39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_88846 on replicon NC_009366
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009366  OSTLU_88846  predicted protein  100 
 
 
213 aa  442  1e-123  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0540099  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00740  translation initiation factor, putative  49.15 
 
 
314 aa  174  8e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.15304  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_27282  predicted protein  49.03 
 
 
171 aa  169  3e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81624  eIF2  47.93 
 
 
271 aa  169  4e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.571106 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02992  translational initiation factor 2 beta (AFU_orthologue; AFUA_3G08600)  45.56 
 
 
304 aa  152  4e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0080  translation initiation factor IF-2 subunit beta  37.5 
 
 
203 aa  92.8  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0971382 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1117  translation initiation factor aIF-2, beta subunit  38.51 
 
 
205 aa  92  5e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000692895  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2335  translation initiation factor IF-2 subunit beta  41.12 
 
 
203 aa  90.1  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.153667  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1423  translation initiation factor IF-2 subunit beta  34.38 
 
 
202 aa  87  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1372  translation initiation factor IF-2 subunit beta  34.78 
 
 
202 aa  87  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0180  translation initiation factor IF-2 subunit beta  39.13 
 
 
208 aa  85.9  4e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0483  translation initiation factor IF-2 subunit beta  33.09 
 
 
204 aa  84  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.677558  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1249  translation initiation factor IF-2 subunit beta  33.09 
 
 
204 aa  83.6  0.000000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00922141  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2170  translation initiation factor IF-2 subunit beta  39.39 
 
 
205 aa  77.4  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0190  Translation initiation factor IF2/IF5  33.57 
 
 
139 aa  75.1  0.0000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2830  Translation initiation factor IF2/IF5  36.36 
 
 
203 aa  74.3  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0820  translation initiation factor IF-2 subunit beta  34.11 
 
 
129 aa  73.6  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1376  translation initiation factor IF-2 subunit beta  30.28 
 
 
138 aa  73.9  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0656  translation initiation factor IF-2 subunit beta  30.28 
 
 
138 aa  73.2  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.432331  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1300  translation initiation factor IF-2 subunit beta  30.28 
 
 
138 aa  73.2  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.756042  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2410  Translation initiation factor IF2/IF5  35.2 
 
 
129 aa  72  0.000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.262641 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1501  translation initiation factor IF-2 subunit beta  29.08 
 
 
139 aa  71.6  0.000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.134545  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1308  translation initiation factor IF-2 subunit beta  31.68 
 
 
138 aa  70.9  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0658  translation initiation factor IF-2 subunit beta  29.37 
 
 
140 aa  70.9  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000021043  hitchhiker  0.00876921 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1324  Translation initiation factor IF2/IF5  32.12 
 
 
203 aa  70.1  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.337196  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0779  translation initiation factor IF-2 subunit beta  32.12 
 
 
204 aa  69.3  0.00000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.157582  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0985  Translation initiation factor IF2/IF5  32.52 
 
 
203 aa  68.2  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.849775  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0582  translation initiation factor IF-2 subunit beta  30.5 
 
 
136 aa  65.1  0.0000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00328068  hitchhiker  0.00124905 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0538  translation initiation factor IF-2 subunit beta  30.28 
 
 
134 aa  65.1  0.0000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00412353 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1439  translation initiation factor IF-2 subunit beta  28.87 
 
 
134 aa  62.8  0.000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.121861  decreased coverage  0.00662959 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0818  translation initiation factor IF-2 subunit beta  33.09 
 
 
203 aa  63.2  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.487297 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0459  translation initiation factor IF-2 subunit beta  31.54 
 
 
134 aa  62.4  0.000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1412  translation initiation factor IF2/IF5  33.33 
 
 
140 aa  60.8  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0835  translation initiation factor IF-2 subunit beta  30 
 
 
134 aa  58.9  0.00000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0380  translation initiation factor IF5  26.47 
 
 
141 aa  55.1  0.0000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00129968  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72556  predicted protein  28.72 
 
 
401 aa  51.6  0.000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06067  eukaryotic translation initiation factor 5, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08990)  27.45 
 
 
423 aa  49.7  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47039  predicted protein  26.26 
 
 
413 aa  46.6  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.915264  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02150  translation initiation factor, putative  26 
 
 
402 aa  46.6  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.827258  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>