168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1721 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0076  Formamidase  84.41 
 
 		 418 aa  706    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2262  formamidase  85.37 
 
 		 417 aa  722    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2309  formamidase  85.37 
 
 		 417 aa  722    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12120  predicted acetamidase/formamidase  76.74 
 
 		 418 aa  659    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181447  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19680  predicted acetamidase/formamidase  74.09 
 
 		 414 aa  634    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0111175 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2301  formamidase  85.13 
 
 		 417 aa  721    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.506693 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1721  Formamidase  100 
 
 		 418 aa  853    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787514  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2158  Formamidase  82.01 
 
 		 417 aa  685    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.062604  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5199  Formamidase  83.21 
 
 		 417 aa  687    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0422  Formamidase  65.22 
 
 		 415 aa  554  1e-156  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0857845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2658  formamidase  60.72 
 
 		 416 aa  501  1e-141  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2309  Formamidase  58.5 
 
 		 397 aa  489  1e-137  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3110  Formamidase  58.91 
 
 		 408 aa  476  1e-133  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.441852  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3860  formamidase  56.39 
 
 		 410 aa  468  9.999999999999999e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.534213  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1777  formamidase  55.42 
 
 		 406 aa  464  1e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00161545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0981  formamidase  57 
 
 		 410 aa  463  1e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.068454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0179  formamidase  55.8 
 
 		 410 aa  458  9.999999999999999e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4073  formamidase  54.66 
 
 		 410 aa  455  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.398995  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0569  formamidase  54.93 
 
 		 410 aa  455  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1706  formamidase (FmdA)  55.17 
 
 		 410 aa  455  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0170244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0225  formamidase  55.37 
 
 		 409 aa  456  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1598  Formamidase  57.4 
 
 		 411 aa  456  1e-127  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.52036  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5673  formamidase  56.16 
 
 		 412 aa  455  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3737  formamidase  55.91 
 
 		 412 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4631  formamidase  55.91 
 
 		 412 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1448  Formamidase  54.68 
 
 		 409 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360137  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2157  Formamidase  55.87 
 
 		 420 aa  441  1e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174868  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3592  formamidase  55.17 
 
 		 409 aa  444  1e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2970  formamidase  54.81 
 
 		 410 aa  438  9.999999999999999e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.231861 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0598  formamidase  54.3 
 
 		 409 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.412035  normal  0.0121636 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3569  formamidase  56.83 
 
 		 408 aa  436  1e-121  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.704003  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3140  Formamidase  55.23 
 
 		 410 aa  437  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3684  Formamidase  53.81 
 
 		 409 aa  434  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3375  formamidase  53.81 
 
 		 409 aa  434  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5506  formamidase  54.55 
 
 		 409 aa  429  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3566  Formamidase  54.3 
 
 		 409 aa  426  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1257  formamidase  55.17 
 
 		 409 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.66975  normal  0.173821 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3859  formamidase  54.68 
 
 		 409 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_54476  formidase  50.35 
 
 		 451 aa  416  9.999999999999999e-116  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.185862  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0659  formamidase (formamide amidohydrolase)  53.45 
 
 		 409 aa  417  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190134  normal  0.386066 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2285  Acetamidase/Formamidase  49.65 
 
 		 423 aa  400  9.999999999999999e-111  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.117842 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28914  formamidase  48.67 
 
 		 426 aa  380  1e-104  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0986635 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04577  FormamidasePutative uncharacterized protein (EC 3.5.1.49); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9C453]  49 
 
 		 411 aa  374  1e-102  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.469129 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21390  predicted acetamidase/formamidase  45.23 
 
 		 401 aa  310  4e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.737575  normal  0.761775 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2612  formamidase  53.16 
 
 		 206 aa  206  5e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0583639  normal  0.408367 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2662  formamidase  36.46 
 
 		 393 aa  199  7e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0022  Formamidase  33.5 
 
 		 459 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.846742  normal  0.0101399 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0965  formamidase  36.04 
 
 		 388 aa  176  6e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0855422  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0627  Formamidase  31.93 
 
 		 318 aa  159  8e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0465  formamidase  29.92 
 
 		 322 aa  154  2.9999999999999998e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000577809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3711  Formamidase  30.41 
 
 		 328 aa  142  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3253  acetamidase / formamidase  29.79 
 
