297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2804 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2804  OmpA/MotB  100 
 
 		 274 aa  558  1e-158  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.218866 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2834  OmpA/MotB  71.83 
 
 		 286 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.155442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3243  OmpA/MotB domain protein  71.17 
 
 		 285 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.612152  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2101  OmpA/MotB  66.55 
 
 		 275 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.61631 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2459  OmpA/MotB  61.84 
 
 		 283 aa  348  5e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.141596  normal  0.174872 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2079  OmpA/MotB  62.64 
 
 		 273 aa  347  1e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.299736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2221  OmpA/MotB domain protein  60.58 
 
 		 274 aa  342  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.172808  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1496  OmpA/MotB  59.78 
 
 		 276 aa  340  1e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.166046  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3363  OmpA/MotB  60.07 
 
 		 273 aa  339  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0104995 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1237  OmpA/MotB  56.88 
 
 		 276 aa  327  1.0000000000000001e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.258144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3511  putative chemotaxis protein MotB  60.53 
 
 		 276 aa  323  2e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4558  OmpA/MotB domain protein  47.79 
 
 		 277 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3057  OmpA/MotB domain-containing protein  47.97 
 
 		 277 aa  250  2e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.102068  normal  0.0344609 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5376  OmpA/MotB domain protein  46.69 
 
 		 277 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.590786  normal  0.352041 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4831  OmpA/MotB domain-containing protein  45.02 
 
 		 277 aa  234  9e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.540375 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5298  OmpA/MotB domain protein  45.02 
 
 		 277 aa  234  9e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2886  OmpA/MotB domain-containing protein  38.38 
 
 		 298 aa  182  5.0000000000000004e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00198086 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1978  OmpA/MotB domain-containing protein  37.82 
 
 		 286 aa  172  5e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0364656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3061  OmpA/MotB domain-containing protein  36.03 
 
 		 299 aa  158  9e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1555  OmpA/MotB domain-containing protein  34.89 
 
 		 307 aa  151  8.999999999999999e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00240809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0226  OmpA/MotB domain-containing protein  33.74 
 
 		 346 aa  113  3e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.174216  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1434  OmpA/MotB  28.46 
 
 		 296 aa  112  9e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1843  OmpA/MotB  37.74 
 
 		 360 aa  107  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1504  OmpA/MotB domain-containing protein  32.39 
 
 		 285 aa  102  5e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.962914  normal  0.610699 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1901  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 371 aa  101  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.686994  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3816  OmpA/MotB domain-containing protein  28.74 
 
 		 313 aa  100  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.983249 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4422  OmpA/MotB domain-containing protein  28.08 
 
 		 327 aa  98.6  9e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.66197 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3089  OmpA/MotB domain protein  30.83 
 
 		 313 aa  97.8  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24330  Flagellar motor protein  31.56 
 
 		 306 aa  94.4  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1000  OmpA/MotB domain-containing protein  28.78 
 
 		 320 aa  94  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4409  OmpA/MotB domain-containing protein  26.54 
 
 		 312 aa  94.4  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2778  OmpA/MotB domain-containing protein  29.21 
 
 		 319 aa  93.6  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0513  flagellar motor protein MotB  28.63 
 
 		 355 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.787426  normal  0.766488 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2640  OmpA/MotB domain-containing protein  28.17 
 
 		 301 aa  92.4  6e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0239929  hitchhiker  0.00000281667 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0625  flagellar motor protein MotB  30.2 
 
 		 329 aa  92  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.749766 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0603  OmpA/MotB domain-containing protein  27.1 
 
 		 345 aa  90.5  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0723  flagellar motor protein MotB  26.22 
 
 		 316 aa  89.4  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1244  flagellar motor protein MotB  26.97 
 
 		 319 aa  89  8e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2873  chemotaxis signal transduction protein CheY  28.21 
 
 		 320 aa  88.6  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2919  OmpA/MotB  28.68 
 
 		 287 aa  88.2  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4952  chemotaxis motB protein  27.59 
 
 		 341 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.457077  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2791  OmpA/MotB family outer membrane protein  27.97 
 
 		 318 aa  87.4  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.426282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3226  OmpA/MotB domain protein  28.36 
 
 		 330 aa  87.4  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0410363  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5682  flagellar motor protein MotB  26.89 
 
 		 342 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  26.69 
 
 		 264 aa  86.3  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.300073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65430  flagellar motor protein MotB  26.89 
 
 		 347 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0562  flagellar motor protein MotB  28.63 
 
 		 349 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3703  OmpA/MotB  27.03 
 
 		 314 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.618004  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3688  flagellar motor protein MotB  27.74 
 
 		 325 aa  83.6  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0125108 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1036  OmpA/MotB domain protein  26.24 
 
