More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3631 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3631  OmpA/MotB  100 
 
 		 330 aa  677    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.77241  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0049  OmpA/MotB  64.44 
 
 		 336 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3447  OmpA/MotB domain-containing protein  68.22 
 
 		 305 aa  436  1e-121  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.284418  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3946  OmpA/MotB domain-containing protein  66.25 
 
 		 306 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0055  OmpA/MotB domain-containing protein  58.97 
 
 		 336 aa  408  1e-113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04949  flagellar motor protein  41.62 
 
 		 330 aa  261  1e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001165  Flagellar motor rotation protein MotB  39.52 
 
 		 330 aa  249  5e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0193  OmpA/MotB domain-containing protein  42.62 
 
 		 313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0284  hypothetical protein  37.41 
 
 		 307 aa  196  6e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.179878  normal  0.584147 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3350  hypothetical protein  37.07 
 
 		 307 aa  194  1e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.935106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3579  OmpA/MotB domain-containing protein  33.8 
 
 		 306 aa  190  2e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0662  hypothetical protein  37.09 
 
 		 303 aa  189  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0731  hypothetical protein  36.75 
 
 		 303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0200  hypothetical protein  36.75 
 
 		 303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0382119 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0154  chemotaxis lafU protein  38.1 
 
 		 311 aa  176  6e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2640  OmpA/MotB domain-containing protein  34.74 
 
 		 301 aa  175  8e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0239929  hitchhiker  0.00000281667 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0202  chemotaxis LafU protein  36.73 
 
 		 311 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2986  OmpA/MotB domain-containing protein  32.9 
 
 		 321 aa  166  4e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.543248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65430  flagellar motor protein MotB  34.41 
 
 		 347 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5682  flagellar motor protein MotB  34.64 
 
 		 342 aa  165  9e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0562  flagellar motor protein MotB  36.54 
 
 		 349 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4952  chemotaxis motB protein  36 
 
 		 341 aa  161  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.457077  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1637  flagellar motor protein MotB  31.48 
 
 		 433 aa  160  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1748  flagellar motor protein MotB  31.48 
 
 		 451 aa  160  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.540445  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24330  Flagellar motor protein  34.32 
 
 		 306 aa  160  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2826  flagellar motor protein MotB  31.48 
 
 		 421 aa  160  3e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.156984 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1321  chemotaxis MotB protein  34.44 
 
 		 290 aa  159  9e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0513  flagellar motor protein MotB  34.16 
 
 		 355 aa  157  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.787426  normal  0.766488 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4957  flagellar motor protein MotB  34.97 
 
 		 350 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.782956 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4696  flagellar motor protein MotB  34.64 
 
 		 339 aa  156  6e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4780  flagellar motor protein MotB  34.42 
 
 		 346 aa  155  8e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1511  flagellar motor protein MotB  32.23 
 
 		 377 aa  155  9e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0155028  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2778  OmpA/MotB domain-containing protein  32.57 
 
 		 319 aa  154  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4904  flagellar motor protein MotB  34.09 
 
 		 346 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1539  flagellar motor protein MotB  32.69 
 
 		 376 aa  153  4e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.074747  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0625  flagellar motor protein MotB  33.99 
 
 		 329 aa  151  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.749766 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01860  flagellar motor protein MotB  31.6 
 
 		 308 aa  150  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0228996  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1751  OmpA/MotB domain protein  31.6 
 
 		 308 aa  150  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0290183  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2122  flagellar motor protein MotB  31.6 
 
 		 308 aa  150  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000245861  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1743  flagellar motor protein MotB  31.6 
 
 		 308 aa  150  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01849  hypothetical protein  31.6 
 
 		 308 aa  150  3e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0472674  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1295  flagellar motor protein MotB  31.6 
 
 		 308 aa  150  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00197011  hitchhiker  0.000000685167 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2628  flagellar motor protein MotB  31.6 
 
 		 308 aa  150  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00566133  hitchhiker  0.0000000000155511 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1985  flagellar motor protein MotB  31.6 
 
 		 308 aa  150  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000595029  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2791  OmpA/MotB family outer membrane protein  31.74 
 
 		 318 aa  149  8e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.426282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4666  OmpA/MotB domain-containing protein  30.98 
 
 		 340 aa  149  8e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0489051 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2083  flagellar motor protein MotB  32.68 
 
 		 309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.375305  hitchhiker  2.85081e-24 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1199  flagellar motor protein MotB  32.68 
 
 		 309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00894206  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2078  flagellar motor protein MotB  32.68 
 
 		 309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000517437  hitchhiker  0.0000035 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1322  flagellar motor protein MotB  32.68 
 
