88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000671 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000671  SAM-dependent methyltransferase  100 
 
 		 195 aa  411  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.190195  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06550  dimethyladenosine transferase  67.69 
 
 		 195 aa  296  1e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4807  Methyltransferase type 12  32.64 
 
 		 205 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5280  methyltransferase type 12  31.82 
 
 		 207 aa  101  6e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.680539 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0609  Methyltransferase type 12  34.16 
 
 		 202 aa  99  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.763515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6048  methyltransferase type 11  32.11 
 
 		 217 aa  96.3  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19889  normal  0.724013 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31140  methyltransferase family protein  36.14 
 
 		 179 aa  96.7  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0478  hypothetical protein  31.5 
 
 		 206 aa  96.7  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11850  methyltransferase family protein  28.21 
 
 		 199 aa  87  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0785893  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0502  hypothetical protein  29.5 
 
 		 203 aa  84.3  9e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3508  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.92 
 
 		 257 aa  56.6  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.510981  normal  0.74985 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.52 
 
 		 258 aa  51.2  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1407  methyltransferase type 11  33.96 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0925  Methyltransferase type 11  33.01 
 
 		 222 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4927  Methyltransferase type 12  29.25 
 
 		 218 aa  48.9  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.167193  normal  0.017224 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1956  methyltransferase type 12  26.46 
 
 		 201 aa  48.9  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.177509  normal  0.0792402 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1544  Methyltransferase type 11  31.18 
 
 		 200 aa  47.8  0.00009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2971  Generic methyltransferase  31.31 
 
 		 200 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.294264  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2539  methyltransferase type 11  30.61 
 
 		 203 aa  47.4  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0779638  normal  0.34629 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1707  type III restriction protein res subunit  29.25 
 
 		 1287 aa  47.4  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730362  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0294  methyltransferase type 11  25.73 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.293547 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5314  Methyltransferase type 11  44.68 
 
 		 225 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3350  methyltransferase type 11  24.62 
 
 		 205 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.318139  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2027  Methyltransferase type 11  26.32 
 
 		 198 aa  46.6  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3339  methyltransferase type 12  24.62 
 
 		 205 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102767  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0185  tellurite resistance protein TehB  27.78 
 
 		 202 aa  46.6  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0194  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.33 
 
 		 253 aa  46.6  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.920302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3401  methyltransferase type 12  24.62 
 
 		 205 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.476106 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23110  methyltransferase family protein  28.03 
 
 		 223 aa  46.6  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.195882  normal  0.375364 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1433  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.56 
 
 		 259 aa  45.8  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2203  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.6 
 
 		 258 aa  45.8  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.968625  hitchhiker  0.00608144 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0712  Methyltransferase type 11  27.14 
 
 		 246 aa  45.8  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2489  methyltransferase type 11  28.16 
 
 		 200 aa  45.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.910654  normal  0.230216 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2747  Methyltransferase type 11  31.63 
 
 		 195 aa  45.1  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.718719 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  28.44 
 
 		 265 aa  45.4  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1452  Methyltransferase type 11  26.56 
 
 		 202 aa  45.1  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  30.3 
 
 		 252 aa  45.1  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0255  methyltransferase type 12  23.37 
 
 		 211 aa  44.7  0.0009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0188144 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2002  Trans-aconitate 2-methyltransferase  29.73 
 
 		 258 aa  43.9  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.681077 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0348  hypothetical protein  29.47 
 
 		 208 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5085  methyltransferase type 12  25.62 
 
 		 226 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2103  Methyltransferase type 11  28.24 
 
 		 241 aa  44.3  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1179  tellurite resistance protein TehB  25.2 
 
 		 184 aa  44.3  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.28171  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1067  methyltransferase type 12  24.81 
 
 		 191 aa  43.9  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.737365 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2514  methyltransferase type 11  28.97 
 
 		 208 aa  43.9  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0379622  normal  0.538818 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0782  tellurite resistance protein TehB  24.68 
 
