More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0416 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0416  flagellar motor protein MotB  100 
 
 
318 aa  648    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0032919  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01177  flagellar motor protein MotB  82.11 
 
 
314 aa  530  1e-149  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004254  Flagellar motor rotation protein MotB  82.17 
 
 
315 aa  516  1.0000000000000001e-145  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.145815  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0937  flagellar motor protein MotB  73.31 
 
 
309 aa  466  9.999999999999999e-131  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.322555  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3325  flagellar motor protein MotB  56.39 
 
 
325 aa  384  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.391683  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2987  flagellar motor protein MotB  57.81 
 
 
322 aa  376  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01429  flagellar motor protein MotB  59.55 
 
 
309 aa  375  1e-103  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2767  flagellar motor protein MotB  58.47 
 
 
314 aa  377  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.400451 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1093  flagellar motor protein MotB  63.55 
 
 
314 aa  372  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1279  flagellar motor protein MotB  58.36 
 
 
308 aa  372  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.853928  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3474  flagellar motor protein MotB  60.13 
 
 
322 aa  373  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.1847  hitchhiker  0.000424499 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1386  flagellar motor protein MotB  57.14 
 
 
310 aa  368  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.148012  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2999  flagellar motor protein MotB  57.14 
 
 
310 aa  368  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.197829  decreased coverage  0.0000000825848 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1361  flagellar motor protein MotB  57.14 
 
 
310 aa  368  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0109042  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1347  flagellar motor protein MotB  57.14 
 
 
310 aa  368  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.183969  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1323  flagellar motor protein MotB  59.49 
 
 
305 aa  369  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2786  flagellar motor protein MotB  59.02 
 
 
308 aa  369  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.788875  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2432  flagellar motor protein MotB  59.02 
 
 
312 aa  363  2e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2727  flagellar motor protein MotB  56.72 
 
 
306 aa  363  3e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.014691  normal  0.192949 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2800  flagellar motor protein MotB  56.72 
 
 
306 aa  363  3e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.874758  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2897  flagellar motor protein MotB  56.72 
 
 
306 aa  363  3e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0655407  hitchhiker  0.0000788614 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1530  flagellar motor protein MotB  56.07 
 
 
308 aa  362  6e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2567  flagellar motor protein MotB  57.43 
 
 
318 aa  360  1e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.72775  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1149  flagellar motor protein MotB  46.58 
 
 
330 aa  270  2e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0629266  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3218  flagellar motor protein MotB  49.5 
 
 
329 aa  264  2e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0834  flagellar motor protein MotB  47.42 
 
 
280 aa  236  5.0000000000000005e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.252047  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0313  flagellar motor protein MotB  40.8 
 
 
305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.941882  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1300  flagellar motor protein MotB  38.76 
 
 
296 aa  193  3e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.334413 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0050  OmpA/MotB domain-containing protein  34 
 
 
277 aa  137  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4286  flagellar motor protein MotB  32.34 
 
 
275 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1398  OmpA/MotB domain-containing protein  31.58 
 
 
266 aa  132  6e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.370733 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4200  OmpA/MotB domain protein  28.57 
 
 
275 aa  122  6e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0337  OmpA/MotB domain-containing protein  28.28 
 
 
246 aa  119  6e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0238  OmpA/MotB domain protein  28.07 
 
 
268 aa  113  3e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0240  hypothetical protein  27.74 
 
 
281 aa  108  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00800334  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2426  OmpA/MotB  27.53 
 
 
266 aa  106  5e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112959  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1073  OmpA/MotB domain protein  29.29 
 
 
257 aa  106  6e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1344  OmpA/MotB domain protein  27.72 
 
 
305 aa  105  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169927  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1181  OmpA/MotB domain protein  28.72 
 
 
305 aa  104  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.156303 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1857  flagellar motor protein MotD  27.76 
 
 
338 aa  104  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0460  OmpA/MotB  25.09 
 
 
267 aa  103  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0852  OmpA/MotB domain-containing protein  27.27 
 
 
290 aa  103  3e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.755762  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3511  putative chemotaxis protein MotB  30.88 
 
 
276 aa  103  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3028  chemotaxis MotB protein  25.42 
 
 
266 aa  103  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0409  OmpA/MotB domain protein  26.3 
 
 
271 aa  102  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350229  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00027  flagellar motor protein MotD  27.72 
 
 
286 aa  102  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.170514  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4080  OmpA/MotB domain-containing protein  24.5 
 
 
258 aa  100  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0030  OmpA/MotB domain protein  24.83 
 
 
271 aa  99.8  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2221  OmpA/MotB domain protein  28.28 
 
