More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0167 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0180  flagellar motor protein MotB  98.53 
 
 
339 aa  680    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0236  flagellar motor protein MotB  94.4 
 
 
339 aa  635    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.501076  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2853  flagellar motor protein MotB  94.4 
 
 
339 aa  635    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0167  flagellar motor protein MotB  100 
 
 
339 aa  690    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.850348  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0254  flagellar motor protein MotB  94.4 
 
 
339 aa  635    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.32393  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3356  flagellar motor protein MotB  90.56 
 
 
338 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.828163  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0163  flagellar motor protein MotB  91.88 
 
 
338 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.724048  normal  0.748844 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3938  flagellar motor protein MotB  84.52 
 
 
340 aa  579  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249786  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0079  flagellar motor protein MotB  84.52 
 
 
340 aa  579  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3857  flagellar motor protein MotB  84.52 
 
 
340 aa  579  1e-164  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.347462  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3184  flagellar motor protein MotB  83.53 
 
 
344 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.12888  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3817  flagellar motor protein MotB  75.3 
 
 
335 aa  509  1e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0117  flagellar motor protein MotB  73.81 
 
 
335 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2976  flagellar motor protein MotB  74.32 
 
 
369 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000103067 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1682  putative chemotaxis MotB protein  80.08 
 
 
245 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.297194  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3437  flagellar motor protein  80.08 
 
 
245 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.388593  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1244  flagellar motor protein MotB  57.09 
 
 
319 aa  316  4e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1939  flagellar motor protein MotB  52.51 
 
 
308 aa  309  5e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3226  OmpA/MotB domain protein  54.58 
 
 
330 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0410363  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0723  flagellar motor protein MotB  52.26 
 
 
316 aa  304  1.0000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5607  flagellar motor protein MotB  50.32 
 
 
325 aa  297  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.707499  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01860  flagellar motor protein MotB  48.17 
 
 
308 aa  292  5e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0228996  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1751  OmpA/MotB domain protein  48.17 
 
 
308 aa  292  5e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0290183  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2628  flagellar motor protein MotB  48.17 
 
 
308 aa  292  5e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00566133  hitchhiker  0.0000000000155511 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1985  flagellar motor protein MotB  48.17 
 
 
308 aa  292  5e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000595029  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01849  hypothetical protein  48.17 
 
 
308 aa  292  5e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0472674  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2122  flagellar motor protein MotB  48.17 
 
 
308 aa  292  5e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000245861  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1743  flagellar motor protein MotB  48.17 
 
 
308 aa  292  5e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1295  flagellar motor protein MotB  48.17 
 
 
308 aa  292  5e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00197011  hitchhiker  0.000000685167 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1308  flagellar motor protein MotB  48.34 
 
 
308 aa  290  2e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4409  OmpA/MotB domain-containing protein  52.41 
 
 
312 aa  285  9e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3688  flagellar motor protein MotB  50.16 
 
 
325 aa  282  6.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0125108 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1748  flagellar motor protein MotB  50.69 
 
 
451 aa  280  2e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.540445  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1637  flagellar motor protein MotB  50.69 
 
 
433 aa  279  4e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2826  flagellar motor protein MotB  49.5 
 
 
421 aa  279  5e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.156984 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3089  OmpA/MotB domain protein  50.51 
 
 
313 aa  278  1e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1000  OmpA/MotB domain-containing protein  50.34 
 
 
320 aa  278  1e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3816  OmpA/MotB domain-containing protein  49.83 
 
 
313 aa  277  2e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.983249 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2083  flagellar motor protein MotB  49.01 
 
 
309 aa  276  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.375305  hitchhiker  2.85081e-24 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2138  flagellar motor protein MotB  49.01 
 
 
309 aa  276  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.171106  hitchhiker  1.07849e-26 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2078  flagellar motor protein MotB  49.01 
 
 
309 aa  276  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000517437  hitchhiker  0.0000035 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1199  flagellar motor protein MotB  49.01 
 
 
309 aa  276  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00894206  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1322  flagellar motor protein MotB  49.01 
 
 
309 aa  276  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.300198  hitchhiker  5.1879400000000003e-23 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2986  OmpA/MotB domain-containing protein  48.49 
 
 
321 aa  273  2.0000000000000002e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.543248  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0603  OmpA/MotB domain-containing protein  48.47 
 
 
345 aa  270  2e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4157  OmpA/MotB domain protein  46.75 
 
 
315 aa  270  2.9999999999999997e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1511  flagellar motor protein MotB  48 
 
 
377 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0155028  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1539  flagellar motor protein MotB  47.33 
 
 
376 aa  266  2.9999999999999995e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.074747  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2873  chemotaxis signal transduction protein CheY  50.35 
 