 		 286 aa  44.3  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0369325  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4275  Methyltransferase type 11  27.72 
 
 		 203 aa  44.7  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.18004 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35300  hypothetical protein  28.95 
 
 		 218 aa  43.5  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2843  putative tellurite resistance protein  25.47 
 
 		 194 aa  43.1  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.524622  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1409  hypothetical protein  33.67 
 
 		 192 aa  43.1  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5190  hypothetical protein  29.47 
 
 		 207 aa  43.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2590  Methyltransferase type 11  23.85 
 
 		 253 aa  43.5  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2389  methyltransferase type 11  24.1 
 
 		 220 aa  43.5  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2907  Methyltransferase type 11  38.6 
 
 		 243 aa  43.1  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0592  methyltransferase type 11  20.43 
 
 		 221 aa  43.1  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.499783  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0592  Methyltransferase type 12  37.14 
 
 		 181 aa  42.4  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4739  Methyltransferase type 11  23.12 
 
 		 218 aa  42.4  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4265  Methyltransferase type 11  30.11 
 
 		 215 aa  42.7  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00699595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23050  methyltransferase family protein  25.78 
 
 		 410 aa  42.7  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.294181 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0911  tellurite resistance protein TehB  31.96 
 
 		 183 aa  42.7  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.253451  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1053  hypothetical protein  28.32 
 
 		 192 aa  42.7  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.19261  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5435  Methyltransferase type 12  28.46 
 
 		 202 aa  42.4  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0879885  hitchhiker  0.0072084 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2491  Methyltransferase type 11  24.39 
 
 		 195 aa  42.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.13744 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4055  putative methyltransferase  25.71 
 
 		 194 aa  42  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7304  hypothetical protein  30.93 
 
 		 296 aa  42  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2771  Methyltransferase type 12  26.23 
 
 		 199 aa  42  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0947  Methyltransferase type 11  27.59 
 
 		 225 aa  42  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0974  Methyltransferase type 11  27.59 
 
 		 225 aa  42  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0589694  normal  0.0919169 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2549  adenylylsulfate kinase  33.33 
 
 		 388 aa  42.4  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.064569 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1252  methyltransferase type 11  24.4 
 
 		 212 aa  42  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000791929 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0552  Methyltransferase type 11  26.92 
 
 		 247 aa  42  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.286054  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0435  thiopurine S-methyltransferase  32.04 
 
 		 207 aa  42  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2822  hypothetical protein  29.59 
 
 		 200 aa  42  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2243  tellurite resistance protein TehB  27.56 
 
 		 295 aa  42  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0485  methyltransferase type 11  28.44 
 
 		 235 aa  42  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2139  tellurite resistance protein TehB  27.56 
 
 		 295 aa  42  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.233317 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2133  tellurite resistance protein TehB  27.56 
 
 		 295 aa  42  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1032  methyltransferase type 11  29.47 
 
 		 208 aa  41.6  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.507472  normal  0.696143 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3813  methyltransferase type 12  38.6 
 
 		 226 aa  41.6  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.332384  normal  0.0113044 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5314  methyltransferase type 11  26.28 
 
 		 221 aa  41.6  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.520408  normal  0.0718819 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0025  tellurite resistance protein  23.08 
 
 		 194 aa  41.2  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1365  methyltransferase type 12  22.89 
 
 		 189 aa  41.6  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0655112  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0256  Methyltransferase type 12  24.62 
 
 		 182 aa  41.2  0.009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2548  thiopurine S-methyltransferase  31.58 
 
 		 213 aa  41.2  0.009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.997429  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4348  hypothetical protein  27.88 
 
 		 220 aa  41.2  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.457106  normal  0.449633 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3824  Methyltransferase type 11  25.55 
 
 		 227 aa  41.2  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.38961  normal  0.0618413 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4082  methyltransferase type 12  29.46 
 
 		 198 aa  41.2  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0341683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  26.5 
 
 		 268 aa  41.2  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>