190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1875 on replicon NC_008696
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008696  Tpen_1875  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 		 633 aa  1276    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0308  type III restriction protein res subunit  31.09 
 
 		 449 aa  139  1e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1455  type III restriction protein res subunit  33.33 
 
 		 444 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.437061  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2843  type III restriction protein res subunit  30.99 
 
 		 444 aa  127  5e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.109265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0583  DNA repair helicase RAD25  28.92 
 
 		 443 aa  125  2e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.71742  normal  0.481027 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2015  type III restriction protein res subunit  30.15 
 
 		 488 aa  124  4e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1743  DNA repair helicase RAD25  26.74 
 
 		 531 aa  122  1.9999999999999998e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.763617 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0670  type III restriction protein res subunit  33.7 
 
 		 652 aa  120  7.999999999999999e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1936  type III restriction protein res subunit  28.88 
 
 		 551 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0298009  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2643  DNA repair helicase RAD25  30.77 
 
 		 491 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0920189 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0659  type III restriction protein res subunit  30.79 
 
 		 531 aa  119  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1994  type III restriction enzyme, res subunit  31.5 
 
 		 468 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.143159  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1762  type III restriction enzyme, res subunit  28.65 
 
 		 451 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1556  type III restriction protein res subunit  30.45 
 
 		 470 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3083  type III restriction protein res subunit  28.91 
 
 		 466 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3185  type III restriction protein res subunit  28.87 
 
 		 466 aa  111  3e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1646  type III restriction enzyme, res subunit  32.24 
 
 		 654 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0299889 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0649  type III restriction enzyme, res subunit  27.46 
 
 		 462 aa  102  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.674278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1040  type III restriction enzyme, res subunit  30.91 
 
 		 385 aa  101  4e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0605  type III restriction enzyme, res subunit  31.84 
 
 		 647 aa  101  5e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1769  type III restriction enzyme, res subunit  26.97 
 
 		 464 aa  101  5e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4437  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  25.55 
 
 		 951 aa  99.4  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.118841 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1709  type III restriction protein res subunit  26.42 
 
 		 494 aa  99.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.17082  normal  0.0133576 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2154  type III restriction enzyme, res subunit  31.36 
 
 		 650 aa  97.1  8e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.508076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2199  Type III restriction enzyme, res subunit  26.93 
 
 		 492 aa  97.1  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2481  type III restriction enzyme, res subunit  26.95 
 
 		 706 aa  95.9  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.839221  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0100  type III restriction protein res subunit  28.34 
 
 		 440 aa  95.5  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000273539  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31430  DNA/RNA helicase, superfamily II  28.68 
 
 		 558 aa  95.1  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0658169  normal  0.0482356 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3296  helicase domain-containing protein  27.85 
 
 		 551 aa  94.7  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.553593 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1191  type III restriction protein res subunit  29.2 
 
 		 451 aa  92  3e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0079  type III restriction protein res subunit  27.15 
 
 		 499 aa  91.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0563  type III restriction protein res subunit  26.3 
 
 		 509 aa  91.3  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0580  type III restriction protein res subunit  26.3 
 
 		 509 aa  91.3  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2049  helicase domain protein  26.83 
 
 		 558 aa  91.3  5e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1901  type III restriction enzyme, res subunit  28.71 
 
 		 451 aa  90.9  7e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0725  helicase domain protein  27.96 
 
 		 548 aa  89.7  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.013884  hitchhiker  0.0000273082 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4175  type III restriction protein res subunit  27.42 
 
 		 479 aa  89  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.776953  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0951  Type III restriction enzyme, res subunit  27.2 
 
 		 517 aa  89  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.12396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2593  type III restriction protein res subunit  26.2 
 
 		 493 aa  88.6  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0773  type III restriction protein res subunit  25.78 
 
 		 463 aa  88.2  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0952838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0787  helicase domain-containing protein  27.13 
 
 		 551 aa  87.8  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0960  type III restriction protein res subunit  26.47 
 
 		 485 aa  87.4  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1942  type III restriction enzyme, res subunit  25.43 
 
 		 469 aa  86.7  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.823738  normal  0.0282791 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1218  type III restriction protein res subunit  26.47 
 
 		 485 aa  86.7  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150525 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0708  type III restriction protein res subunit  25.49 
 
 		 479 aa  86.3  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.922597 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0846  type III restriction protein res subunit  26.83 
 
 		 548 aa  85.9  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0849054  normal  0.0359313 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2739  helicase domain protein  22.98 
 
 		 564 aa  85.5  0.000000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.628328  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0905  helicase domain protein  27.03 
 
 		 548 aa  84.7  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.223145 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4977  type III restriction protein res subunit  27.95 
 
 		 479 aa  85.1  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.313567  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1432  type III restriction enzyme, res subunit  29.46 
 
 		 451 aa  85.1  0.000000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.503563  normal  0.0109836 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08201  component of the holoenzyme form of RNA polymerase transcription factor (Eurofung)  24.44 
 
