More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1339 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3710  transcription termination factor Rho  71.66 
 
 		 445 aa  642    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.238599  hitchhiker  0.000000242256 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3222  transcription termination factor Rho  73.98 
 
 		 444 aa  641    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.584785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1339  transcription termination factor Rho  100 
 
 		 642 aa  1314    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3377  transcription termination factor Rho  71.67 
 
 		 416 aa  628  1e-178  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000542218  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3627  transcription termination factor Rho  71.6 
 
 		 420 aa  621  1e-176  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.2483  normal  0.795626 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1189  transcription termination factor  61.67 
 
 		 424 aa  540  9.999999999999999e-153  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000172016  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3439  transcription termination factor Rho  64.34 
 
 		 424 aa  538  1e-151  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1215  transcription termination factor Rho  61.19 
 
 		 424 aa  537  1e-151  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000539864  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3329  transcription termination factor Rho  63.13 
 
 		 424 aa  532  1e-150  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000488877  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1356  transcription termination factor Rho  70.64 
 
 		 417 aa  535  1e-150  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00013646  hitchhiker  0.000000585861 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2782  transcription termination factor Rho  62.75 
 
 		 434 aa  531  1e-149  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000423025  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3853  transcription termination factor Rho  62.14 
 
 		 423 aa  523  1e-147  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000371532  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5424  transcription termination factor Rho  61.41 
 
 		 423 aa  521  1e-146  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.80667e-59 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5460  transcription termination factor Rho  61.41 
 
 		 423 aa  521  1e-146  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000364812  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5181  transcription termination factor Rho  61.17 
 
 		 423 aa  519  1e-146  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.21574  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5016  transcription termination factor Rho  61.41 
 
 		 423 aa  521  1e-146  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.88034e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5032  transcription termination factor Rho  61.41 
 
 		 423 aa  521  1e-146  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00629962  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5575  transcription termination factor Rho  61.17 
 
 		 423 aa  519  1e-146  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000155129  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5510  transcription termination factor Rho  61.41 
 
 		 423 aa  521  1e-146  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000155234  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5455  transcription termination factor Rho  61.17 
 
 		 423 aa  520  1e-146  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000522794  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3174  transcription termination factor Rho  60.34 
 
 		 450 aa  520  1e-146  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000371975  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5497  transcription termination factor Rho  61.17 
 
 		 423 aa  520  1e-146  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000613532  unclonable  1.32525e-25 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2174  transcription termination factor Rho  65.93 
 
 		 653 aa  521  1e-146  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000672374  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1252  transcription termination factor Rho  61.11 
 
 		 457 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.180774  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1711  transcription termination factor Rho  58.8 
 
 		 437 aa  518  1.0000000000000001e-145  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000145962  normal  0.971448 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0059  transcription termination factor Rho  60 
 
 		 436 aa  513  1e-144  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.121136  hitchhiker  0.0035916 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5130  transcription termination factor Rho  60.92 
 
 		 423 aa  514  1e-144  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000119523  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18010  transcription termination factor Rho  58.7 
 
 		 418 aa  510  1e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000155456  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3229  transcription termination factor Rho  57.97 
 
 		 415 aa  509  1e-143  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000000548676  normal  0.0477745 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3376  transcription termination factor Rho  65 
 
 		 690 aa  508  9.999999999999999e-143  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000138614  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3808  transcription termination factor Rho  57.66 
 
 		 415 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0470  transcription termination factor Rho  58.15 
 
 		 414 aa  505  9.999999999999999e-143  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000467448  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2651  transcription termination factor Rho  57.91 
 
 		 415 aa  506  9.999999999999999e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000111099  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3713  transcription termination factor Rho  57.66 
 
 		 415 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000184202  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2695  transcription termination factor Rho  57.66 
 
 		 415 aa  504  1e-141  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000315458  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4065  transcription termination factor Rho  57.18 
 
 		 415 aa  502  1e-141  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000187673  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3108  transcription termination factor Rho  56.69 
 
 		 415 aa  500  1e-140  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0089  transcription termination factor Rho  65.85 
 
 		 508 aa  502  1e-140  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000346786  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2408  transcription termination factor Rho  60.1 
 
 		 425 aa  499  1e-140  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000414081  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1025  transcription termination factor Rho  56.69 
 
 		 415 aa  499  1e-140  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0252595  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3932  transcription termination factor Rho  56.9 
 
 		 421 aa  498  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.713144  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0376  transcription termination factor Rho  56.45 
 
 		 415 aa  496  1e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000395561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3619  transcription termination factor Rho  56.9 
 
 		 418 aa  497  1e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4258  transcription termination factor Rho  56.9 
 
 		 421 aa  497  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.884099 
 
 
-
 
NC_004310  BR2064  transcription termination factor Rho  56.17 
 
 		 421 aa  494  9.999999999999999e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.244754  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0856  transcription termination factor Rho  56.17 
 
 		 421 aa  495  9.999999999999999e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.447055  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0204  transcription termination factor Rho  56.73 
 
 		 419 aa  492  9.999999999999999e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4391  transcription termination factor Rho  56.42 
 
 		 421 aa  494  9.999999999999999e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3206  transcription termination factor Rho  56.66 
 
