257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2793 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_2793  Ankyrin  100 
 
 
232 aa  445  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176695  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4103  ankyrin  74.49 
 
 
238 aa  266  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0149  ankyrin  65.88 
 
 
237 aa  248  4e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2634  ankyrin  45.21 
 
 
269 aa  141  9e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0366745  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0824  ankyrin  42.72 
 
 
266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132529  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0071  ankyrin repeat-containing protein  45.45 
 
 
224 aa  138  6e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4250  ankyrin  43.6 
 
 
237 aa  138  8.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.379983 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2388  ankyrin  46.84 
 
 
217 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.751385 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4030  Ankyrin  38.68 
 
 
221 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.147969 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2345  Ankyrin  46.52 
 
 
233 aa  133  3e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1283  ankyrin  45.2 
 
 
214 aa  131  6.999999999999999e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27436  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3569  ankyrin  43.16 
 
 
227 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00419939 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0798  aankyrin repeat-containing protein  44.15 
 
 
264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234452  normal  0.451941 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0781  aankyrin repeat-containing protein  43.09 
 
 
261 aa  126  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.150495  normal  0.0323069 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0728  Ankyrin  44.15 
 
 
264 aa  126  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.365587  normal  0.800826 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3296  ankyrin  39.47 
 
 
254 aa  117  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.172473 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0456  ankyrin repeat domain protein  36.99 
 
 
196 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0121916 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4783  ankyrin repeat domain protein  36.78 
 
 
226 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2741  hypothetical protein  39.35 
 
 
210 aa  115  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32350  hypothetical protein  40.11 
 
 
210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.234736  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0925  conserved hypothetical protein; ankyrin repeateat; putative exported protein  40.46 
 
 
224 aa  113  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144678  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4402  ankyrin repeat-containing protein  35.84 
 
 
196 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1958  Ankyrin  33.33 
 
 
234 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1663  FOG: Ankyrin repeat protein  42.44 
 
 
285 aa  112  6e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.10004 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4788  ankyrin repeat domain protein  35.84 
 
 
196 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4419  ankyrin repeat-containing protein  35.84 
 
 
196 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4567  ankyrin repeat-containing protein  35.63 
 
 
226 aa  111  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.928226  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4922  ankyrin repeat-containing protein  35.84 
 
 
196 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.573974  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00274  predicted transcriptional regulator with ankyrin domain  34.76 
 
 
201 aa  109  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.528097  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3288  Ankyrin  34.76 
 
 
201 aa  109  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3305  ankyrin  34.76 
 
 
201 aa  109  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00277  hypothetical protein  34.76 
 
 
201 aa  109  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.568599  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0337  ankyrin repeat-containing protein  34.76 
 
 
201 aa  109  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0493  ankyrin  36.02 
 
 
254 aa  108  6e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0379  ankyrin repeat-containing protein  34.22 
 
 
201 aa  108  8.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.89591  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0600  ankyrin repeat domain protein  34.05 
 
 
277 aa  107  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3145  ankyrin  31.89 
 
 
201 aa  107  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000605686  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0533  ankyrin repeat-containing protein  33.16 
 
 
231 aa  107  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0564  ankyrin repeat-containing protein  33.16 
 
 
207 aa  107  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0382  ankyrin repeat protein  34.22 
 
 
201 aa  106  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.415795 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0349  ankyrin repeat-containing protein  33.69 
 
 
201 aa  106  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4739  ankyrin repeat domain protein  33.51 
 
 
289 aa  106  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0620  ankyrin repeat domain protein  33.16 
 
 
289 aa  106  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0626  ankyrin repeat-containing protein  33.16 
 
 
255 aa  105  6e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0475  ankyrin repeat-containing protein  33.16 
 
 
249 aa  105  8e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.498558  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0694  ankyrin repeat domain protein  32.97 
 
 
290 aa  104  9e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0477  ankyrin repeat-containing protein  33.16 
 
 
255 aa  104  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0477  ankyrin repeat-containing protein  32.43 
 
 
290 aa  103  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2944  Ankyrin  38.15 
 
 
455 aa  101  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000965114  hitchhiker  0.000150553 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0645  Ankyrin  38.19 
 
 
240 aa  95.1  8e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0488  ankyrin  40.28 
 
 
176 aa  90.1  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.826028  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3814  Ankyrin  37.27 
 
 
173 aa  85.9  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00523851 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1435  hypothetical protein  31.05 
 
 
1585 aa  82  0.000000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.015567 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  33.84 
 
