194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05696 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05696  hypothetical protein  100 
 
 		 356 aa  704    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000082  permease  89.33 
 
 		 386 aa  631  1e-180  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0172441  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0691  hypothetical protein  64.51 
 
 		 384 aa  469  1.0000000000000001e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.256683  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1918  MFS transporter  58.59 
 
 		 386 aa  410  1e-113  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000771845  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4270  major facilitator transporter  48.15 
 
 		 390 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0689  transport protein of the major facilitator  46.72 
 
 		 389 aa  312  5.999999999999999e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3325  major facilitator transporter  47.85 
 
 		 389 aa  309  5e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3634  major facilitator transporter  49.58 
 
 		 389 aa  299  6e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0452  major facilitator transporter  47.08 
 
 		 390 aa  289  6e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0448  major facilitator transporter  47.66 
 
 		 390 aa  287  2e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0450  major facilitator family protein  46.74 
 
 		 387 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3577  major facilitator transporter  46.78 
 
 		 390 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3835  major facilitator superfamily MFS_1  46.2 
 
 		 388 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4031  major facilitator transporter  46.2 
 
 		 388 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3908  major facilitator transporter  46.2 
 
 		 388 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0425  major facilitator transporter  46.2 
 
 		 388 aa  257  2e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3394  major facilitator transporter  46.89 
 
 		 388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0414  transporter, MFS superfamily  34.09 
 
 		 411 aa  159  1e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.50103  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2592  putative MFS family transporter protein  32.4 
 
 		 382 aa  156  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2680  putative MFS family transporter protein  32.4 
 
 		 382 aa  156  6e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2221  putative MFS family transporter protein  31.55 
 
 		 382 aa  152  8e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.707303 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0975  putative MFS family transporter protein  31.55 
 
 		 382 aa  152  8e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1061  putative MFS family transporter protein  31.55 
 
 		 382 aa  152  8e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1991  putative MFS family transporter protein  31.83 
 
 		 384 aa  152  8e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00902  putative MFS family transporter protein  31.55 
 
 		 382 aa  152  8.999999999999999e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.90322  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2745  major facilitator superfamily MFS_1  31.55 
 
 		 382 aa  152  8.999999999999999e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00909  hypothetical protein  31.55 
 
 		 382 aa  152  8.999999999999999e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.80551  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2698  putative MFS family transporter protein  31.55 
 
 		 382 aa  152  8.999999999999999e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1004  putative MFS family transporter protein  31.55 
 
 		 382 aa  152  8.999999999999999e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1066  putative MFS family transporter protein  34.25 
 
 		 382 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0109071  normal  0.857423 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0972  putative MFS family transporter protein  34.25 
 
 		 382 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1001  putative MFS family transporter protein  34.25 
 
 		 382 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1081  putative MFS family transporter protein  34.25 
 
 		 382 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1032  putative MFS family transporter protein  34.74 
 
 		 382 aa  150  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1723  putative MFS family transporter protein  30.79 
 
 		 384 aa  150  4e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2783  major facilitator transporter  30.86 
 
 		 431 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2175  normal  0.236028 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2247  putative MFS family transporter protein  31.3 
 
 		 396 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2491  major facilitator transporter  30.86 
 
 		 430 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.216953 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2348  putative MFS family transporter protein  31.37 
 
 		 382 aa  144  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.883707  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1421  putative MFS family transporter protein  31.46 
 
 		 382 aa  142  9e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2384  major facilitator transporter  32.63 
 
 		 436 aa  139  6e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000340178 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1700  putative MFS family transporter protein  30.06 
 
 		 381 aa  139  7.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.289125 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2641  major facilitator transporter  30.86 
 
 		 432 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3082  major facilitator superfamily MFS_1  30.86 
 
 		 454 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.359884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2954  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 412 aa  136  4e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.126979 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3013  major facilitator transporter  29.87 
 
 		 409 aa  126  6e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.382215  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0020  putative MFS family transporter protein  28.13 
 
 		 384 aa  126  6e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0226  major facilitator transporter  27.71 
 
 		 446 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.200681  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0155  major facilitator superfamily MFS_1  27.64 
 
 		 436 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0204  major facilitator transporter  25.45 
 
 		 425 aa  110  5e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0739  major facilitator transporter  25.94 
 