 		 309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.300198  hitchhiker  5.1879400000000003e-23 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2138  flagellar motor protein MotB  32.68 
 
 		 309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.171106  hitchhiker  1.07849e-26 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1504  OmpA/MotB domain-containing protein  34.3 
 
 		 285 aa  148  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.962914  normal  0.610699 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1434  OmpA/MotB  30.35 
 
 		 296 aa  147  3e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2025  OmpA/MotB  30.97 
 
 		 330 aa  145  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0231038  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3816  OmpA/MotB domain-containing protein  34.56 
 
 		 313 aa  144  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.983249 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0723  flagellar motor protein MotB  29.73 
 
 		 316 aa  141  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0275  hypothetical protein  37.09 
 
 		 256 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.658855 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3089  OmpA/MotB domain protein  34.78 
 
 		 313 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0603  OmpA/MotB domain-containing protein  33.44 
 
 		 345 aa  141  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4204  OmpA/MotB domain-containing protein  31.7 
 
 		 327 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3377  OmpA/MotB domain protein  36.62 
 
 		 261 aa  140  3e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1036  OmpA/MotB domain protein  29.84 
 
 		 358 aa  140  3.9999999999999997e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0167  flagellar motor protein MotB  33.22 
 
 		 339 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.850348  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0180  flagellar motor protein MotB  33.22 
 
 		 339 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1000  OmpA/MotB domain-containing protein  31.29 
 
 		 320 aa  139  4.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0258  hypothetical protein  36.62 
 
 		 256 aa  139  7e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0438  flagellar motor protein MotB  32.88 
 
 		 318 aa  139  7e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0264  hypothetical protein  36.62 
 
 		 256 aa  139  7e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3226  OmpA/MotB domain protein  31.37 
 
 		 330 aa  139  7.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0410363  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1854  OmpA/MotB domain protein  32.25 
 
 		 350 aa  139  7.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00497305  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4422  OmpA/MotB domain-containing protein  32.42 
 
 		 327 aa  138  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.66197 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2467  flagellar motor protein MotB  31.8 
 
 		 309 aa  138  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0620427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0226  OmpA/MotB domain-containing protein  33.89 
 
 		 346 aa  137  2e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.174216  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3703  OmpA/MotB  28.9 
 
 		 314 aa  137  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.618004  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03067  flagellar motor protein MotB  32.57 
 
 		 377 aa  136  5e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3356  flagellar motor protein MotB  32.9 
 
 		 338 aa  136  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.828163  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1244  flagellar motor protein MotB  29.14 
 
 		 319 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0577  OmpA/MotB domain protein  33.88 
 
 		 325 aa  135  7.000000000000001e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0523993 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5983  OmpA/MotB domain protein  31.97 
 
 		 329 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180638  normal  0.475953 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0163  flagellar motor protein MotB  33.55 
 
 		 338 aa  135  8e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.724048  normal  0.748844 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2612  OmpA/MotB domain protein  31.19 
 
 		 350 aa  135  8e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.119507  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3184  flagellar motor protein MotB  33.55 
 
 		 344 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.12888  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3857  flagellar motor protein MotB  33.22 
 
 		 340 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.347462  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3938  flagellar motor protein MotB  33.22 
 
 		 340 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249786  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0236  flagellar motor protein MotB  32.34 
 
 		 339 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.501076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0079  flagellar motor protein MotB  33.22 
 
 		 340 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1308  flagellar motor protein MotB  28.86 
 
 		 308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0117  flagellar motor protein MotB  32.21 
 
 		 335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2976  flagellar motor protein MotB  32.88 
 
 		 369 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000103067 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2853  flagellar motor protein MotB  32.34 
 
 		 339 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0254  flagellar motor protein MotB  32.34 
 
 		 339 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.32393  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5607  flagellar motor protein MotB  30.48 
 
 		 325 aa  134  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.707499  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3817  flagellar motor protein MotB  32.21 
 
 		 335 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4409  OmpA/MotB domain-containing protein  30.43 
 
 		 312 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1939  flagellar motor protein MotB  28 
 
 		 308 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1901  OmpA/MotB domain-containing protein  28.22 
 
 		 371 aa  127  3e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.686994  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1410  flagellar motor protein MotB  29.85 
 
 		 314 aa  124  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.296374 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2886  OmpA/MotB domain-containing protein  28.38 
 
 		 298 aa  124  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00198086 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2873  chemotaxis signal transduction protein CheY  28.18 
 
 		 320 aa  124  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4158  flagellar motor protein MotB  29.45 
 
 		 315 aa  123  5e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.270622  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>