More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0208 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0208  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 301 aa  602  1.0000000000000001e-171  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4403  LysR substrate-binding protein  47.19 
 
 		 303 aa  283  3.0000000000000004e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.900242  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2822  transcriptional regulator, LysR family  44.33 
 
 		 310 aa  222  6e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.438739  normal  0.714096 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6522  transcriptional regulator, LysR family  45.12 
 
 		 300 aa  213  2.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5125  LysR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 296 aa  206  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932924  normal  0.723753 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1897  transcriptional regulator, LysR family  40 
 
 		 299 aa  201  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0474391 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1104  transcriptional regulator, LysR family  38.8 
 
 		 298 aa  195  8.000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2225  transcriptional regulator, LysR family  37.5 
 
 		 302 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00118451  normal  0.339624 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0569  transcriptional regulator, LysR family  35.97 
 
 		 324 aa  145  9e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0656  transcriptional regulator, MarR family  35.69 
 
 		 312 aa  144  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1988  transcriptional regulator, LysR family  33.45 
 
 		 301 aa  132  6.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.994481 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5881  transcriptional regulator, LysR family  35.55 
 
 		 304 aa  132  6.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2446  transcriptional regulator, LysR family  34.23 
 
 		 308 aa  129  7.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.415246  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0540  transcriptional regulator, LysR family  32.57 
 
 		 291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15621  normal  0.23196 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0267  LysR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.334674  normal  0.614052 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3940  transcriptional regulator, LysR family  35.34 
 
 		 310 aa  127  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0176714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4433  transcriptional regulator, LysR family  33.56 
 
 		 316 aa  126  6e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0029  LysR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 305 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2098  LysR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 312 aa  124  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0305237  normal  0.157419 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17270  transcriptional regulator  33.77 
 
 		 327 aa  124  2e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00802596  hitchhiker  0.00407131 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  30.72 
 
 		 301 aa  124  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6150  LysR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 295 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0301422 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1422  LysR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 308 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00195938  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0815  LysR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 288 aa  119  6e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3118  transcriptional regulator, LysR family  32.79 
 
 		 309 aa  119  7.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.181053  normal  0.0120636 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2254  LysR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 314 aa  119  9e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0582  transcriptional regulator, LysR family  30.82 
 
 		 312 aa  119  9e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0595  transcriptional regulator, LysR family  31.23 
 
 		 315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.553167 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6024  transcriptional regulator, LysR family  34.88 
 
 		 298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3856  transcriptional regulator, LysR family  34.63 
 
 		 313 aa  117  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00162069  normal  0.0542249 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  29 
 
 		 302 aa  117  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2031  transcriptional regulator, LysR family  30.74 
 
 		 333 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205829  hitchhiker  0.00632018 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19590  transcriptional regulator  30.26 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.221792  normal  0.0758544 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2648  transcriptional regulator, LysR family  35.21 
 
 		 306 aa  113  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4424  LysR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 292 aa  113  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1796  transcriptional regulator, LysR family  35.04 
 
 		 308 aa  112  8.000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000282354  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02220  transcriptional regulator  32.39 
 
 		 304 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5689  transcriptional regulator, LysR family  31.33 
 
 		 314 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.363546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2386  transcriptional regulator, LysR family  34.74 
 
 		 309 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00159604  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1740  LysR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 301 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0545937  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1345  transcriptional regulator, LysR family  27.76 
 
 		 300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0839604  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5552  putative transcriptional regulator protein, LysR family  32.48 
 
 		 303 aa  109  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.409042 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2134  transcriptional regulator, LysR family  32.99 
 
 		 287 aa  110  4.0000000000000004e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.272007  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2097  LysR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 306 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.732708  normal  0.0491263 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1625  transcriptional regulator, LysR family  27.68 
 
 		 298 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0655  transcriptional regulator, LysR family  29.05 
 
 		 311 aa  108  8.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2782  transcriptional regulator, LysR family  34.54 
 
 		 294 aa  108  9.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2545  transcriptional regulator, LysR family  28.33 
 
 		 309 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57327  normal  0.794961 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3713  LysR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 334 aa  108  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0563526  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2872  transcriptional regulator, LysR family  28.52 
 
