246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1053 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1053  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 322 aa  641    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.319605  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3643  beta-lactamase domain-containing protein  37.81 
 
 		 299 aa  191  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.700261 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2457  beta-lactamase-like  38.77 
 
 		 301 aa  172  5.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5423  beta-lactamase domain protein  34.04 
 
 		 295 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1891  beta-lactamase  37.74 
 
 		 304 aa  162  6e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0320252  normal  0.505786 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2125  putative beta-lactamase  38.93 
 
 		 288 aa  162  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.592444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1205  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  34.88 
 
 		 288 aa  160  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3214  beta-lactamase  34.02 
 
 		 306 aa  159  5e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8804  beta-lactamase domain protein  38.41 
 
 		 299 aa  159  8e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4444  beta-lactamase domain-containing protein  36.23 
 
 		 302 aa  159  9e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.398437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3119  Beta-lactamase-like  33.94 
 
 		 297 aa  158  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1080  beta-lactamase domain-containing protein  34.89 
 
 		 294 aa  157  2e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.0034606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3353  beta-lactamase domain protein  34.89 
 
 		 332 aa  157  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.289767  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4368  Beta-lactamase-like  31.77 
 
 		 315 aa  156  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.92832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0290  beta-lactamase domain protein  39.41 
 
 		 317 aa  156  4e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4217  beta-lactamase-like protein  35.87 
 
 		 302 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.23689  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4283  beta-lactamase domain-containing protein  35.87 
 
 		 302 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1508  Beta-lactamase-like  33.69 
 
 		 296 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.265007  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1027  beta-lactamase domain protein  38.33 
 
 		 297 aa  152  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1208  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  34.77 
 
 		 287 aa  152  8.999999999999999e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4233  Beta-lactamase-like  33.33 
 
 		 282 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.569692 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4084  beta-lactamase-like  32.97 
 
 		 282 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0731  beta-lactamase-like  35.76 
 
 		 283 aa  144  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.894293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4911  beta-lactamase domain protein  33.82 
 
 		 282 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.136206  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7341  Beta-lactamase-like  33.69 
 
 		 297 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.931286  normal  0.839183 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4788  beta-lactamase domain protein  43.97 
 
 		 294 aa  134  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635267  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8301  beta-lactamase domain protein  36.59 
 
 		 292 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5633  beta-lactamase domain-containing protein  33.45 
 
 		 300 aa  129  8.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4066  beta-lactamase domain protein  34.41 
 
 		 282 aa  104  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.724377  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4837  beta-lactamase domain-containing protein  31.68 
 
 		 288 aa  94.7  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7585  beta-lactamase domain-containing protein  34.19 
 
 		 266 aa  92  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0408  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  35.02 
 
 		 263 aa  89.7  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0914  beta-lactamase domain protein  25.35 
 
 		 311 aa  88.6  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0640856  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2214  hypothetical protein  31.6 
 
 		 339 aa  87.8  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2866  beta-lactamase domain-containing protein  32.36 
 
 		 298 aa  87.8  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.297351 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6043  Beta-lactamase-like  28.07 
 
 		 327 aa  87.4  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73428  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1359  beta-lactamase domain-containing protein  29.18 
 
 		 329 aa  85.9  8e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1564  beta-lactamase domain protein  31.47 
 
 		 291 aa  85.9  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.074508  normal  0.0114849 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3401  beta-lactamase domain protein  31.09 
 
 		 324 aa  85.1  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.20427  normal  0.272374 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2021  beta-lactamase domain protein  31.87 
 
 		 334 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.102483  normal  0.869381 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0039  beta-lactamase-like protein  27.21 
 
 		 287 aa  83.6  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2415  beta-lactamase domain protein  31.47 
 
 		 336 aa  83.2  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3433  beta-lactamase domain protein  30.14 
 
 		 324 aa  82.8  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2177  beta-lactamase domain-containing protein  29.6 
 
 		 293 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.438356 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2455  beta-lactamase domain protein  29.6 
 
 		 293 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3006  metal-dependent hydrolase  29.37 
 
 		 312 aa  81.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1952  metallo-beta-lactamase family protein  29.3 
 
 		 315 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4919  beta-lactamase domain-containing protein  30.96 
 
 		 287 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.591885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1885  beta-lactamase domain-containing protein  28.82 
 
 		 279 aa  80.1  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4159  beta-lactamase domain-containing protein  31.53 
 
 		 303 aa  80.1  0.00000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.274128  normal  0.812615 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2909  hypothetical protein  30.57 
 