 		 358 aa  83.2  0.000000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2267  flagellar motor protein MotB  24.15 
 
 		 312 aa  83.2  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5607  flagellar motor protein MotB  26.45 
 
 		 325 aa  83.2  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.707499  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2976  flagellar motor protein MotB  26.02 
 
 		 369 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000103067 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3817  flagellar motor protein MotB  26.79 
 
 		 335 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4157  OmpA/MotB domain protein  26.48 
 
 		 315 aa  81.3  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2239  flagellar motor protein MotB  24.91 
 
 		 312 aa  80.5  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2083  flagellar motor protein MotB  28.41 
 
 		 309 aa  80.1  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.375305  hitchhiker  2.85081e-24 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2078  flagellar motor protein MotB  28.41 
 
 		 309 aa  80.1  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000517437  hitchhiker  0.0000035 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2138  flagellar motor protein MotB  28.41 
 
 		 309 aa  80.1  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.171106  hitchhiker  1.07849e-26 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1322  flagellar motor protein MotB  28.41 
 
 		 309 aa  80.1  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.300198  hitchhiker  5.1879400000000003e-23 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3184  flagellar motor protein MotB  27.44 
 
 		 344 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.12888  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0193  OmpA/MotB domain-containing protein  28.73 
 
 		 313 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2025  OmpA/MotB  29.69 
 
 		 330 aa  80.1  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0231038  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1323  flagellar motor protein MotB  29.17 
 
 		 305 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1199  flagellar motor protein MotB  28.41 
 
 		 309 aa  80.1  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00894206  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0079  flagellar motor protein MotB  27.44 
 
 		 340 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3857  flagellar motor protein MotB  27.44 
 
 		 340 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.347462  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1308  flagellar motor protein MotB  25.38 
 
 		 308 aa  79.7  0.00000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3938  flagellar motor protein MotB  27.44 
 
 		 340 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249786  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01429  flagellar motor protein MotB  29.47 
 
 		 309 aa  79.7  0.00000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4904  flagellar motor protein MotB  27.76 
 
 		 346 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1410  flagellar motor protein MotB  26.92 
 
 		 314 aa  79.3  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.296374 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4666  OmpA/MotB domain-containing protein  27.84 
 
 		 340 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0489051 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01860  flagellar motor protein MotB  27.65 
 
 		 308 aa  79  0.00000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0228996  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1751  OmpA/MotB domain protein  27.65 
 
 		 308 aa  79  0.00000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0290183  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1295  flagellar motor protein MotB  27.65 
 
 		 308 aa  79  0.00000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00197011  hitchhiker  0.000000685167 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4780  flagellar motor protein MotB  27.38 
 
 		 346 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2122  flagellar motor protein MotB  27.65 
 
 		 308 aa  79  0.00000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000245861  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1985  flagellar motor protein MotB  27.65 
 
 		 308 aa  79  0.00000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000595029  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2628  flagellar motor protein MotB  27.65 
 
 		 308 aa  79  0.00000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00566133  hitchhiker  0.0000000000155511 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01849  hypothetical protein  27.65 
 
 		 308 aa  79  0.00000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0472674  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1743  flagellar motor protein MotB  27.65 
 
 		 308 aa  79  0.00000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4046  flagellar motor protein MotB  27.41 
 
 		 315 aa  79  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.475556  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4158  flagellar motor protein MotB  27.41 
 
 		 315 aa  79  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.270622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0167  flagellar motor protein MotB  26.2 
 
 		 339 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.850348  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0180  flagellar motor protein MotB  26.2 
 
 		 339 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4957  flagellar motor protein MotB  27 
 
 		 350 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.782956 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1997  OmpA/MotB domain protein  26.82 
 
 		 300 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0236  flagellar motor protein MotB  26.45 
 
 		 339 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.501076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3350  hypothetical protein  25.93 
 
 		 307 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.935106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2467  flagellar motor protein MotB  27.49 
 
 		 309 aa  77.4  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0620427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1939  flagellar motor protein MotB  23.74 
 
 		 308 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1279  flagellar motor protein MotB  28.57 
 
 		 308 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.853928  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0117  flagellar motor protein MotB  27.24 
 
 		 335 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2853  flagellar motor protein MotB  26.45 
 
 		 339 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2432  flagellar motor protein MotB  29.72 
 
 		 312 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0254  flagellar motor protein MotB  26.45 
 
 		 339 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.32393  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2336  OmpA/MotB domain protein  27.72 
 
 		 295 aa  77  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.279433  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0577  OmpA/MotB domain protein  27.37 
 
 		 325 aa  76.6  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0523993 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4696  flagellar motor protein MotB  26.85 
 
 		 339 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>