97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1667 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_1667  deoxyribonuclease  100 
 
 
79 aa  149  1e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0453  deoxyribonuclease  79.75 
 
 
79 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1613  deoxyribonuclease  85 
 
 
79 aa  103  7e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1821  deoxyribonuclease  84.48 
 
 
80 aa  98.2  3e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1239  deoxyribonuclease  56.9 
 
 
122 aa  73.9  0.0000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.331462  hitchhiker  0.00677702 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1028  hypothetical protein  50 
 
 
68 aa  62  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1026  hypothetical protein  51.72 
 
 
68 aa  60.8  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1027  hypothetical protein  50 
 
 
68 aa  60.8  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0581  deoxyribonuclease  44.62 
 
 
74 aa  59.3  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0144298  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3306  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  61.02 
 
 
137 aa  59.3  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1025  hypothetical protein  44.26 
 
 
68 aa  59.3  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1792  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  48.21 
 
 
256 aa  57.4  0.00000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3305  RNA methyltransferase, TrmA family  49.09 
 
 
460 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2335  translation initiation factor IF-2 subunit beta  47.17 
 
 
203 aa  55.8  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.153667  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0165  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  58.33 
 
 
261 aa  55.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2908  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  42.25 
 
 
132 aa  55.5  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1431  deoxyribonuclease  45.9 
 
 
74 aa  55.1  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3210  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  47.46 
 
 
136 aa  55.1  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.217613  normal  0.112347 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1298  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  44.12 
 
 
133 aa  54.7  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0604  hypothetical protein  40 
 
 
67 aa  54.7  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0082041  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1445  RNA-binding protein  44.83 
 
 
63 aa  54.3  0.0000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0304  hypothetical protein  42.19 
 
 
68 aa  53.9  0.0000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0702  tRNA methyltransferase, TrmA family  44.64 
 
 
453 aa  53.5  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.307327  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0535  RNA methyltransferase  51.85 
 
 
465 aa  52.4  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0963  RNA methyltransferase, TrmA family  46.43 
 
 
457 aa  52.8  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.128465  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0552  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  41.43 
 
 
138 aa  51.6  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0697553  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3102  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  46.97 
 
 
144 aa  52  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2770  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  44.07 
 
 
154 aa  51.6  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.776355  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1019  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  50 
 
 
262 aa  50.8  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.35921 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0835  deoxyribonuclease  44.64 
 
 
67 aa  50.1  0.000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00148307  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0872  deoxyribonuclease  42.86 
 
 
69 aa  49.7  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.375829  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1601  deoxyribonuclease  42.86 
 
 
69 aa  49.7  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.919266  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4614  cyclic nucleotide-binding protein  50.85 
 
 
134 aa  49.7  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1075  deoxyribonuclease  42.86 
 
 
69 aa  49.7  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0467  RNA methyltransferase, TrmA family  37.29 
 
 
454 aa  48.9  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2261  RNA methyltransferase  46.3 
 
 
457 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000592232  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0690  RNA methyltransferase, TrmA family  40.68 
 
 
449 aa  48.5  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1354  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  34.55 
 
 
456 aa  47.8  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.452487  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1143  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  36.21 
 
 
255 aa  48.1  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0483  translation initiation factor IF-2 subunit beta  36.54 
 
 
204 aa  47.8  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.677558  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0850  RNA methyltransferase, TrmA family  37.68 
 
 
407 aa  47.4  0.00006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2868  RNA methyltransferase, TrmA family  41.51 
 
 
460 aa  46.6  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00253017  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0633  RNA methyltransferase  37.5 
 
 
451 aa  46.6  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.449857  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0703  RNA methyltransferase, TrmA family  42.11 
 
 
448 aa  46.6  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3634  23S rRNA methyltransferase/RumA  48.15 
 
 
460 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.226718 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1438  RNA methyltransferase  37.93 
 
 
459 aa  47  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2249  RNA methyltransferase, TrmA family  35 
 
 
458 aa  46.2  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.79134  hitchhiker  0.00749966 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1324  Translation initiation factor IF2/IF5  38.6 
 
 
203 aa  46.6  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.337196  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1751  RNA methyltransferase  38.6 
 
