More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0460 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011374  UUR10_0460  DNA polymerase III DnaE  100 
 
 
969 aa  1957    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2690  DNA polymerase III, alpha subunit  34.53 
 
 
1104 aa  554  1e-156  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0549  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  34.66 
 
 
1134 aa  556  1e-156  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3288  DNA polymerase III DnaE  35.51 
 
 
1109 aa  550  1e-155  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4714  DNA polymerase III DnaE  36.47 
 
 
1108 aa  542  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4735  DNA polymerase III DnaE  36.6 
 
 
1108 aa  542  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4498  DNA polymerase III DnaE  36.49 
 
 
1108 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4333  DNA polymerase III DnaE  36.49 
 
 
1108 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4730  DNA polymerase III DnaE  36.6 
 
 
1108 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4719  DNA polymerase III DnaE  36.49 
 
 
1108 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4849  DNA polymerase III DnaE  36.49 
 
 
1108 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4345  DNA polymerase III DnaE  36.49 
 
 
1108 aa  539  1e-151  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0523  DNA polymerase III DnaE  36.35 
 
 
1108 aa  539  1e-151  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4434  DNA polymerase III DnaE  36.36 
 
 
1110 aa  534  1e-150  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1391  DNA polymerase III, alpha subunit  34.45 
 
 
1127 aa  523  1e-147  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0637  DNA-directed DNA polymerase III (polc)  37.2 
 
 
986 aa  522  1e-146  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0459907  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1872  DNA polymerase III DnaE  33.13 
 
 
1156 aa  518  1.0000000000000001e-145  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1050  DNA polymerase III, alpha subunit  31.46 
 
 
1075 aa  516  1.0000000000000001e-145  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.558692  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1192  DNA polymerase III DnaE  35.28 
 
 
1145 aa  512  1e-143  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0750  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  34.55 
 
 
1115 aa  512  1e-143  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1262  DNA polymerase III DnaE  38.39 
 
 
1139 aa  511  1e-143  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.842621  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl583  DNA polymerase III alpha subunit  37.04 
 
 
992 aa  507  9.999999999999999e-143  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0096  DNA polymerase III, alpha subunit  34.38 
 
 
1151 aa  504  1e-141  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.810427  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1396  DNA polymerase III, alpha subunit  32.75 
 
 
1159 aa  501  1e-140  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.253021  normal  0.727837 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0773  DNA polymerase III, alpha subunit  30.02 
 
 
1092 aa  500  1e-140  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0831  DNA polymerase III, alpha subunit  32.12 
 
 
1132 aa  502  1e-140  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1759  DNA polymerase III, alpha subunit  36.76 
 
 
1065 aa  497  1e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.463991  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1793  DNA polymerase III, alpha subunit  36.76 
 
 
1065 aa  497  1e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1225  DNA polymerase III, alpha subunit  31.61 
 
 
1164 aa  498  1e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.344496  normal  0.610841 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1266  DNA polymerase III, alpha subunit  35.16 
 
 
1065 aa  494  9.999999999999999e-139  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.502736  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0880  DNA polymerase III, alpha subunit  32.69 
 
 
1038 aa  495  9.999999999999999e-139  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.191787  hitchhiker  0.00000000000153929 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2747  DNA polymerase III, alpha subunit  31.55 
 
 
1159 aa  491  1e-137  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.782351 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2043  DNA polymerase III DnaE  33.86 
 
 
1130 aa  489  1e-137  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0675  DNA polymerase III, alpha subunit  35.49 
 
 
1148 aa  489  1e-136  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2068  DNA polymerase III, alpha subunit  30.74 
 
 
1184 aa  487  1e-136  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00797778  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1222  DNA polymerase III, alpha subunit  34.29 
 
 
1156 aa  484  1e-135  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1715  DNA polymerase III, alpha subunit  31.5 
 
 
1175 aa  484  1e-135  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.49916  normal  0.677237 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2507  DNA polymerase III, alpha subunit  32.93 
 
 
1157 aa  482  1e-134  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00161108  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1264  DNA polymerase III DnaE  33.51 
 
 
1181 aa  480  1e-134  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.756254  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03140  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  33.93 
 
 
1122 aa  482  1e-134  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.677635  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0130  DNA polymerase III, alpha subunit  30.97 
 
 
1173 aa  482  1e-134  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.103911 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2356  DNA polymerase III, alpha subunit  31.84 
 
 
992 aa  477  1e-133  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0212  DNA polymerase III, alpha subunit  32.56 
 
 
1167 aa  478  1e-133  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000022067  normal  0.693797 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3092  DNA polymerase III, alpha subunit  32.63 
 
 
1156 aa  476  1e-132  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00110918  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2786  DNA polymerase III subunit alpha  32.64 
 
 
1149 aa  473  1e-132  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1459  DNA polymerase III DnaE  33.37 
 
 
1159 aa  473  1e-132  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00150549  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1612  DNA polymerase III, alpha subunit  34.26 
 
 
1201 aa  474  1e-132  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00506055  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0774  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  32.37 
 
 
1112 aa  475  1e-132  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1169  DNA polymerase III, alpha subunit  32.6 
 
 
1155 aa  473  1.0000000000000001e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.34494e-16 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0434  DNA polymerase III, alpha subunit  30.26 
 
