More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2634 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2634  ankyrin  100 
 
 		 269 aa  529  1e-149  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0366745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0824  ankyrin  74.54 
 
 		 266 aa  383  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132529  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1283  ankyrin  57.63 
 
 		 214 aa  196  3e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27436  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0798  aankyrin repeat-containing protein  54.15 
 
 		 264 aa  195  6e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234452  normal  0.451941 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0781  aankyrin repeat-containing protein  54.36 
 
 		 261 aa  195  7e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.150495  normal  0.0323069 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0728  Ankyrin  53.66 
 
 		 264 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.365587  normal  0.800826 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0071  ankyrin repeat-containing protein  55.15 
 
 		 224 aa  189  5e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3569  ankyrin  52.31 
 
 		 227 aa  185  8e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419939 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4030  Ankyrin  47.34 
 
 		 221 aa  176  4e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.147969 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2388  ankyrin  50 
 
 		 217 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.751385 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4250  ankyrin  48.53 
 
 		 237 aa  173  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.379983 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2345  Ankyrin  51.78 
 
 		 233 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32350  hypothetical protein  50.79 
 
 		 210 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.234736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2741  hypothetical protein  50 
 
 		 210 aa  168  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1958  Ankyrin  44.74 
 
 		 234 aa  166  4e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0493  ankyrin  42.13 
 
 		 254 aa  165  8e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4783  ankyrin repeat domain protein  41.92 
 
 		 226 aa  165  8e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4402  ankyrin repeat-containing protein  43.01 
 
 		 196 aa  163  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4567  ankyrin repeat-containing protein  42.5 
 
 		 226 aa  162  6e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.928226  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0456  ankyrin repeat domain protein  42.86 
 
 		 196 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0121916 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4788  ankyrin repeat domain protein  43.52 
 
 		 196 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4419  ankyrin repeat-containing protein  43.01 
 
 		 196 aa  160  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4922  ankyrin repeat-containing protein  43.52 
 
 		 196 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.573974  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3296  ankyrin  46.03 
 
 		 254 aa  156  4e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.172473 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1663  FOG: Ankyrin repeat protein  46.55 
 
 		 285 aa  149  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.10004 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0477  ankyrin repeat-containing protein  38.74 
 
 		 290 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0600  ankyrin repeat domain protein  39.27 
 
 		 277 aa  145  6e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4739  ankyrin repeat domain protein  38.74 
 
 		 289 aa  144  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0626  ankyrin repeat-containing protein  38.27 
 
 		 255 aa  142  8e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0694  ankyrin repeat domain protein  37.7 
 
 		 290 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0620  ankyrin repeat domain protein  38.27 
 
 		 289 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0475  ankyrin repeat-containing protein  38.27 
 
 		 249 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.498558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0477  ankyrin repeat-containing protein  38.27 
 
 		 255 aa  139  6e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0533  ankyrin repeat-containing protein  37.76 
 
 		 231 aa  138  7.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0925  conserved hypothetical protein; ankyrin repeateat; putative exported protein  43.72 
 
 		 224 aa  138  8.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0564  ankyrin repeat-containing protein  37.76 
 
 		 207 aa  138  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0349  ankyrin repeat-containing protein  38.46 
 
 		 201 aa  136  4e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2944  Ankyrin  42.29 
 
 		 455 aa  135  5e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000965114  hitchhiker  0.000150553 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0379  ankyrin repeat-containing protein  38.54 
 
 		 201 aa  135  9e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.89591  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0337  ankyrin repeat-containing protein  38.54 
 
 		 201 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00274  predicted transcriptional regulator with ankyrin domain  38.54 
 
 		 201 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.528097  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3288  Ankyrin  38.54 
 
 		 201 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3305  ankyrin  38.54 
 
 		 201 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00277  hypothetical protein  38.54 
 
 		 201 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.568599  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0382  ankyrin repeat protein  38.54 
 
 		 201 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.415795 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3145  ankyrin  36.32 
 
 		 201 aa  133  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000605686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4103  ankyrin  41.58 
 
 		 238 aa  129  7.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0149  ankyrin  43.16 
 
 		 237 aa  128  8.000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2793  Ankyrin  45.21 
 
 		 232 aa  125  7e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176695  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0645  Ankyrin  46.15 
 
 		 240 aa  124  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0488  ankyrin  44.97 
 
 		 176 aa  123  4e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.826028  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3814  Ankyrin  41.46 
 