 
2413 aa  79.7  0.00000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2632  Ankyrin  25.93 
 
 
210 aa  75.9  0.0000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000031209  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0219  Ankyrin  26.58 
 
 
382 aa  73.9  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.41533e-20  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08304  conserved hypothetical protein  27.18 
 
 
1198 aa  72  0.000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0000526329 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0976  Ankyrin  35.47 
 
 
395 aa  72  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.157423  normal  0.476091 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08019  Pfs, NACHT and Ankyrin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G01020)  33.51 
 
 
1156 aa  71.2  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.596222  hitchhiker  0.00162932 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01130  conserved hypothetical protein  29.71 
 
 
1030 aa  71.2  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.329359  normal  0.12831 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2199  ankyrin repeat-containing protein  36.93 
 
 
442 aa  70.9  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1284  ankyrin  33.33 
 
 
870 aa  69.3  0.00000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.226002  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1610  hypothetical protein  27.8 
 
 
4520 aa  69.3  0.00000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1229  hypothetical protein  29.86 
 
 
1249 aa  68.6  0.00000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0154751 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2151  Ankyrin  31.25 
 
 
490 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.712677 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4314  ankyrin  34.18 
 
 
426 aa  68.2  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327235  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_5133  predicted protein  30.69 
 
 
184 aa  66.6  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.648247  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0498  ankyrin repeat-containing protein  27.13 
 
 
335 aa  67  0.0000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14960  Ankyrin  26.87 
 
 
483 aa  66.2  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000388228  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2380  hypothetical protein  27.48 
 
 
305 aa  65.5  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.691759  normal  0.155983 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0363  hypothetical protein  31.36 
 
 
2171 aa  64.3  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.082224 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0911  hypothetical protein  27.07 
 
 
931 aa  64.7  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0380613 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0703  hypothetical protein  32.16 
 
 
762 aa  64.7  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0871  hypothetical protein  29.65 
 
 
646 aa  64.3  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.985956 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0519  hypothetical protein  31.28 
 
 
278 aa  65.1  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.682563 
 
 
-
 
NC_002978  WD0766  ankyrin repeat-containing protein  29.29 
 
 
474 aa  63.9  0.000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.705844  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3006  ankyrin  28.08 
 
 
222 aa  64.3  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0898  ankyrin  28.65 
 
 
450 aa  63.5  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.0000205657  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08085  conserved hypothetical protein  31.75 
 
 
1021 aa  62.8  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.130443  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1000  ankyrin  31.4 
 
 
494 aa  62.4  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0225  hypothetical protein  29.31 
 
 
423 aa  62.4  0.000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.728925 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0582  ankyrin  31.96 
 
 
344 aa  62  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0385  ankyrin repeat-containing protein  26.7 
 
 
542 aa  62  0.000000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.317443  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0291  ankyrin repeat-containing prophage LambdaW1  24.88 
 
 
224 aa  61.6  0.00000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.461089  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4090  hypothetical protein  30.85 
 
 
427 aa  61.6  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0909  hypothetical protein  25.34 
 
 
865 aa  61.6  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.122525 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1153  hypothetical protein  28 
 
 
811 aa  61.2  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0738  hypothetical protein  29.91 
 
 
1005 aa  60.5  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0550  ankyrin repeat-containing protein  30.46 
 
 
329 aa  60.8  0.00000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0382  ankyrin repeat protein  26.94 
 
 
891 aa  60.5  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0393  hypothetical protein  31.55 
 
 
821 aa  60.1  0.00000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1348  Ankyrin  26.78 
 
 
345 aa  60.1  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1221  hypothetical protein  28.44 
 
 
472 aa  60.1  0.00000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0622  Ankyrin  28.14 
 
 
711 aa  59.7  0.00000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  28.57 
 
 
731 aa  59.3  0.00000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_002978  WD0294  ankyrin repeat-containing protein  28.3 
 
 
541 aa  58.9  0.00000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.365976  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1797  ankyrin repeat-containing protein  27.27 
 
 
483 aa  58.9  0.00000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08767  ankyrin repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_3G02830)  32.2 
 
 
855 aa  58.5  0.00000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0941887  normal  0.535904 
 
 
-
 
NC_002978  WD0035  ankyrin repeat-containing protein  31.69 
 
 
288 aa  58.2  0.0000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3439  ankyrin  30.6 
 
 
337 aa  58.2  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41623  hitchhiker  0.000120862 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>