 
320 aa  266  4e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1410  flagellar motor protein MotB  51.55 
 
 
314 aa  265  5.999999999999999e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.296374 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2791  OmpA/MotB family outer membrane protein  49.5 
 
 
318 aa  265  8e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.426282  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3703  OmpA/MotB  48.81 
 
 
314 aa  265  8.999999999999999e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.618004  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24330  Flagellar motor protein  47.39 
 
 
306 aa  262  6.999999999999999e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2467  flagellar motor protein MotB  47.67 
 
 
309 aa  261  2e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0620427  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4046  flagellar motor protein MotB  50.17 
 
 
315 aa  259  6e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.475556  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4158  flagellar motor protein MotB  50.17 
 
 
315 aa  259  6e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.270622  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4204  OmpA/MotB domain-containing protein  50.18 
 
 
327 aa  256  3e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5983  OmpA/MotB domain protein  48.26 
 
 
329 aa  256  5e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180638  normal  0.475953 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1036  OmpA/MotB domain protein  46.98 
 
 
358 aa  252  8.000000000000001e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2612  OmpA/MotB domain protein  48 
 
 
350 aa  251  1e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.119507  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1854  OmpA/MotB domain protein  48.6 
 
 
350 aa  249  6e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00497305  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4422  OmpA/MotB domain-containing protein  44.65 
 
 
327 aa  246  3e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.66197 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2025  OmpA/MotB  48.61 
 
 
330 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0231038  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2267  flagellar motor protein MotB  44.41 
 
 
312 aa  233  5e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2239  flagellar motor protein MotB  44.06 
 
 
312 aa  229  5e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5682  flagellar motor protein MotB  43.64 
 
 
342 aa  224  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1321  chemotaxis MotB protein  43.69 
 
 
290 aa  224  1e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65430  flagellar motor protein MotB  43.64 
 
 
347 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0625  flagellar motor protein MotB  43.94 
 
 
329 aa  222  7e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.749766 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0562  flagellar motor protein MotB  43 
 
 
349 aa  217  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2778  OmpA/MotB domain-containing protein  40.69 
 
 
319 aa  214  9.999999999999999e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4952  chemotaxis motB protein  43 
 
 
341 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.457077  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1843  OmpA/MotB  39.5 
 
 
360 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0513  flagellar motor protein MotB  42.91 
 
 
355 aa  211  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.787426  normal  0.766488 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1434  OmpA/MotB  38.31 
 
 
296 aa  211  2e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4904  flagellar motor protein MotB  43.36 
 
 
346 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4780  flagellar motor protein MotB  43.36 
 
 
346 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4957  flagellar motor protein MotB  43.21 
 
 
350 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.782956 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03067  flagellar motor protein MotB  42.47 
 
 
377 aa  206  7e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0438  flagellar motor protein MotB  41.39 
 
 
318 aa  204  2e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4696  flagellar motor protein MotB  41.96 
 
 
339 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2886  OmpA/MotB domain-containing protein  38.33 
 
 
298 aa  181  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00198086 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1555  OmpA/MotB domain-containing protein  36.75 
 
 
307 aa  172  6.999999999999999e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00240809  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1504  OmpA/MotB domain-containing protein  35.03 
 
 
285 aa  170  4e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.962914  normal  0.610699 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0226  OmpA/MotB domain-containing protein  35.86 
 
 
346 aa  161  1e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.174216  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2640  OmpA/MotB domain-containing protein  34.9 
 
 
301 aa  158  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0239929  hitchhiker  0.00000281667 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0577  OmpA/MotB domain protein  41.86 
 
 
325 aa  158  1e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0523993 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3061  OmpA/MotB domain-containing protein  36.63 
 
 
299 aa  157  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1997  OmpA/MotB domain protein  34.08 
 
 
300 aa  154  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2919  OmpA/MotB  35.86 
 
 
287 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1259  OmpA/MotB domain-containing protein  37.01 
 
 
334 aa  146  5e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.541326 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  34.73 
 
 
264 aa  144  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.300073  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0284  hypothetical protein  31.97 
 
 
307 aa  143  5e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.179878  normal  0.584147 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0731  hypothetical protein  32.53 
 
 
303 aa  142  9e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0200  hypothetical protein  32.53 
 
 
303 aa  142  9e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0382119 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3631  OmpA/MotB  33.22 
 
 
330 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.77241  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3350  hypothetical protein  31.63 
 
 
307 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.935106  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0662  hypothetical protein  31.83 
 
 
303 aa  139  8.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1978  OmpA/MotB domain-containing protein  33.91 
 
 
286 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0364656  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0049  OmpA/MotB  30.92 
 
 
336 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>