 		 173 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00523851 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08019  Pfs, NACHT and Ankyrin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G01020)  39.04 
 
 		 1156 aa  113  4.0000000000000004e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.596222  hitchhiker  0.00162932 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4314  ankyrin  38.83 
 
 		 426 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2380  hypothetical protein  36.55 
 
 		 305 aa  104  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.691759  normal  0.155983 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  37.84 
 
 		 2413 aa  102  5e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2632  Ankyrin  31.22 
 
 		 210 aa  100  3e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000031209  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01130  conserved hypothetical protein  34.76 
 
 		 1030 aa  99.4  5e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.329359  normal  0.12831 
 
 
-
 
NC_002978  WD0514  ankyrin repeat-containing protein  35.64 
 
 		 469 aa  99.4  5e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.919326  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0219  Ankyrin  37.42 
 
 		 382 aa  99.4  5e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.41533e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1435  hypothetical protein  32.8 
 
 		 1585 aa  95.9  7e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.015567 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1887  ankyrin  34.22 
 
 		 321 aa  95.5  8e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.959203 
 
 
-
 
NC_002978  WD0147  ankyrin repeat-containing protein  32.45 
 
 		 954 aa  95.1  1e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4090  hypothetical protein  34.02 
 
 		 427 aa  92.4  6e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2498  ankyrin  32.13 
 
 		 479 aa  92  9e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0363  hypothetical protein  31.09 
 
 		 2171 aa  92  1e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.082224 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2151  Ankyrin  34.92 
 
 		 490 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.712677 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14960  Ankyrin  32.2 
 
 		 483 aa  90.9  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000388228  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5572  Ankyrin  39.85 
 
 		 157 aa  89.7  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.43275  normal  0.999489 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2661  ankyrin  34.59 
 
 		 287 aa  89.4  6e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0806598 
 
 
-
 
NC_002978  WD0294  ankyrin repeat-containing protein  31.36 
 
 		 541 aa  88.2  1e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.365976  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0898  ankyrin  32.11 
 
 		 450 aa  88.2  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.0000205657  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08767  ankyrin repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_3G02830)  35.05 
 
 		 855 aa  87.8  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0941887  normal  0.535904 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0418  Ankyrin  29.79 
 
 		 544 aa  85.9  7e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3439  ankyrin  36.96 
 
 		 337 aa  85.5  7e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41623  hitchhiker  0.000120862 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1347  Ankyrin  28.87 
 
 		 404 aa  85.1  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0636  hypothetical protein  28.1 
 
 		 545 aa  84  0.000000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2318  Ankyrin  32.09 
 
 		 217 aa  84  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0976  Ankyrin  34.57 
 
 		 395 aa  83.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.157423  normal  0.476091 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0703  hypothetical protein  33.54 
 
 		 762 aa  83.6  0.000000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0385  ankyrin repeat-containing protein  29.57 
 
 		 542 aa  83.2  0.000000000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.317443  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0849  hypothetical protein  31.69 
 
 		 723 aa  82.8  0.000000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.048411 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1284  ankyrin  36.16 
 
 		 870 aa  82.4  0.000000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.226002  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1096  ankyrin  32.8 
 
 		 1061 aa  82  0.000000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0912242  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  31.1 
 
 		 1402 aa  81.6  0.00000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1450  Ankyrin  30.77 
 
 		 253 aa  80.9  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1229  hypothetical protein  28.96 
 
 		 1249 aa  80.9  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0154751 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5420  ankyrin  34.39 
 
 		 274 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0582  ankyrin  32.84 
 
 		 344 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0911  hypothetical protein  32.32 
 
 		 931 aa  79.3  0.00000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0380613 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0395  Ankyrin  30.53 
 
 		 640 aa  79  0.00000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0471  Ankyrin  27.08 
 
 		 249 aa  78.6  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0458  Ankyrin  36.09 
 
 		 161 aa  78.2  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0393  hypothetical protein  35.14 
 
 		 821 aa  78.2  0.0000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1453  TPR domain-containing protein  27.72 
 
 		 344 aa  78.6  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000157912  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1380  ankyrin  30.93 
 
 		 216 aa  78.2  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0738  hypothetical protein  31.72 
 
 		 1005 aa  77  0.0000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08304  conserved hypothetical protein  29.72 
 
 		 1198 aa  77  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0000526329 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1000  ankyrin  31.23 
 
 		 494 aa  77  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08085  conserved hypothetical protein  37.42 
 
 		 1021 aa  76.6  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.130443  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>