 		 332 aa  80.1  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2325  hypothetical protein  30.04 
 
 		 321 aa  79.7  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.281842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2140  beta-lactamase domain protein  31.38 
 
 		 293 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4400  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 		 287 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.179806 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2878  Beta-lactamase-like  29.65 
 
 		 327 aa  78.2  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3476  beta-lactamase-like  28.57 
 
 		 321 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.907089  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5276  beta-lactamase domain-containing protein  33.17 
 
 		 286 aa  77.8  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.872928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5335  putative metallo-beta-lactamase; putative exported protein  31.35 
 
 		 351 aa  76.6  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000323942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1993  beta-lactamase domain-containing protein  29.87 
 
 		 279 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5688  beta-lactamase-like  29.69 
 
 		 281 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6052  beta-lactamase domain-containing protein  29.69 
 
 		 281 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.825618 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3518  beta-lactamase domain-containing protein  30.4 
 
 		 335 aa  75.9  0.0000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5395  beta-lactamase domain protein  29.13 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0578  beta-lactamase domain-containing protein  28.26 
 
 		 292 aa  75.5  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.456404 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1514  beta-lactamase domain-containing protein  29.36 
 
 		 284 aa  75.5  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394622  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1961  Beta-lactamase-like  26.74 
 
 		 327 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6536  beta-lactamase domain-containing protein  29.69 
 
 		 281 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123702  normal  0.116325 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2983  beta-lactamase domain-containing protein  30.12 
 
 		 304 aa  74.3  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.518136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0705  beta-lactamase domain-containing protein  31.28 
 
 		 329 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0290  beta-lactamase domain-containing protein  26.63 
 
 		 285 aa  72  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1412  beta-lactamase domain protein  28.87 
 
 		 278 aa  72.4  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.270255  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2454  Beta-lactamase-like  29.12 
 
 		 319 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2486  twin-arginine translocation pathway signal  26.62 
 
 		 330 aa  70.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.25109 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5309  beta-lactamase domain-containing protein  31.35 
 
 		 308 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0821  beta-lactamase domain protein  27.48 
 
 		 324 aa  70.1  0.00000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1477  twin-arginine translocation pathway signal  27.02 
 
 		 322 aa  69.7  0.00000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.214116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2276  twin-arginine translocation pathway signal  34.5 
 
 		 312 aa  69.7  0.00000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.759602 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1841  beta-lactamase domain protein  28.91 
 
 		 284 aa  69.3  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.933589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1473  beta-lactamase-like  26.86 
 
 		 287 aa  69.3  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00744617  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0855  beta-lactamase domain protein  27.75 
 
 		 324 aa  69.3  0.00000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4928  beta-lactamase-like protein  30.95 
 
 		 308 aa  69.3  0.00000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5016  beta-lactamase domain-containing protein  30.95 
 
 		 308 aa  69.3  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.348107  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2354  beta-lactamase domain-containing protein  28.09 
 
 		 306 aa  68.6  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186414 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1275  beta-lactamase domain protein  25.62 
 
 		 279 aa  68.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.288656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2192  beta-lactamase domain-containing protein  30.37 
 
 		 290 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.119061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3002  beta-lactamase domain protein  26.07 
 
 		 280 aa  68.2  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.694333  normal  0.605909 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0664  metal dependent hydrolase  28.7 
 
 		 238 aa  68.2  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4469  hypothetical protein  26.38 
 
 		 332 aa  67.8  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.871695 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3729  beta-lactamase domain-containing protein  29.52 
 
 		 314 aa  67.4  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2976  twin-arginine translocation pathway signal  27.56 
 
 		 329 aa  66.2  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.340706 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4163  beta-lactamase domain protein  28.01 
 
 		 316 aa  66.2  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5828  beta-lactamase domain-containing protein  32.74 
 
 		 329 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.593332  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1682  beta-lactamase domain protein  27.56 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.779181  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3375  beta-lactamase domain protein  25.66 
 
 		 327 aa  65.1  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2825  beta-lactamase-like  28.51 
 
 		 329 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3682  beta-lactamase domain protein  22.32 
 
 		 255 aa  65.9  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5891  beta-lactamase domain-containing protein  30.04 
 
 		 301 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213957  normal  0.126369 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2842  Beta-lactamase-like  27.9 
 
 		 311 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.577034 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1716  beta-lactamase domain-containing protein  27.73 
 
 		 327 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5230  beta-lactamase domain-containing protein  29.65 
 
 		 333 aa  65.1  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419907  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>