 
453 aa  46.6  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216476  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1299  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  44.44 
 
 
155 aa  46.2  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0779  translation initiation factor IF-2 subunit beta  42.11 
 
 
204 aa  46.2  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.157582  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4083  RNA methyltransferase, TrmA family  38.18 
 
 
461 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4122  RNA methyltransferase, TrmA family  38.18 
 
 
461 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.840048 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3654  TrmA family RNA methyltransferase  43.4 
 
 
455 aa  45.4  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.412422  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1577  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  38.6 
 
 
464 aa  45.1  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0180  translation initiation factor IF-2 subunit beta  31.58 
 
 
208 aa  45.4  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2048  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  48.89 
 
 
273 aa  44.7  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.875415  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1295  RNA methyltransferase, TrmA family  40.82 
 
 
436 aa  44.7  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4802  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  38.18 
 
 
485 aa  44.7  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.810738  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0080  translation initiation factor IF-2 subunit beta  41.3 
 
 
203 aa  45.1  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0971382 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3644  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  43.48 
 
 
138 aa  44.7  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1249  translation initiation factor IF-2 subunit beta  40.38 
 
 
204 aa  43.9  0.0007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00922141  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1372  translation initiation factor IF-2 subunit beta  35.09 
 
 
202 aa  43.5  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2557  RNA methyltransferase, TrmA family  38.6 
 
 
466 aa  43.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1117  translation initiation factor aIF-2, beta subunit  37.5 
 
 
205 aa  43.1  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000692895  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1493  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  35.71 
 
 
450 aa  43.5  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00115343  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2170  translation initiation factor IF-2 subunit beta  33.93 
 
 
205 aa  43.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2830  Translation initiation factor IF2/IF5  39.29 
 
 
203 aa  42.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0241  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  41.18 
 
 
455 aa  42.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.468571  normal  0.547918 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0818  translation initiation factor IF-2 subunit beta  38.6 
 
 
203 aa  42.4  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.487297 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2536  ribonuclease  40.91 
 
 
559 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0391  RNA methyltransferase, TrmA family  41.07 
 
 
457 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0311  RNA methyltransferase  31.03 
 
 
458 aa  42.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1089  deoxyribonuclease  52.63 
 
 
69 aa  41.6  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1390  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  41.38 
 
 
171 aa  42  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1423  translation initiation factor IF-2 subunit beta  34.55 
 
 
202 aa  42  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0289  RNA methyltransferase  39.44 
 
 
488 aa  41.6  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.198099  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1674  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  33.33 
 
 
458 aa  41.2  0.004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0556  ribonuclease G  45.16 
 
 
562 aa  41.6  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03000  RNA methyltransferase, TrmA family  37.04 
 
 
453 aa  41.2  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0782  RNA methyltransferase, TrmA family  44.23 
 
 
456 aa  41.2  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.14607  normal  0.115427 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0985  Translation initiation factor IF2/IF5  36.84 
 
 
203 aa  41.2  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.849775  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1585  RNA methyltransferase  35.59 
 
 
471 aa  41.2  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.953972  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0333  RNA methyltransferase  31.03 
 
 
458 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0381  RNA methyltransferase, TrmA family  31.03 
 
 
454 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.432112  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0318  RNA methyltransferase  31.03 
 
 
458 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.875741  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0365  RNA methyltransferase, TrmA family  31.03 
 
 
458 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0305  RNA methyltransferase  31.03 
 
 
458 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0517475  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0301  RNA methyltransferase  31.03 
 
 
458 aa  40.8  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0363  RNA methyltransferase  31.03 
 
 
460 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4938  RNA methyltransferase, TrmA family  31.03 
 
 
454 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0464028  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0313  RNA methyltransferase  31.03 
 
 
458 aa  40.8  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0407  RNA methyltransferase, TrmA family  31.03 
 
 
458 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1197  RNA methyltransferase  40.35 
 
 
454 aa  40.8  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000142692  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1095  RNA methyltransferase  34 
 
 
465 aa  40  0.01  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.31205 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2828  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase  45.61 
 
 
440 aa  40  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2450  RNA methyltransferase, TrmA family  45.61 
 
 
440 aa  40  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.211683  normal  0.124468 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>