More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_00274 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010468  EcolC_3305  ankyrin  100 
 
 
201 aa  408  1e-113  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0337  ankyrin repeat-containing protein  100 
 
 
201 aa  408  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00274  predicted transcriptional regulator with ankyrin domain  100 
 
 
201 aa  408  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.528097  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3288  Ankyrin  100 
 
 
201 aa  408  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00277  hypothetical protein  100 
 
 
201 aa  408  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.568599  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0379  ankyrin repeat-containing protein  99.5 
 
 
201 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.89591  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0382  ankyrin repeat protein  99.5 
 
 
201 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.415795 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0349  ankyrin repeat-containing protein  96.52 
 
 
201 aa  394  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3145  ankyrin  67.66 
 
 
201 aa  292  2e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000605686  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1958  Ankyrin  41.84 
 
 
234 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4788  ankyrin repeat domain protein  42.25 
 
 
196 aa  159  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4419  ankyrin repeat-containing protein  42.25 
 
 
196 aa  159  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4567  ankyrin repeat-containing protein  40.82 
 
 
226 aa  159  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.928226  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4922  ankyrin repeat-containing protein  42.25 
 
 
196 aa  159  4e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.573974  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4783  ankyrin repeat domain protein  40.31 
 
 
226 aa  158  6e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0456  ankyrin repeat domain protein  41.18 
 
 
196 aa  156  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0121916 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0493  ankyrin  43.46 
 
 
254 aa  155  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4402  ankyrin repeat-containing protein  41.18 
 
 
196 aa  155  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2741  hypothetical protein  43.01 
 
 
210 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4250  ankyrin  41.27 
 
 
237 aa  148  4e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.379983 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0925  conserved hypothetical protein; ankyrin repeateat; putative exported protein  44.44 
 
 
224 aa  149  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144678  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32350  hypothetical protein  41.88 
 
 
210 aa  148  7e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.234736  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0071  ankyrin repeat-containing protein  40.74 
 
 
224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0477  ankyrin repeat-containing protein  40.3 
 
 
290 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3569  ankyrin  40.31 
 
 
227 aa  142  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00419939 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2944  Ankyrin  43.43 
 
 
455 aa  141  8e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000965114  hitchhiker  0.000150553 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4030  Ankyrin  39.38 
 
 
221 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.147969 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0620  ankyrin repeat domain protein  38.31 
 
 
289 aa  138  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0533  ankyrin repeat-containing protein  38.31 
 
 
231 aa  138  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0564  ankyrin repeat-containing protein  39.06 
 
 
207 aa  137  7.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0626  ankyrin repeat-containing protein  38.31 
 
 
255 aa  137  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0600  ankyrin repeat domain protein  38.81 
 
 
277 aa  137  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0475  ankyrin repeat-containing protein  38.31 
 
 
249 aa  136  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.498558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0477  ankyrin repeat-containing protein  38.31 
 
 
255 aa  136  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0824  ankyrin  37.37 
 
 
266 aa  136  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132529  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0694  ankyrin repeat domain protein  37.81 
 
 
290 aa  135  5e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4739  ankyrin repeat domain protein  38.31 
 
 
289 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2634  ankyrin  38.54 
 
 
269 aa  134  6.0000000000000005e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0366745  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2345  Ankyrin  40.21 
 
 
233 aa  134  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1283  ankyrin  38.89 
 
 
214 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27436  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2388  ankyrin  38.5 
 
 
217 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.751385 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0781  aankyrin repeat-containing protein  38.54 
 
 
261 aa  129  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.150495  normal  0.0323069 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0728  Ankyrin  37.7 
 
 
264 aa  128  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.365587  normal  0.800826 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0798  aankyrin repeat-containing protein  37.17 
 
 
264 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234452  normal  0.451941 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3814  Ankyrin  41.89 
 
 
173 aa  125  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00523851 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0149  ankyrin  37.23 
 
 
237 aa  124  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4103  ankyrin  36.32 
 
 
238 aa  120  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2632  Ankyrin  32.99 
 
 
210 aa  116  1.9999999999999998e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000031209  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3296  ankyrin  37.7 
 
 
254 aa  115  3.9999999999999997e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.172473 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1663  FOG: Ankyrin repeat protein  38.29 
 
 
285 aa  114  8.999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.10004 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0645  Ankyrin  39.73 
 
