73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1372 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1372  translation initiation factor IF-2 subunit beta  100 
 
 		 202 aa  414  9.999999999999999e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1423  translation initiation factor IF-2 subunit beta  73.27 
 
 		 202 aa  327  7e-89  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0180  translation initiation factor IF-2 subunit beta  69.5 
 
 		 208 aa  292  2e-78  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0483  translation initiation factor IF-2 subunit beta  53.03 
 
 		 204 aa  230  1e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.677558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1249  translation initiation factor IF-2 subunit beta  53.27 
 
 		 204 aa  226  2e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00922141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0080  translation initiation factor IF-2 subunit beta  52.02 
 
 		 203 aa  223  1e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0971382 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2335  translation initiation factor IF-2 subunit beta  51.52 
 
 		 203 aa  218  6e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.153667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2170  translation initiation factor IF-2 subunit beta  51 
 
 		 205 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2830  Translation initiation factor IF2/IF5  50.25 
 
 		 203 aa  202  2e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0985  Translation initiation factor IF2/IF5  48.24 
 
 		 203 aa  200  9.999999999999999e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.849775  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0818  translation initiation factor IF-2 subunit beta  48 
 
 		 203 aa  194  7e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.487297 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1324  Translation initiation factor IF2/IF5  46 
 
 		 203 aa  175  3e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.337196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1117  translation initiation factor aIF-2, beta subunit  47.98 
 
 		 205 aa  172  2.9999999999999996e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000692895  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0779  translation initiation factor IF-2 subunit beta  42.79 
 
 		 204 aa  169  2e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.157582  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0656  translation initiation factor IF-2 subunit beta  48.48 
 
 		 138 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.432331  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1300  translation initiation factor IF-2 subunit beta  48.48 
 
 		 138 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.756042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1308  translation initiation factor IF-2 subunit beta  46.21 
 
 		 138 aa  144  8.000000000000001e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1376  translation initiation factor IF-2 subunit beta  48.48 
 
 		 138 aa  144  9e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1501  translation initiation factor IF-2 subunit beta  44.7 
 
 		 139 aa  141  8e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.134545  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0820  translation initiation factor IF-2 subunit beta  44.72 
 
 		 129 aa  116  1.9999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1412  translation initiation factor IF2/IF5  37.5 
 
 		 140 aa  101  7e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0380  translation initiation factor IF5  36.09 
 
 		 141 aa  100  1e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00129968  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2410  Translation initiation factor IF2/IF5  42.52 
 
 		 129 aa  100  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.262641 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0658  translation initiation factor IF-2 subunit beta  36.64 
 
 		 140 aa  93.2  2e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000021043  hitchhiker  0.00876921 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00740  translation initiation factor, putative  37.96 
 
 		 314 aa  93.2  3e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.15304  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02992  translational initiation factor 2 beta (AFU_orthologue; AFUA_3G08600)  39.64 
 
 		 304 aa  89  5e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81624  eIF2  35.86 
 
 		 271 aa  88.2  7e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.571106 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_88846  predicted protein  34.78 
 
 		 213 aa  86.3  3e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0540099  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0190  Translation initiation factor IF2/IF5  34.09 
 
 		 139 aa  83.2  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_27282  predicted protein  35.25 
 
 		 171 aa  82.8  0.000000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0582  translation initiation factor IF-2 subunit beta  36.92 
 
 		 136 aa  80.9  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00328068  hitchhiker  0.00124905 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0835  translation initiation factor IF-2 subunit beta  32.82 
 
 		 134 aa  77.4  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0538  translation initiation factor IF-2 subunit beta  33.59 
 
 		 134 aa  77.4  0.0000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00412353 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0459  translation initiation factor IF-2 subunit beta  34.35 
 
 		 134 aa  77.8  0.0000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1439  translation initiation factor IF-2 subunit beta  32.82 
 
 		 134 aa  75.1  0.0000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.121861  decreased coverage  0.00662959 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06067  eukaryotic translation initiation factor 5, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08990)  27.93 
 
 		 423 aa  63.2  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02150  translation initiation factor, putative  26.77 
 
 		 402 aa  62.4  0.000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.827258  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1601  deoxyribonuclease  49.12 
 
 		 69 aa  61.2  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.919266  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1075  deoxyribonuclease  49.12 
 
 		 69 aa  61.2  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0872  deoxyribonuclease  49.12 
 
 		 69 aa  61.2  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.375829  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72556  predicted protein  29.31 
 
 		 401 aa  59.7  0.00000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1019  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  43.86 
 
 		 262 aa  57.4  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.35921 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47039  predicted protein  31.31 
 
 		 413 aa  56.6  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.915264  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0165  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  49.09 
 
 		 261 aa  57  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1025  hypothetical protein  46.3 
 
 		 68 aa  56.2  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2048  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  42.11 
 
 		 273 aa  54.7  0.0000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.875415  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1026  hypothetical protein  40.74 
 
 		 68 aa  53.5  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_46171  predicted protein  29.81 
 
 		 436 aa  53.9  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.516415  normal  0.0761252 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0304  hypothetical protein  43.64 
 
 		 68 aa  53.5  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0604  hypothetical protein  40.35 
 
 		 67 aa  53.5  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0082041  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1027  hypothetical protein  38.89 
 
 		 68 aa  52.8  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0835  deoxyribonuclease  38.6 
 
 		 67 aa  52.8  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00148307  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3102  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  35.21 
 
 		 144 aa  51.2  0.000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1028  hypothetical protein  40.74 
 
 		 68 aa  50.8  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1445  RNA-binding protein  36.84 
 
 		 63 aa  49.7  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1089  deoxyribonuclease  49.12 
 
 		 69 aa  47.4  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4614  cyclic nucleotide-binding protein  42.86 
 
 		 134 aa  47  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0348  RNA methyltransferase  46.3 
 
 		 455 aa  47  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.359971  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0357  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  46.3 
 
 		 455 aa  47  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0453  deoxyribonuclease  33.33 
 
 		 79 aa  46.6  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1298  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  40 
 
 		 133 aa  46.2  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1792  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  35.09 
 
 		 256 aa  46.2  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1299  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  41.07 
 
 		 155 aa  45.4  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2908  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  32.1 
 
 		 132 aa  45.4  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1613  deoxyribonuclease  38.46 
 
 		 79 aa  45.4  0.0006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3210  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  37.93 
 
 		 136 aa  45.4  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.217613  normal  0.112347 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2770  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  38.18 
 
 		 154 aa  44.7  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.776355  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1667  deoxyribonuclease  35.09 
 
 		 79 aa  43.5  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1143  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  30.12 
 
 		 255 aa  43.5  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0850  RNA methyltransferase, TrmA family  40 
 
 		 407 aa  43.9  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1431  deoxyribonuclease  29.63 
 
 		 74 aa  42.7  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1821  deoxyribonuclease  37.04 
 
 		 80 aa  42.7  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0703  RNA methyltransferase, TrmA family  46.34 
 
 		 448 aa  42.4  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>