More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4558 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_4558  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 
277 aa  558  1e-158  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3057  OmpA/MotB domain-containing protein  88.81 
 
 
277 aa  503  1e-141  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.102068  normal  0.0344609 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4831  OmpA/MotB domain-containing protein  71.12 
 
 
277 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.540375 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5298  OmpA/MotB domain protein  71.12 
 
 
277 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5376  OmpA/MotB domain protein  70.76 
 
 
277 aa  414  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.590786  normal  0.352041 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2079  OmpA/MotB  54.01 
 
 
273 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.299736  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3363  OmpA/MotB  52.92 
 
 
273 aa  285  4e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0104995 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2101  OmpA/MotB  52.17 
 
 
275 aa  285  5e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.61631 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2221  OmpA/MotB domain protein  52.36 
 
 
274 aa  281  7.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.172808  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1237  OmpA/MotB  52.75 
 
 
276 aa  278  9e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.258144  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3511  putative chemotaxis protein MotB  52.43 
 
 
276 aa  278  1e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1496  OmpA/MotB  51.65 
 
 
276 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.166046  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3243  OmpA/MotB domain protein  50.92 
 
 
285 aa  264  1e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.612152  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2834  OmpA/MotB  50.37 
 
 
286 aa  264  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.155442  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2459  OmpA/MotB  48.9 
 
 
283 aa  260  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.141596  normal  0.174872 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2804  OmpA/MotB  47.79 
 
 
274 aa  249  3e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.218866 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1978  OmpA/MotB domain-containing protein  46.91 
 
 
286 aa  235  7e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0364656  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2886  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 
298 aa  177  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00198086 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3061  OmpA/MotB domain-containing protein  35.14 
 
 
299 aa  166  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1555  OmpA/MotB domain-containing protein  35.52 
 
 
307 aa  148  9e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00240809  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1901  OmpA/MotB domain-containing protein  45.16 
 
 
371 aa  120  3e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.686994  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1843  OmpA/MotB  39.35 
 
 
360 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0226  OmpA/MotB domain-containing protein  30.68 
 
 
346 aa  109  4.0000000000000004e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.174216  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1434  OmpA/MotB  28.46 
 
 
296 aa  107  1e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2778  OmpA/MotB domain-containing protein  29.15 
 
 
319 aa  107  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1504  OmpA/MotB domain-containing protein  33.97 
 
 
285 aa  106  4e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.962914  normal  0.610699 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4952  chemotaxis motB protein  29 
 
 
341 aa  106  5e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.457077  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4422  OmpA/MotB domain-containing protein  28.62 
 
 
327 aa  105  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.66197 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24330  Flagellar motor protein  30.86 
 
 
306 aa  102  8e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4696  flagellar motor protein MotB  29.21 
 
 
339 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4409  OmpA/MotB domain-containing protein  28.82 
 
 
312 aa  101  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0625  flagellar motor protein MotB  28.35 
 
 
329 aa  101  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.749766 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3453  OmpA/MotB domain protein  29.68 
 
 
368 aa  100  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.47019 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0562  flagellar motor protein MotB  29.26 
 
 
349 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0723  flagellar motor protein MotB  26.33 
 
 
316 aa  97.8  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0513  flagellar motor protein MotB  28.95 
 
 
355 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.787426  normal  0.766488 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4957  flagellar motor protein MotB  28.9 
 
 
350 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.782956 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0284  hypothetical protein  28.52 
 
 
307 aa  95.9  6e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.179878  normal  0.584147 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65430  flagellar motor protein MotB  26.97 
 
 
347 aa  95.5  9e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5682  flagellar motor protein MotB  26.59 
 
 
342 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3816  OmpA/MotB domain-containing protein  26.15 
 
 
313 aa  95.1  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.983249 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1321  chemotaxis MotB protein  26.24 
 
 
290 aa  94.7  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4780  flagellar motor protein MotB  27.88 
 
 
346 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2640  OmpA/MotB domain-containing protein  27.82 
 
 
301 aa  94.4  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0239929  hitchhiker  0.00000281667 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4904  flagellar motor protein MotB  27.51 
 
 
346 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3089  OmpA/MotB domain protein  25.8 
 
 
313 aa  94  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0834  flagellar motor protein MotB  30.65 
 
 
280 aa  92.4  7e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.252047  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1259  OmpA/MotB domain-containing protein  27.8 
 
 
334 aa  91.7  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.541326 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3350  hypothetical protein  27.78 
 
 
307 aa  92  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.935106  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0193  OmpA/MotB domain-containing protein  27.47 
 
 
313 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3703  OmpA/MotB  27.14 
 
 
314 aa  90.9  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.618004  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0654  OmpA/MotB domain protein  26.67 
 