 		 818 aa  84.3  0.000000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0920251 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8907  hypothetical protein  27.47 
 
 		 548 aa  84.7  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0819  type III restriction protein res subunit  25.14 
 
 		 479 aa  84.7  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0809  type III restriction protein res subunit  25.81 
 
 		 556 aa  84  0.000000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2026  type III restriction protein res subunit  24.69 
 
 		 489 aa  84  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82790  DNA helicase  25.27 
 
 		 838 aa  84  0.000000000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.179856 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3146  type III restriction protein res subunit  26.94 
 
 		 630 aa  83.2  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0164842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07930  DNA/RNA helicase, superfamily II  25.95 
 
 		 555 aa  83.2  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181797  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0810  helicase domain protein  27.37 
 
 		 550 aa  83.6  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0896  type III restriction protein res subunit  25.2 
 
 		 479 aa  83.2  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2932  type III restriction protein res subunit  25.81 
 
 		 558 aa  82.8  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4190  helicase domain protein  27.03 
 
 		 548 aa  82.4  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1918  DEAD/DEAH box helicase-like  26.43 
 
 		 602 aa  82  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0105236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4412  type III restriction enzyme, res subunit  24.36 
 
 		 590 aa  82.4  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21590  DNA/RNA helicase, superfamily II  26.68 
 
 		 550 aa  81.6  0.00000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.515357  hitchhiker  0.0079461 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1032  type III restriction protein res subunit  25.35 
 
 		 479 aa  80.9  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1535  type III restriction protein res subunit  26.94 
 
 		 658 aa  80.9  0.00000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0652  type III restriction enzyme, res subunit  25.32 
 
 		 630 aa  80.9  0.00000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  unclonable  0.000000732435  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2052  type III restriction protein res subunit  24.75 
 
 		 489 aa  80.5  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0299  DNA repair helicase RAD25  29.32 
 
 		 456 aa  80.1  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3950  helicase domain-containing protein  26.02 
 
 		 581 aa  79.3  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.626862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4341  helicase domain-containing protein  25.75 
 
 		 559 aa  79  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0358  type III restriction protein res subunit  24.11 
 
 		 843 aa  79  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.421793  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10878  DNA helicase ercc3  27.82 
 
 		 542 aa  78.2  0.0000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000621155  normal  0.128196 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1210  helicase domain protein  26.76 
 
 		 555 aa  77.8  0.0000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0803  type III restriction protein res subunit  25.41 
 
 		 561 aa  77.8  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.310817  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05940  general RNA polymerase II transcription factor, putative  23.72 
 
 		 866 aa  77  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.687804  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03900  hypothetical protein  25 
 
 		 998 aa  77  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.114045  normal  0.665551 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4400  helicase-like  26.27 
 
 		 545 aa  76.3  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5056  type III restriction enzyme, res subunit  25.61 
 
 		 549 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34360  DNA/RNA helicase, superfamily II  26.53 
 
 		 548 aa  75.9  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5118  type III restriction protein res subunit  25.17 
 
 		 666 aa  75.1  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0453  type III restriction protein res subunit  25.2 
 
 		 550 aa  74.7  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1697  type III restriction enzyme, res subunit  25.89 
 
 		 549 aa  74.7  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.859108 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34480  predicted protein  22.19 
 
 		 781 aa  74.7  0.000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2313  type III restriction protein res subunit  26.84 
 
 		 706 aa  74.7  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2721  helicase domain-containing protein  23.5 
 
 		 590 aa  74.3  0.000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4485  type III restriction enzyme, res subunit  25.47 
 
 		 549 aa  74.3  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.111108  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4572  type III restriction enzyme, res subunit  25.47 
 
 		 549 aa  74.3  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0637895 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4868  type III restriction enzyme, res subunit  25.47 
 
 		 549 aa  74.3  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.712757  normal  0.131426 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1537  type III restriction enzyme, res subunit  23.1 
 
 		 732 aa  73.9  0.000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3612  helicase domain protein  26.22 
 
 		 557 aa  73.2  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.175264  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1374  type III restriction protein res subunit  25.67 
 
 		 707 aa  73.2  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.304908  normal  0.550958 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00119  Type III restriction enzyme, res subunit  24.63 
 
 		 744 aa  72  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.431054  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02470  DEAD box family helicase, putative  27.45 
 
 		 706 aa  71.6  0.00000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.384709  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0173  helicase domain-containing protein  25.47 
 
 		 545 aa  71.6  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0878922 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0725  DEAD/DEAH box helicase-like  22.61 
 
 		 469 aa  70.1  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8107  helicase domain protein  24.86 
 
 		 548 aa  70.5  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6094  type III restriction protein res subunit  23.95 
 
 		 549 aa  69.7  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3947  helicase domain-containing protein  25.48 
 
 		 546 aa  69.3  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>