 		 319 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.426618  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3987  acetamidase/formamidase  29.79 
 
 		 319 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3274  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  29.52 
 
 		 319 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3551  acetamidase/formamidase  28.38 
 
 		 312 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0213  acetamidase/formamidase  28.76 
 
 		 315 aa  107  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179184  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1337  acetamidase/formamidase  27.85 
 
 		 312 aa  107  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2810  Acetamidase/Formamidase  27.06 
 
 		 313 aa  107  5e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.451627 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5629  formamidase  27.63 
 
 		 314 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6677  Acetamidase/Formamidase  26.95 
 
 		 314 aa  99.8  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.47216 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1750  acetamidase/formamidase  27.41 
 
 		 314 aa  99.4  9e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3207  putative acetamidase/formamidase family protein  28.38 
 
 		 329 aa  84.7  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3454  formamidase  27.59 
 
 		 224 aa  82.4  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0172386  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1423  acetamidase/formamidase  26.26 
 
 		 340 aa  79.7  0.00000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0412  Acetamidase/Formamidase  27.38 
 
 		 301 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0804  Acetamidase/Formamidase  26.29 
 
 		 329 aa  77.4  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.700678  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37719  formamidase-like protein  29.69 
 
 		 389 aa  77  0.0000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.990726  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4962  acetamidase/formamidase  30.94 
 
 		 491 aa  76.6  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3711  acetamidase/formamidase  30.92 
 
 		 315 aa  76.6  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3015  acetamidase/formamidase  26.18 
 
 		 329 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.507939 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0602  transcriptional regulator  31.96 
 
 		 791 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.459823 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3600  hypothetical protein  30.94 
 
 		 485 aa  73.9  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.229476  normal  0.563302 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3317  acetamidase/formamidase  27.47 
 
 		 330 aa  73.9  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6506  hypothetical protein  25.82 
 
 		 413 aa  73.6  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1803  acetamidase/formamidase  27.37 
 
 		 358 aa  72.8  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0385546 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4293  acetamidase/formamidase  25.7 
 
 		 332 aa  72  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0097508 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0497  acetamidase/formamidase  32.27 
 
 		 481 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.380834 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5148  AraC family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 791 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113403  normal  0.388231 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4153  Acetamidase/Formamidase  28.09 
 
 		 305 aa  70.9  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2668  Acetamidase/Formamidase  27.3 
 
 		 329 aa  70.9  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.896423  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0603  acetamidase/formamidase  29.07 
 
 		 343 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1548  amidase  25.71 
 
 		 439 aa  70.1  0.00000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0188778 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2779  Acetamidase/Formamidase  27.19 
 
 		 363 aa  69.3  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.190953  hitchhiker  0.0000139746 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4612  acetamidase/formamidase  25.33 
 
 		 324 aa  68.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.153809  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2654  acetamidase/formamidase family protein  25.77 
 
 		 304 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00018513  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2678  Acetamidase/Formamidase  23.59 
 
 		 311 aa  68.6  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00100593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4413  acetamidase/formamidase  29.81 
 
 		 315 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0256307  normal  0.284988 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5754  Acetamidase/Formamidase  25 
 
 		 328 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.841044 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2104  twin-arginine translocation pathway signal  28.7 
 
 		 483 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5149  acetamidase/formamidase  28.52 
 
 		 343 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.606988  normal  0.788992 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1574  acetamidase/formamidase  27.46 
 
 		 498 aa  67.8  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.569924  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1964  acetamidase/formamidase  29.92 
 
 		 350 aa  67.8  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.21645 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0828  acetamidase/formamidase  31 
 
 		 479 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.47116 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0982  acetamidase/formamidase  29.12 
 
 		 359 aa  67  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.555434 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2755  acetamidase/formamidase family protein  26.54 
 
 		 304 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000518769 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0788  Acetamidase/Formamidase  31 
 
 		 479 aa  67.4  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0609458 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2418  acetamidase/formamidase family protein  26.14 
 
 		 304 aa  67  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.397586  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2342  acetamidase  26.14 
 
 		 304 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.640951  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2596  acetamidase/formamidase family protein  26.14 
 
 		 304 aa  67  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.669172  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2616  acetamidase/formamidase family protein  23.96 
 
 		 304 aa  67  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00237605  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>