protein  30.43 
 
 
170 aa  54.7  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1577  ankyrin repeat-containing protein  27.56 
 
 
156 aa  54.7  0.0000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.651812  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1435  hypothetical protein  31.62 
 
 
1585 aa  54.7  0.0000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.015567 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4314  ankyrin  30.25 
 
 
426 aa  54.3  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327235  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1388  ankyrin repeat-containing protein  27.56 
 
 
156 aa  54.7  0.0000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000015487  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5090  Ankyrin  33.94 
 
 
135 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.325044  normal  0.0672645 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0976  Ankyrin  38.68 
 
 
395 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.157423  normal  0.476091 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48690  Rhodanese-like protein with Ankyrin repeat  39.53 
 
 
261 aa  53.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3138  ankyrin  31.25 
 
 
208 aa  53.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1484  hypothetical protein  39.29 
 
 
790 aa  53.1  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0685  Ankyrin  41.43 
 
 
140 aa  53.1  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1412  ankyrin  24.8 
 
 
174 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0363  hypothetical protein  32.77 
 
 
2171 aa  52.8  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.082224 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4648  ankyrin  35.71 
 
 
174 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.90503 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4567  ankyrin repeat-containing protein  26.49 
 
 
226 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.928226  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2061  hypothetical protein  38.3 
 
 
584 aa  52.4  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0582  ankyrin  30.83 
 
 
344 aa  52.4  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3384  ankyrin  34.4 
 
 
293 aa  52.8  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.251078 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  34.12 
 
 
1402 aa  52  0.000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3006  ankyrin  42.86 
 
 
222 aa  51.6  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2896  ankyrin-related protein  29.66 
 
 
346 aa  52  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1887  ankyrin  30.77 
 
 
321 aa  52.4  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.959203 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2090  Ankyrin  34.94 
 
 
176 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2793  Ankyrin  35.14 
 
 
232 aa  51.2  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176695  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4783  ankyrin repeat domain protein  25.83 
 
 
226 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2380  hypothetical protein  31.09 
 
 
305 aa  50.8  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.691759  normal  0.155983 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1634  ankyrin repeat-containing protein  44.16 
 
 
1116 aa  50.8  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0269822  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_8694  predicted protein  39.44 
 
 
145 aa  50.8  0.000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.827941  normal  0.680946 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1221  hypothetical protein  32.97 
 
 
472 aa  50.8  0.000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0849  hypothetical protein  34.74 
 
 
723 aa  50.4  0.000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.048411 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43531  predicted protein  29.63 
 
 
119 aa  50.4  0.000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.181933  normal  0.18997 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0229  Ankyrin  29.46 
 
 
715 aa  50.4  0.000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000140183  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>