 		 480 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000634429  hitchhiker  0.000161748 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0685  major facilitator transporter  25.68 
 
 		 476 aa  108  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000174953  hitchhiker  0.000330115 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3112  hypothetical protein  24.69 
 
 		 520 aa  107  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0751652 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0730  major facilitator superfamily MFS_1  25.65 
 
 		 480 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000305807  hitchhiker  0.0000000180087 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3262  major facilitator transporter  25.38 
 
 		 476 aa  107  4e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000595189  hitchhiker  0.0000189305 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3645  major facilitator transporter  25.65 
 
 		 480 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000051219  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0709  major facilitator transporter  25.65 
 
 		 480 aa  106  5e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0602177  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0618  major facilitator family transporter  27.4 
 
 		 418 aa  106  7e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0419  major facilitator superfamily MFS_1  26.74 
 
 		 417 aa  105  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0619  major facilitator family transporter  27.4 
 
 		 418 aa  105  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.425561  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3933  hypothetical protein  27 
 
 		 474 aa  104  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0751  major facilitator transporter  25.87 
 
 		 481 aa  105  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0105844  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0513  major facilitator transporter  24.33 
 
 		 459 aa  103  4e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3143  major facilitator transporter  27.57 
 
 		 471 aa  102  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.385711 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3353  major facilitator transporter  26.01 
 
 		 474 aa  102  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00730717  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1591  MFS permease  28.96 
 
 		 411 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.37561  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1740  transporter, putative  27.96 
 
 		 412 aa  101  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.138078  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0699  major facilitator transporter  24.47 
 
 		 474 aa  100  5e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000337729  hitchhiker  0.00021718 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1813  major facilitator superfamiy transporter  26.36 
 
 		 429 aa  99.8  6e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.284415 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0801  major facilitator transporter  30.65 
 
 		 411 aa  99.8  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.419426 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5368  major facilitator family transporter  29.14 
 
 		 385 aa  99.4  9e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0839  major facilitator transporter  28.06 
 
 		 464 aa  98.2  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.673129  hitchhiker  0.000450742 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2660  major facilitator transporter  25.61 
 
 		 417 aa  98.6  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3922  major facilitator transporter  26.35 
 
 		 444 aa  97.8  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1849  major facilitator transporter  25.93 
 
 		 418 aa  98.2  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.513333 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3528  major facilitator transporter  24.18 
 
 		 428 aa  98.2  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000328166  normal  0.125095 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1681  putative transporter  27.66 
 
 		 412 aa  97.4  3e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2043  major facilitator family transporter  26.17 
 
 		 397 aa  97.1  4e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0203  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 443 aa  97.1  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.371325  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0112  major facilitator superfamily transporter  25.37 
 
 		 427 aa  97.4  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1172  major facilitator transporter  27.13 
 
 		 412 aa  95.1  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1427  major facilitator superfamily MFS_1  26.95 
 
 		 430 aa  95.9  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0091  major facilitator transporter  27 
 
 		 471 aa  95.1  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1094  major facilitator transporter  26.88 
 
 		 424 aa  93.6  5e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0929  major facilitator transporter  24.75 
 
 		 415 aa  93.2  6e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1922  major facilitator family transporter  26.5 
 
 		 465 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.628163  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2706  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  28.38 
 
 		 404 aa  91.3  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1547  major facilitator transporter  24.68 
 
 		 447 aa  90.9  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3408  major facilitator transporter  27.44 
 
 		 433 aa  90.1  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0903  major facilitator transporter  26.02 
 
 		 446 aa  89.7  6e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3242  major facilitator transporter  26.02 
 
 		 446 aa  89.7  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3377  major facilitator transporter  26.02 
 
 		 446 aa  89.7  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4258  major facilitator transporter  25.16 
 
 		 452 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2970  major facilitator transporter  24.19 
 
 		 418 aa  89.7  7e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1616  major facilitator transporter  24.19 
 
 		 418 aa  89.7  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0546554 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1775  hypothetical protein  26.09 
 
 		 434 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.359075  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0576  major facilitator superfamily transporter  24.93 
 
 		 398 aa  89.4  9e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20680  putative MFS transporter  26.09 
 
 		 434 aa  89.4  9e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64590  putative MFS transporter  26.37 
 
 		 438 aa  89  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0510632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01548  transmembrane transport protein  26.89 
 
 		 412 aa  88.2  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>