More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06569 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06569  hypothetical protein  100 
 
 		 311 aa  621  1e-177  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000693  hypothetical protein  90 
 
 		 215 aa  363  2e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1275  hypothetical protein  52.14 
 
 		 286 aa  292  6e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.111691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1221  hypothetical protein  51.79 
 
 		 286 aa  290  1e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308964 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3812  hypothetical protein  46.55 
 
 		 323 aa  255  6e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1335  hypothetical protein  39.16 
 
 		 302 aa  226  4e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.83359  hitchhiker  0.000108954 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00760  hypothetical protein  42.14 
 
 		 284 aa  208  8e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2143  drug/metabolite exporter family protein  42.28 
 
 		 297 aa  196  6e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000798469  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0408  integral membrane protein  42.31 
 
 		 289 aa  189  4e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00379615  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0385  hypothetical protein  34.6 
 
 		 291 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3696  hypothetical protein  34.38 
 
 		 307 aa  178  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3884  hypothetical protein  36.12 
 
 		 306 aa  177  1e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.288513 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4255  hypothetical protein  35.64 
 
 		 295 aa  176  5e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121997 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0257  hypothetical protein  35.36 
 
 		 306 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4073  hypothetical protein  35 
 
 		 294 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0296  integral membrane domain-containing protein  35.36 
 
 		 307 aa  172  5e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4191  hypothetical protein  34.86 
 
 		 294 aa  172  5e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3688  hypothetical protein  35.36 
 
 		 306 aa  172  5e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3993  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.64 
 
 		 294 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4103  hypothetical protein  34.51 
 
 		 294 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3358  integral membrane domain-containing protein  36.86 
 
 		 290 aa  166  4e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0248  hypothetical protein  35.07 
 
 		 294 aa  158  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0223  hypothetical protein  35.14 
 
 		 289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.877306  normal  0.333334 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1083  integral membrane domain-containing protein  28.67 
 
 		 290 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.739829  normal  0.417186 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2769  hypothetical protein  29.86 
 
 		 283 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0260023  normal  0.123404 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2871  hypothetical protein  29.86 
 
 		 283 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0538592  hitchhiker  0.00207422 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2701  hypothetical protein  28.83 
 
 		 283 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00447474  hitchhiker  0.0000895819 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  27.5 
 
 		 315 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1569  integral membrane domain-containing protein  29.93 
 
 		 283 aa  98.2  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1388  hypothetical protein  30.6 
 
 		 283 aa  98.2  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2971  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.94 
 
 		 283 aa  97.4  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.111815 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1411  hypothetical protein  29.03 
 
 		 283 aa  97.1  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.325978 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1372  hypothetical protein  29.03 
 
 		 283 aa  97.1  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.601004  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2443  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.08 
 
 		 314 aa  95.5  9e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3253  hypothetical protein  28.25 
 
 		 310 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1583  hypothetical protein  29.86 
 
 		 302 aa  92.8  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0899842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  27.61 
 
 		 324 aa  88.2  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2646  hypothetical protein  29.1 
 
 		 318 aa  87  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0908  hypothetical protein  28.28 
 
 		 300 aa  86.7  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144384  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0643  hypothetical protein  26.89 
 
 		 312 aa  86.3  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254759  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4050  membrane protein  26.89 
 
 		 317 aa  85.9  8e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.146235  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0987  RarD family transporter  28.76 
 
 		 318 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0714  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.76 
 
 		 322 aa  83.6  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3378  hypothetical protein  26.4 
 
 		 314 aa  83.6  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.804952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2376  hypothetical protein  28.33 
 
 		 317 aa  82.4  0.000000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545392 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4025  hypothetical protein  29.43 
 
 		 274 aa  80.9  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.651718  normal  0.814245 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3305  protein of unknown function DUF6  28.43 
 
 		 313 aa  80.9  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  25.56 
 
 		 317 aa  80.9  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3761  hypothetical protein  27.34 
 
 		 318 aa  80.5  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0237  hypothetical protein  29.67 
 
