61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0483 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0483  translation initiation factor IF-2 subunit beta  100 
 
 		 204 aa  417  1e-116  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.677558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0080  translation initiation factor IF-2 subunit beta  69.46 
 
 		 203 aa  314  5e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0971382 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2170  translation initiation factor IF-2 subunit beta  68.78 
 
 		 205 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2335  translation initiation factor IF-2 subunit beta  63.37 
 
 		 203 aa  286  2e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.153667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1249  translation initiation factor IF-2 subunit beta  61.39 
 
 		 204 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00922141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1372  translation initiation factor IF-2 subunit beta  53.03 
 
 		 202 aa  230  1e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1423  translation initiation factor IF-2 subunit beta  49 
 
 		 202 aa  224  6e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0180  translation initiation factor IF-2 subunit beta  49.01 
 
 		 208 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2830  Translation initiation factor IF2/IF5  42.64 
 
 		 203 aa  171  7.999999999999999e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0985  Translation initiation factor IF2/IF5  40.61 
 
 		 203 aa  167  8e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.849775  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1324  Translation initiation factor IF2/IF5  38.61 
 
 		 203 aa  160  1e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.337196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1117  translation initiation factor aIF-2, beta subunit  44.39 
 
 		 205 aa  158  5e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000692895  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0818  translation initiation factor IF-2 subunit beta  38.19 
 
 		 203 aa  158  7e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.487297 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0779  translation initiation factor IF-2 subunit beta  36.45 
 
 		 204 aa  148  7e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.157582  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1308  translation initiation factor IF-2 subunit beta  44.62 
 
 		 138 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1501  translation initiation factor IF-2 subunit beta  45.38 
 
 		 139 aa  132  3e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.134545  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1376  translation initiation factor IF-2 subunit beta  44.62 
 
 		 138 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1300  translation initiation factor IF-2 subunit beta  43.85 
 
 		 138 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.756042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0656  translation initiation factor IF-2 subunit beta  43.85 
 
 		 138 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.432331  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0820  translation initiation factor IF-2 subunit beta  42.62 
 
 		 129 aa  108  4.0000000000000004e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1412  translation initiation factor IF2/IF5  33.33 
 
 		 140 aa  95.9  4e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0380  translation initiation factor IF5  32.33 
 
 		 141 aa  93.6  2e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00129968  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2410  Translation initiation factor IF2/IF5  38.58 
 
 		 129 aa  93.6  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.262641 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0658  translation initiation factor IF-2 subunit beta  35.11 
 
 		 140 aa  92.4  4e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000021043  hitchhiker  0.00876921 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02992  translational initiation factor 2 beta (AFU_orthologue; AFUA_3G08600)  32.85 
 
 		 304 aa  90.1  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00740  translation initiation factor, putative  31.62 
 
 		 314 aa  87.4  1e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.15304  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81624  eIF2  33.57 
 
 		 271 aa  87.4  1e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.571106 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_88846  predicted protein  33.09 
 
 		 213 aa  84  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0540099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0582  translation initiation factor IF-2 subunit beta  31.82 
 
 		 136 aa  82.8  0.000000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00328068  hitchhiker  0.00124905 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0835  translation initiation factor IF-2 subunit beta  31.34 
 
 		 134 aa  80.1  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0190  Translation initiation factor IF2/IF5  33.59 
 
 		 139 aa  79.7  0.00000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1439  translation initiation factor IF-2 subunit beta  29.85 
 
 		 134 aa  78.2  0.00000000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.121861  decreased coverage  0.00662959 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0459  translation initiation factor IF-2 subunit beta  29.85 
 
 		 134 aa  77.4  0.0000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0538  translation initiation factor IF-2 subunit beta  28.36 
 
 		 134 aa  75.9  0.0000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00412353 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_27282  predicted protein  34.55 
 
 		 171 aa  75.1  0.0000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72556  predicted protein  27.73 
 
 		 401 aa  58.2  0.00000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06067  eukaryotic translation initiation factor 5, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08990)  26.27 
 
 		 423 aa  57.4  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1239  deoxyribonuclease  43.64 
 
 		 122 aa  57.4  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.331462  hitchhiker  0.00677702 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02150  translation initiation factor, putative  25.83 
 
 		 402 aa  57.4  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.827258  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_46171  predicted protein  27.5 
 
 		 436 aa  53.5  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.516415  normal  0.0761252 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0453  deoxyribonuclease  36.92 
 
 		 79 aa  53.1  0.000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47039  predicted protein  25.23 
 
 		 413 aa  52.8  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.915264  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1028  hypothetical protein  40 
 
 		 68 aa  50.8  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1821  deoxyribonuclease  45.83 
 
 		 80 aa  50.4  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1025  hypothetical protein  34.85 
 
 		 68 aa  50.1  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1027  hypothetical protein  34.85 
 
 		 68 aa  50.1  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1026  hypothetical protein  34.85 
 
 		 68 aa  49.7  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1613  deoxyribonuclease  34 
 
 		 79 aa  48.1  0.00009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1667  deoxyribonuclease  36.54 
 
 		 79 aa  47.8  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0872  deoxyribonuclease  31.34 
 
 		 69 aa  45.8  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.375829  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1075  deoxyribonuclease  31.34 
 
 		 69 aa  45.8  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1601  deoxyribonuclease  31.34 
 
 		 69 aa  45.8  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.919266  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0304  hypothetical protein  29.31 
 
 		 68 aa  43.1  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3102  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  26.67 
 
 		 144 aa  43.5  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1354  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  31.48 
 
 		 456 aa  43.5  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.452487  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0835  deoxyribonuclease  27.87 
 
 		 67 aa  42.7  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00148307  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3210  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  29.55 
 
 		 136 aa  43.1  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.217613  normal  0.112347 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0604  hypothetical protein  29.09 
 
 		 67 aa  42.7  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0082041  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0391  RNA methyltransferase, TrmA family  34.69 
 
 		 457 aa  42.4  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1445  RNA-binding protein  29.09 
 
 		 63 aa  42  0.007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4614  cyclic nucleotide-binding protein  32.14 
 
 		 134 aa  41.6  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>