 
274 aa  99  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.172808  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2932  OmpA/MotB family outer membrane protein  27.11 
 
 
263 aa  98.6  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445091  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1325  OmpA/MotB domain protein  28.42 
 
 
241 aa  98.6  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2353  type IV / VI secretion system protein, DotU family  38.89 
 
 
494 aa  98.2  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.565328 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2442  OmpA/MotB domain-containing protein  25.95 
 
 
261 aa  97.4  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000346518  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1496  OmpA/MotB  28.04 
 
 
276 aa  97.4  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.166046  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1237  OmpA/MotB  30.56 
 
 
276 aa  95.5  9e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.258144  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0654  OmpA/MotB domain protein  34.1 
 
 
275 aa  95.9  9e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3751  OmpA/MotB domain protein  25.67 
 
 
254 aa  94.7  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3211  flagellar motor protein MotB  27.43 
 
 
265 aa  94  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5298  OmpA/MotB domain protein  29.45 
 
 
277 aa  94  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4831  OmpA/MotB domain-containing protein  29.45 
 
 
277 aa  94  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.540375 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1795  OmpA/MotB domain-containing protein  25.87 
 
 
257 aa  94.4  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2079  OmpA/MotB  30.03 
 
 
273 aa  93.6  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.299736  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1593  hypothetical protein  36.96 
 
 
440 aa  92.8  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.442796  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2101  OmpA/MotB  28.42 
 
 
275 aa  92.8  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.61631 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0634  OmpA/MotB domain protein  32.47 
 
 
271 aa  92.4  9e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0267799  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0263  OmpA/MotB domain protein  37.33 
 
 
259 aa  92  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3845  hypothetical protein  33.79 
 
 
443 aa  92  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00641884  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1315  flagellar motor protein MotD  27.15 
 
 
288 aa  92  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0458  OmpA/MotB  34.67 
 
 
249 aa  92  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000163883  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2999  hypothetical protein  33.09 
 
 
406 aa  91.3  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31110  flagellar motor protein  24.83 
 
 
295 aa  91.3  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.529946  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1523  OmpA/MotB  33.96 
 
 
248 aa  91.3  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000015  Flagellar motor rotation protein MotB  31.95 
 
 
430 aa  91.7  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1523  hypothetical protein  34.31 
 
 
469 aa  91.3  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.414466  normal  0.78534 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5376  OmpA/MotB domain protein  29.25 
 
 
277 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.590786  normal  0.352041 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1472  hypothetical protein  34.06 
 
 
452 aa  90.9  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0650495  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3835  OmpA/MotB domain protein  25.61 
 
 
253 aa  90.9  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169909 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0354  OmpA/MotB domain-containing protein  31.36 
 
 
236 aa  90.1  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3363  OmpA/MotB  26.99 
 
 
273 aa  90.5  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0104995 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0053  OmpA/MotB domain protein  27.53 
 
 
290 aa  89.7  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0515  type IV / VI secretion system protein, DotU family  36.96 
 
 
442 aa  89.7  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2022  OmpA/MotB domain-containing protein  35.22 
 
 
252 aa  89.4  8e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0243984  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4558  OmpA/MotB domain protein  27.8 
 
 
277 aa  89.4  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2088  hypothetical protein  36.11 
 
 
443 aa  89  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1985  motB protein  24.73 
 
 
295 aa  89  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1874  OmpA/MotB domain-containing protein  34.44 
 
 
366 aa  89  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0773204  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0231  flagellar MotB protein  34.44 
 
 
366 aa  89  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16770  OmpA/MotB domain protein  33.56 
 
 
245 aa  88.2  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188615  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3470  OmpA/MotB domain-containing protein  23.33 
 
 
271 aa  88.2  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0579  OmpA/MotB domain protein  28.57 
 
 
248 aa  87.8  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1685  OmpA/MotB domain protein  26.57 
 
 
323 aa  87.8  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3057  OmpA/MotB domain-containing protein  27 
 
 
277 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.102068  normal  0.0344609 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1661  OmpA/MotB domain protein  27.91 
 
 
342 aa  87  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.61727 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3431  flagellar motor protein MotD  25.09 
 
 
295 aa  87  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.707769 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0253  hypothetical protein  36.5 
 
 
437 aa  87  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1251  flagellar motor protein MotD  32.16 
 
 
263 aa  86.7  5e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1690  hypothetical protein  38.35 
 
 
421 aa  86.7  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.994866  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0328  hypothetical protein  38.35 
 
 
421 aa  86.7  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26720  hypothetical protein  38.13 
 
 
430 aa  86.7  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0237  hypothetical protein  38.35 
 
 
421 aa  86.7  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>