 
275 aa  90.5  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2791  OmpA/MotB family outer membrane protein  27.54 
 
 
318 aa  90.5  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.426282  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1000  OmpA/MotB domain-containing protein  28.16 
 
 
320 aa  90.5  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5607  flagellar motor protein MotB  25.09 
 
 
325 aa  89.7  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.707499  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2919  OmpA/MotB  26.69 
 
 
287 aa  89.7  4e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0852  OmpA/MotB domain-containing protein  30.48 
 
 
290 aa  89.4  6e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.755762  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0416  flagellar motor protein MotB  27.8 
 
 
318 aa  89  9e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0032919  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4204  OmpA/MotB domain-containing protein  25.94 
 
 
327 aa  87.4  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3579  OmpA/MotB domain-containing protein  26.72 
 
 
306 aa  87.8  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2336  OmpA/MotB domain protein  27.8 
 
 
295 aa  87  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.279433  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3447  OmpA/MotB domain-containing protein  26.22 
 
 
305 aa  87  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.284418  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0603  OmpA/MotB domain-containing protein  26.52 
 
 
345 aa  86.7  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1939  flagellar motor protein MotB  24.1 
 
 
308 aa  85.9  6e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3226  OmpA/MotB domain protein  26.01 
 
 
330 aa  85.9  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0410363  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5983  OmpA/MotB domain protein  26.02 
 
 
329 aa  85.5  8e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180638  normal  0.475953 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3218  flagellar motor protein MotB  29.37 
 
 
329 aa  85.9  8e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2986  OmpA/MotB domain-containing protein  27.41 
 
 
321 aa  85.5  8e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.543248  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0409  OmpA/MotB domain protein  29.93 
 
 
271 aa  85.5  9e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350229  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3817  flagellar motor protein MotB  26.74 
 
 
335 aa  85.5  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2267  flagellar motor protein MotB  26.3 
 
 
312 aa  84.7  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1857  flagellar motor protein MotD  28.37 
 
 
338 aa  85.1  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0458  OmpA/MotB  30.74 
 
 
249 aa  84.7  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000163883  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0577  OmpA/MotB domain protein  29 
 
 
325 aa  85.1  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0523993 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3631  OmpA/MotB  25.53 
 
 
330 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.77241  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3688  flagellar motor protein MotB  26.79 
 
 
325 aa  84.7  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0125108 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1244  flagellar motor protein MotB  26.55 
 
 
319 aa  84.3  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4158  flagellar motor protein MotB  25.45 
 
 
315 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.270622  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4046  flagellar motor protein MotB  25.45 
 
 
315 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.475556  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0117  flagellar motor protein MotB  27.37 
 
 
335 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2239  flagellar motor protein MotB  26.18 
 
 
312 aa  83.2  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1149  flagellar motor protein MotB  27.97 
 
 
330 aa  83.2  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0629266  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1661  OmpA/MotB domain protein  28.2 
 
 
342 aa  83.2  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.61727 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0055  OmpA/MotB domain-containing protein  25.28 
 
 
336 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  25.29 
 
 
264 aa  82.8  0.000000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.300073  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0240  hypothetical protein  29.1 
 
 
281 aa  82.8  0.000000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00800334  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0180  flagellar motor protein MotB  29.54 
 
 
339 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1403  OmpA/MotB domain protein  26.01 
 
 
269 aa  82.4  0.000000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0436155  normal  0.643196 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1036  OmpA/MotB domain protein  25.65 
 
 
358 aa  82.4  0.000000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2078  flagellar motor protein MotB  26.42 
 
 
309 aa  82.4  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000517437  hitchhiker  0.0000035 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2083  flagellar motor protein MotB  26.42 
 
 
309 aa  82.4  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.375305  hitchhiker  2.85081e-24 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1322  flagellar motor protein MotB  26.42 
 
 
309 aa  82.4  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.300198  hitchhiker  5.1879400000000003e-23 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1199  flagellar motor protein MotB  26.42 
 
 
309 aa  82.4  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00894206  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2138  flagellar motor protein MotB  26.42 
 
 
309 aa  82.4  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.171106  hitchhiker  1.07849e-26 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1347  flagellar motor protein MotB  27.68 
 
 
310 aa  82  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.183969  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1386  flagellar motor protein MotB  27.68 
 
 
310 aa  82  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.148012  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2999  flagellar motor protein MotB  27.68 
 
 
310 aa  82  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.197829  decreased coverage  0.0000000825848 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1361  flagellar motor protein MotB  27.68 
 
 
310 aa  82  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0109042  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0337  OmpA/MotB domain-containing protein  29.63 
 
 
246 aa  81.6  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0167  flagellar motor protein MotB  29.54 
 
 
339 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.850348  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>