 
240 aa  108  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0488  ankyrin  40.41 
 
 
176 aa  107  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.826028  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2793  Ankyrin  34.76 
 
 
232 aa  101  7e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176695  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08019  Pfs, NACHT and Ankyrin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G01020)  30.59 
 
 
1156 aa  94  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.596222  hitchhiker  0.00162932 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1435  hypothetical protein  33.16 
 
 
1585 aa  94  1e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.015567 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0363  hypothetical protein  32.8 
 
 
2171 aa  87.4  1e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.082224 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  28.5 
 
 
1402 aa  86.3  3e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1000  ankyrin  33.53 
 
 
494 aa  83.2  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4314  ankyrin  30.89 
 
 
426 aa  83.6  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327235  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01130  conserved hypothetical protein  30.16 
 
 
1030 aa  82.8  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.329359  normal  0.12831 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0219  Ankyrin  29.32 
 
 
382 aa  82.4  0.000000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.41533e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3439  ankyrin  29.52 
 
 
337 aa  80.5  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41623  hitchhiker  0.000120862 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4090  hypothetical protein  29.38 
 
 
427 aa  79.3  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2151  Ankyrin  27.73 
 
 
490 aa  79  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.712677 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0395  Ankyrin  30.32 
 
 
640 aa  78.6  0.00000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2380  hypothetical protein  34.09 
 
 
305 aa  77.4  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.691759  normal  0.155983 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1348  Ankyrin  27.98 
 
 
345 aa  77  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3006  ankyrin  27.98 
 
 
222 aa  77  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08767  ankyrin repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_3G02830)  29.57 
 
 
855 aa  76.3  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0941887  normal  0.535904 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  29.84 
 
 
2413 aa  74.7  0.0000000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2896  ankyrin-related protein  29.32 
 
 
346 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0385  ankyrin repeat-containing protein  27.95 
 
 
542 aa  73.9  0.000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.317443  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1221  hypothetical protein  29.1 
 
 
472 aa  73.6  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0976  Ankyrin  31.25 
 
 
395 aa  73.2  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.157423  normal  0.476091 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2661  ankyrin  29.79 
 
 
287 aa  73.2  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0806598 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0703  hypothetical protein  25.23 
 
 
762 aa  73.2  0.000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0428  Ankyrin  23.73 
 
 
222 aa  70.9  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0294  ankyrin repeat-containing protein  32.28 
 
 
541 aa  70.9  0.00000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.365976  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0738  hypothetical protein  28 
 
 
1005 aa  70.9  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0458  Ankyrin  29.69 
 
 
161 aa  70.5  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510961  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14960  Ankyrin  26.42 
 
 
483 aa  70.5  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000388228  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3262  Ankyrin  30.13 
 
 
163 aa  70.1  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00689099  normal  0.0238683 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0228  hypothetical protein  28.96 
 
 
750 aa  70.1  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.871268 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08085  conserved hypothetical protein  31.94 
 
 
1021 aa  69.7  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.130443  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_5133  predicted protein  27.96 
 
 
184 aa  69.7  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.648247  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0393  hypothetical protein  30.5 
 
 
821 aa  69.3  0.00000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5420  ankyrin  28.02 
 
 
274 aa  69.3  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1096  ankyrin  28.57 
 
 
1061 aa  68.9  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0912242  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1380  ankyrin  29.53 
 
 
216 aa  68.9  0.00000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1284  ankyrin  28.14 
 
 
870 aa  68.2  0.00000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.226002  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3384  ankyrin  27.36 
 
 
293 aa  68.2  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.251078 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0898  ankyrin  26.67 
 
 
450 aa  67.4  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.0000205657  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2515  ankyrin  30.39 
 
 
223 aa  67.8  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0959438  normal  0.0106396 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0909  hypothetical protein  30 
 
 
865 aa  67.4  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.122525 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0849  hypothetical protein  26.56 
 
 
723 aa  67.4  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.048411 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0099  Ankyrin  29.35 
 
 
230 aa  66.2  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.5207100000000002e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0519  hypothetical protein  31.61 
 
 
278 aa  66.2  0.0000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.682563 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  27.03 
 
 
731 aa  66.2  0.0000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3104  ankyrin  29.79 
 
 
574 aa  65.9  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.519115 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1450  Ankyrin  24.86 
 
 
253 aa  65.5  0.0000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>