More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1494 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_1494  response regulator receiver protein  100 
 
 		 138 aa  278  2e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0411  two component transcriptional regulator  41.18 
 
 		 230 aa  102  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1461  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.65 
 
 		 227 aa  102  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0439  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.91 
 
 		 230 aa  101  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0440  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.54 
 
 		 230 aa  101  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  45.45 
 
 		 233 aa  100  9e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  44.63 
 
 		 231 aa  100  9e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4308  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.86 
 
 		 552 aa  99  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0015  two component transcriptional regulator  41.6 
 
 		 228 aa  99  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1749  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.72 
 
 		 242 aa  98.2  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3069  two component transcriptional regulator  37.88 
 
 		 230 aa  98.6  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467461  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3686  response regulator receiver  45.45 
 
 		 233 aa  98.2  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  43.8 
 
 		 231 aa  97.8  4e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3565  response regulator receiver protein  41.6 
 
 		 126 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0960945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3961  heavy metal response regulator  46.15 
 
 		 229 aa  97.1  7e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00889091  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1485  response regulator receiver  40.31 
 
 		 235 aa  97.1  8e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.236897  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4159  two component transcriptional regulator  38.06 
 
 		 230 aa  96.7  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.667277  normal  0.0359145 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.75 
 
 		 233 aa  96.3  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0984  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.98 
 
 		 246 aa  95.5  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0723779 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6987  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.22 
 
 		 225 aa  95.5  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.67799  normal  0.586494 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  36.84 
 
 		 239 aa  95.5  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4465  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  46.15 
 
 		 206 aa  95.5  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0436659 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001641  putative two component response regulator transcription regulator protein  41.46 
 
 		 230 aa  95.9  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.170142  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1505  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.22 
 
 		 225 aa  95.5  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.228186  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6324  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.22 
 
 		 225 aa  95.5  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.313253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1501  response regulator receiver protein  41.46 
 
 		 132 aa  95.9  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.153095  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  36.84 
 
 		 239 aa  95.5  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2348  putative two-component response regulator  43.44 
 
 		 228 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.804247  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2201  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  42.74 
 
 		 227 aa  95.1  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3985  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  43.38 
 
 		 226 aa  95.1  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4842  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.12 
 
 		 225 aa  94.7  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.649395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.7 
 
 		 225 aa  94.7  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1815  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.15 
 
 		 224 aa  94.4  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.275759  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2725  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.74 
 
 		 227 aa  94.7  4e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13280  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.62 
 
 		 227 aa  94.4  5e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536961  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0058  two component transcriptional regulator  41.82 
 
 		 221 aa  94.4  5e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000551146  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.44 
 
 		 224 aa  94  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5744  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.22 
 
 		 225 aa  94  7e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0360294  normal  0.749662 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2104  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.31 
 
 		 225 aa  94  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5988  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.22 
 
 		 225 aa  94  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.34 
 
 		 247 aa  93.6  8e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.520505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27810  putative two-component response regulator  42.62 
 
 		 226 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  43.9 
 
 		 236 aa  93.2  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1997  two component transcriptional regulator  38.58 
 
 		 234 aa  93.2  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1103  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.83 
 
 		 227 aa  92.8  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0130  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.73 
 
 		 224 aa  92.4  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00147609  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.37 
 
 		 237 aa  92.4  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 235 aa  92  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1780  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  42.28 
 
 		 228 aa  92.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.817023  normal  0.826624 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1751  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.74 
 
 		 224 aa  92  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 235 aa  92  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0845  response regulator receiver protein  39.2 
 
 		 125 aa  92.4  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.455865  normal  0.167506 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52250  two-component response regulator  44.95 
 
 		 239 aa  92  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.220903 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  40 
 
 		 235 aa  92  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2892  two component transcriptional regulator  45.95 
 
 		 227 aa  92  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0239565 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2637  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.69 
 
 		 227 aa  92.4  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  40 
 
 		 235 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  40 
 
 		 235 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  40 
 
 		 235 aa  91.7  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3720  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  45.45 
 
 		 224 aa  91.7  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  40 
 
 		 235 aa  91.7  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  40 
 
 		 235 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  40 
 
 		 235 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  40 
 
 		 235 aa  91.7  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4055  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  46.15 
 
 		 226 aa  91.7  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0483  two component transcriptional regulator  41.53 
 
 		 229 aa  91.7  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.342081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  40 
 
 		 235 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1699  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.59 
 
 		 226 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419772 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1208  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  41.98 
 
 		 226 aa  91.7  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3584  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.59 
 
 		 226 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2946  DNA-binding heavy metal response regulator  44.44 
 
 		 223 aa  91.3  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2158  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.59 
 
 		 226 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144347  normal  0.036827 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2022  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  42.86 
 
 		 589 aa  91.3  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0789  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 278 aa  91.3  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.54 
 
 		 231 aa  91.3  4e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5978  regulatory protein CzcR  39.68 
 
 		 225 aa  91.3  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000269255  normal  0.0723212 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5257  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.92 
 
 		 234 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.025536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4508  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.84 
 
 		 231 aa  91.3  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0489  response regulator for cobalt zinc cadmium resistance transcription regulator protein  44.44 
 
 		 224 aa  90.9  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1505  response regulator receiver  38.71 
 
 		 219 aa  90.9  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.404603  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1760  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  39.68 
 
 		 225 aa  91.3  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133831  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3426  DNA-binding transcriptional activator CusR  40.77 
 
 		 226 aa  90.9  5e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4156  two component transcriptional regulator  40.46 
 
 		 232 aa  90.9  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000307056  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1476  two component transcriptional regulator  38.71 
 
 		 219 aa  90.9  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3962  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.35 
 
 		 225 aa  90.9  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3155  two component transcriptional regulator  46.79 
 
 		 228 aa  90.9  5e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2570  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.98 
 
 		 239 aa  90.9  6e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0567  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.13 
 
 		 225 aa  90.5  6e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.463355  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21520  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  42.5 
 
 		 222 aa  90.9  6e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0794896  hitchhiker  0.0000630157 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2234  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.98 
 
 		 225 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.162422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1675  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.74 
 
 		 226 aa  90.5  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3412  two component heavy metal response transcriptional regulator  40.98 
 
 		 226 aa  90.5  6e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.93 
 
 		 266 aa  90.5  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.453489  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3855  two component heavy metal response transcriptional regulator  41.03 
 
 		 226 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845216 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0528  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.36 
 
 		 223 aa  90.5  7e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2476  two component transcriptional regulator  43.64 
 
 		 227 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.210757  normal  0.512741 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.98 
 
 		 224 aa  90.5  7e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4718  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  43.22 
 
 		 239 aa  90.1  8e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.220817 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3615  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  41.67 
 
 		 224 aa  90.1  8e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3075  DNA-binding transcriptional activator CusR  41.18 
 
 		 227 aa  90.1  8e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.204173  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>