 		 421 aa  495  9.999999999999999e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0843  transcription termination factor Rho  56.07 
 
 		 415 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.0000000000858809  normal  0.0802102 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1728  transcription termination factor Rho  58.8 
 
 		 438 aa  489  1e-137  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00025665  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1824  transcription termination factor Rho  56.28 
 
 		 422 aa  490  1e-137  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0768704 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4143  transcription termination factor Rho  56.49 
 
 		 419 aa  490  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4128  transcription termination factor Rho  56.49 
 
 		 419 aa  490  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4246  transcription termination factor Rho  56.49 
 
 		 419 aa  490  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0148  transcription termination factor Rho  56.83 
 
 		 419 aa  491  1e-137  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00136527  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2402  transcription termination factor Rho  61.96 
 
 		 429 aa  489  1e-137  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4203  transcription termination factor Rho  56.09 
 
 		 450 aa  489  1e-137  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0160  transcription termination factor Rho  56.25 
 
 		 419 aa  489  1e-137  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.227506 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4305  transcription termination factor Rho  56.49 
 
 		 419 aa  490  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1984  transcription termination factor Rho  55.93 
 
 		 418 aa  490  1e-137  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3474  transcription termination factor Rho  56.17 
 
 		 429 aa  491  1e-137  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0157  transcription termination factor Rho  56.49 
 
 		 419 aa  489  1e-137  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4011  transcription termination factor Rho  56.32 
 
 		 450 aa  491  1e-137  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0137  transcription termination factor Rho  56.55 
 
 		 421 aa  489  1e-137  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000246562  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4197  transcription termination factor Rho  56.49 
 
 		 419 aa  490  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03661  transcription termination factor Rho  56.01 
 
 		 419 aa  487  1e-136  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000324277  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4194  transcription termination factor Rho  56.01 
 
 		 419 aa  487  1e-136  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000794569  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0180  transcription termination factor Rho  55.77 
 
 		 419 aa  486  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4288  transcription termination factor Rho  55.93 
 
 		 428 aa  488  1e-136  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0673197 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1260  transcription termination factor Rho  55.45 
 
 		 422 aa  487  1e-136  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2195  transcription termination factor Rho  58.55 
 
 		 438 aa  488  1e-136  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00569958  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03610  hypothetical protein  56.01 
 
 		 419 aa  487  1e-136  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000108874  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002098  transcription termination factor Rho  55.88 
 
 		 419 aa  487  1e-136  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000734863  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5215  transcription termination factor Rho  56.01 
 
 		 419 aa  487  1e-136  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4220  transcription termination factor Rho  56.01 
 
 		 419 aa  487  1e-136  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00203599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3999  transcription termination factor Rho  56.01 
 
 		 419 aa  487  1e-136  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0511  transcription termination factor Rho  55.77 
 
 		 419 aa  486  1e-136  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0322242 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4003  transcription termination factor Rho  55.53 
 
 		 419 aa  486  1e-136  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.499603  normal  0.016258 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4034  transcription termination factor Rho  55.77 
 
 		 419 aa  486  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.462931  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2157  transcription termination factor Rho  58.55 
 
 		 438 aa  488  1e-136  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.894966  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4139  transcription termination factor Rho  56.01 
 
 		 419 aa  487  1e-136  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4293  transcription termination factor Rho  56.01 
 
 		 419 aa  487  1e-136  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4146  transcription termination factor Rho  56.01 
 
 		 419 aa  487  1e-136  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1456  transcription termination factor Rho  55.29 
 
 		 431 aa  486  1e-136  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00134709  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0499  transcription termination factor Rho  48.69 
 
 		 497 aa  482  1e-135  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000619502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1001  transcription termination factor Rho  55.69 
 
 		 436 aa  483  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0100  transcription termination factor Rho  55.69 
 
 		 421 aa  482  1e-135  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.581004  normal  0.035165 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1377  transcription termination factor Rho  55.45 
 
 		 436 aa  483  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0362049  normal  0.0185592 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2290  transcription termination factor Rho  55.53 
 
 		 419 aa  483  1e-135  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000767102  normal  0.288713 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2210  transcription termination factor Rho  54.83 
 
 		 418 aa  484  1e-135  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000272927  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2699  transcription termination factor Rho  56.12 
 
 		 419 aa  485  1e-135  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000370225  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2184  transcription termination factor Rho  54.83 
 
 		 418 aa  484  1e-135  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.000000392995  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2173  transcription termination factor Rho  63.04 
 
 		 492 aa  485  1e-135  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1968  transcription termination factor Rho  54.4 
 
 		 435 aa  485  1e-135  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.6615 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3567  transcription termination factor Rho  56.52 
 
 		 422 aa  484  1e-135  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.235782  normal  0.891828 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2970  transcription termination factor Rho  54.2 
 
 		 436 aa  484  1e-135  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1678  transcription termination factor Rho  55.21 
 
 		 447 aa  484  1e-135  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0702428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00336  transcription termination factor Rho  55.4 
 
 		 419 aa  485  1e-135  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0491  transcription termination factor Rho  55.56 
 
 		 416 aa  483  1e-135  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000212536 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>