 		 279 aa  80.9  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0649  hypothetical protein  26.49 
 
 		 305 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1559  hypothetical protein  28.04 
 
 		 316 aa  80.5  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0441  hypothetical protein  25.83 
 
 		 317 aa  79.7  0.00000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.406892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2509  hypothetical protein  26.44 
 
 		 333 aa  78.6  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.126674  normal  0.276837 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1899  hypothetical protein  26.42 
 
 		 324 aa  77.8  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.172476  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2883  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.52 
 
 		 318 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.750898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3713  hypothetical protein  28.32 
 
 		 307 aa  77  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.991979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0570  hypothetical protein  28.2 
 
 		 314 aa  76.6  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2071  hypothetical protein  29.86 
 
 		 297 aa  76.6  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2483  hypothetical protein  28.11 
 
 		 288 aa  75.9  0.0000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.941945  normal  0.050629 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4826  hypothetical protein  28.52 
 
 		 307 aa  74.7  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0364  RarD family protein  28.43 
 
 		 307 aa  74.7  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2006  hypothetical protein  28.43 
 
 		 307 aa  74.7  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.353305  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.55 
 
 		 325 aa  74.3  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1169  hypothetical protein  27.13 
 
 		 315 aa  73.2  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.841455 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0870  hypothetical protein  31.86 
 
 		 347 aa  72.8  0.000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0477491 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1004  putative transmembrane protein  28.06 
 
 		 301 aa  72.4  0.000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.583779  hitchhiker  0.00109211 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.47 
 
 		 305 aa  72.8  0.000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1379  permease  24.83 
 
 		 317 aa  72  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139732  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2932  permease  23.23 
 
 		 342 aa  72  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1133  hypothetical protein  30.1 
 
 		 294 aa  72  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000153397  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2944  hypothetical protein  25.28 
 
 		 311 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1081  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.93 
 
 		 312 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2148  putative S-adenosylmethionine uptake transporter  29.31 
 
 		 296 aa  71.2  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.820998 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2120  hypothetical protein  25.74 
 
 		 317 aa  70.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.495986 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.26 
 
 		 305 aa  71.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0743422  hitchhiker  0.00836248 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2345  hypothetical protein  25.77 
 
 		 303 aa  70.9  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.182301  normal  0.806351 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1859  hypothetical protein  22.22 
 
 		 285 aa  70.1  0.00000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103759 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4189  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.73 
 
 		 313 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1388  hypothetical protein  24.46 
 
 		 337 aa  70.5  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0880  hypothetical protein  28.95 
 
 		 307 aa  70.1  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07041  integral membrane protein, DUF6  27.72 
 
 		 295 aa  70.1  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0828931  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3918  hypothetical protein  27.66 
 
 		 285 aa  69.7  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0175  hypothetical protein  28.67 
 
 		 281 aa  69.7  0.00000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.812407  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2623  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.9 
 
 		 318 aa  69.3  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.876782 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0929  hypothetical protein  28.26 
 
 		 297 aa  68.9  0.00000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0374563 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1711  RhaT family protein  26.79 
 
 		 308 aa  68.9  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.466454  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.7 
 
 		 294 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0427978  normal  0.17643 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1983  hypothetical protein  28.7 
 
 		 323 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3870  hypothetical protein  27.15 
 
 		 309 aa  68.6  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.320842 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1998  hypothetical protein  28.7 
 
 		 299 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.746729  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.35 
 
 		 301 aa  68.9  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2517  hypothetical protein  25.44 
 
 		 317 aa  67.8  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0858  RhaT family transporter  25.44 
 
 		 317 aa  67.8  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2661  hypothetical protein  25.1 
 
 		 319 aa  68.2  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3486  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.35 
 
 		 298 aa  68.2  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0751  hypothetical protein  24.91 
 
 		 313 aa  68.2  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.27541 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2046  hypothetical protein  28.57 
 
 		 323 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.782897  normal  0.0300532 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0830  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.54 
 
 		 333 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0617  hypothetical protein  26.24 
 
 		 338 aa  67.4  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>