 
1139 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0632  DNA polymerase III, alpha subunit  31.19 
 
 
1182 aa  471  1.0000000000000001e-131  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.836983  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0780  DNA polymerase III, alpha subunit  35.76 
 
 
1109 aa  469  9.999999999999999e-131  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.493984  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1549  DNA polymerase III, alpha subunit  30.87 
 
 
1173 aa  469  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1358  DNA polymerase III subunit alpha  30.78 
 
 
1173 aa  469  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0632  DNA polymerase III, alpha subunit  40.61 
 
 
1165 aa  469  9.999999999999999e-131  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2319  DNA polymerase III DnaE  32.48 
 
 
1225 aa  469  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.511943  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0036  DNA polymerase III, alpha subunit  30.86 
 
 
1240 aa  465  1e-129  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2601  DNA polymerase III subunit alpha  30.69 
 
 
1151 aa  464  1e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.742859  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1885  DNA polymerase III, alpha subunit  31.97 
 
 
1182 aa  463  1e-129  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0335  DNA polymerase III DnaE  32.37 
 
 
1186 aa  463  1e-129  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1264  DNA polymerase III, alpha subunit  32.78 
 
 
1155 aa  463  1e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0198  DNA polymerase III subunit alpha  33.23 
 
 
1158 aa  464  1e-129  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0916  DNA polymerase III subunit alpha  29.86 
 
 
1162 aa  463  1e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1401  DNA polymerase III, alpha subunit  32.08 
 
 
1155 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.67909  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0506  DNA polymerase III subunit alpha  31.96 
 
 
1201 aa  461  9.999999999999999e-129  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3270  DNA polymerase III subunit alpha  30.03 
 
 
1151 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0265  DNA polymerase III subunit alpha  32.23 
 
 
1172 aa  462  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.309989  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1233  DNA polymerase III, alpha subunit  30.8 
 
 
1160 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0253  DNA polymerase III subunit alpha  32.67 
 
 
1160 aa  459  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.791308 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09341  DNA polymerase III subunit alpha  32.02 
 
 
1172 aa  461  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.146562 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1096  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  31.23 
 
 
1165 aa  460  9.999999999999999e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.35277  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf612  DNA polymerase III subunit alpha  35.91 
 
 
999 aa  461  9.999999999999999e-129  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.415572  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0741  DNA polymerase III subunit alpha  38.32 
 
 
1200 aa  456  1e-127  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.607066  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2402  DNA polymerase III subunit alpha  30.1 
 
 
1163 aa  457  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0818  DNA polymerase III subunit alpha  40.46 
 
 
1200 aa  456  1e-127  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0272  DNA polymerase III subunit alpha  32.48 
 
 
1160 aa  459  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.218941  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0269  DNA polymerase III subunit alpha  32.67 
 
 
1160 aa  459  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.814092 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1116  DNA polymerase III subunit alpha  30.09 
 
 
1173 aa  456  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2196  DNA polymerase III, alpha subunit  30.78 
 
 
1165 aa  457  1e-127  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0956  DNA polymerase III subunit alpha  30.78 
 
 
1160 aa  459  1e-127  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.582605  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3606  DNA polymerase III, alpha subunit  32.46 
 
 
1178 aa  459  1e-127  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.402124  normal  0.562756 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0578  DNA polymerase III subunit alpha  31.2 
 
 
1168 aa  457  1e-127  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0253  DNA polymerase III subunit alpha  32.67 
 
 
1160 aa  459  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.783595 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0809  DNA polymerase III DnaE  31.65 
 
 
1145 aa  457  1e-127  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000123157  decreased coverage  0.00151258 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1288  DNA polymerase III subunit alpha  36.68 
 
 
1200 aa  456  1.0000000000000001e-126  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.142761  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2731  DNA polymerase III, alpha subunit  29.78 
 
 
1174 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1480  DNA polymerase III, alpha subunit  31.35 
 
 
1159 aa  456  1.0000000000000001e-126  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.563322  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1028  DNA polymerase III subunit alpha  31.37 
 
 
1160 aa  455  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0257  DNA polymerase III subunit alpha  32.56 
 
 
1160 aa  455  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.988974 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0722  DNA polymerase III subunit alpha  31.46 
 
 
1160 aa  455  1.0000000000000001e-126  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.809003  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3038  DNA polymerase III subunit alpha  30.1 
 
 
1176 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.117325 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3420  DNA polymerase III subunit alpha  31.37 
 
 
1171 aa  454  1.0000000000000001e-126  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1849  DNA polymerase III, alpha subunit  31.23 
 
 
1182 aa  456  1.0000000000000001e-126  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.134668  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1742  DNA polymerase III subunit alpha  31.86 
 
 
1179 aa  453  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.209003  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0177  DNA polymerase III subunit alpha  32.71 
 
 
1160 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1081  DNA polymerase III subunit alpha  31.37 
 
 
1171 aa  454  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.990862  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2723  DNA polymerase III, alpha subunit  35.72 
 
 
1179 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00181  hypothetical protein  32.6 
 
 
1160 aa  452  1e-125  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.466902  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3476  DNA polymerase III subunit alpha  32.49 
 
 
1160 aa  451  1e-125  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0843038  normal  0.113533 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7295  DNA polymerase III, alpha subunit  29.95 
 
 
1158 aa  451  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20831  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>