 		 302 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6871  LysR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 283 aa  106  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0914  transcriptional regulator, LysR family  30.41 
 
 		 301 aa  105  7e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6763  transcriptional regulator, LysR family  29.04 
 
 		 303 aa  105  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1507  transcriptional regulator, LysR family  31.91 
 
 		 288 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.74974  normal  0.352143 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2567  LysR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 338 aa  105  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259086  normal  0.599662 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1012  LysR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 305 aa  105  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0144903  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1621  transcriptional regulator, MarR family  31.8 
 
 		 327 aa  104  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00140821  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6247  transcriptional regulator, LysR family  31.9 
 
 		 328 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.967227  normal  0.0964504 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6287  transcriptional regulator, LysR family  32.53 
 
 		 304 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180689  normal  0.0617503 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36460  transcriptional regulator  34.52 
 
 		 304 aa  104  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.776376  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3489  LysR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 323 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.256692  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1027  transcriptional regulator, LysR family  30.16 
 
 		 305 aa  104  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3552  LysR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 323 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.191532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3502  LysR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 323 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0505657  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3999  transcriptional regulator, LysR family  31.27 
 
 		 311 aa  102  7e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2187  LysR substrate-binding protein  33.71 
 
 		 309 aa  101  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0303  LysR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 307 aa  101  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34330  transcriptional regulator  31.63 
 
 		 308 aa  101  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4400  transcriptional regulator, LysR family  33.11 
 
 		 301 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103907  hitchhiker  0.00279425 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4076  transcriptional regulator, LysR family  31.15 
 
 		 331 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4632  transcriptional regulator, LysR family  32.39 
 
 		 295 aa  100  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1321  transcriptional regulator, LysR family  32.06 
 
 		 308 aa  100  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.105252  normal  0.107974 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3338  transcriptional regulator, LysR family  29.29 
 
 		 312 aa  100  4e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4100  transcriptional regulator, LysR family  30.99 
 
 		 319 aa  99.8  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal  0.0246683 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0807  transcriptional regulator, LysR family  29.47 
 
 		 304 aa  99.8  5e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3720  LysR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 305 aa  99.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.101076  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4648  LysR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 305 aa  99.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3036  transcriptional regulator, LysR family  24.83 
 
 		 288 aa  99.4  6e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000194633  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3806  LysR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 307 aa  99.4  7e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.335856 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1930  LysR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 306 aa  99  8e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0563526  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2582  LysR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 313 aa  98.6  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2292  transcriptional regulator, LysR family  30.37 
 
 		 315 aa  99  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.863525  normal  0.0374167 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2469  LysR family transcriptional regulator  22.42 
 
 		 300 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.36421  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2018  LysR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 304 aa  97.8  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0853412  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5656  LysR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 305 aa  97.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.601684 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03200  transcriptional regulator  28.52 
 
 		 300 aa  96.7  4e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3886  LysR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 311 aa  96.7  5e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3675  transcriptional regulator, LysR family  29.76 
 
 		 303 aa  96.3  6e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2396  transcriptional regulator, LysR family  23.13 
 
 		 300 aa  95.5  8e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2340  transcriptional regulator, LysR family  27.27 
 
 		 302 aa  95.5  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421742  normal  0.887111 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2231  LysR family transcriptional regulator  22.42 
 
 		 300 aa  94.4  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000245311  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22480  transcriptional regulator  29.53 
 
 		 308 aa  94.4  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.542371 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2421  LysR substrate-binding  22.82 
 
 		 300 aa  94.7  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0033  LysR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 302 aa  94.7  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000417374  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2159  LysR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 303 aa  94.7  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4552  LysR family transcriptional regulator  26 
 
 		 307 aa  93.6  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3155  transcriptional regulator, LysR family  24.5 
 
 		 292 aa  94  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.921002  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7868  transcriptional regulator, LysR family  30.89 
 
 		 296 aa  93.6  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.365024 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2271  LysR family transcriptional regulator  22.06 
 
 		 300 aa  93.6  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.865675  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2439  LysR family transcriptional regulator  22.06 
 
 		 300 aa  93.6  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.763594  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>