39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0582 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0582  translation initiation factor IF-2 subunit beta  100 
 
 		 136 aa  274  3e-73  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00328068  hitchhiker  0.00124905 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1439  translation initiation factor IF-2 subunit beta  57.89 
 
 		 134 aa  161  3e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.121861  decreased coverage  0.00662959 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0835  translation initiation factor IF-2 subunit beta  58.65 
 
 		 134 aa  159  1e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0459  translation initiation factor IF-2 subunit beta  57.25 
 
 		 134 aa  158  3e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0538  translation initiation factor IF-2 subunit beta  55.73 
 
 		 134 aa  155  2e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00412353 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0380  translation initiation factor IF5  40.91 
 
 		 141 aa  103  7e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00129968  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0190  Translation initiation factor IF2/IF5  37.04 
 
 		 139 aa  101  3e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1308  translation initiation factor IF-2 subunit beta  39.85 
 
 		 138 aa  96.7  9e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1249  translation initiation factor IF-2 subunit beta  37.12 
 
 		 204 aa  96.7  9e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00922141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0658  translation initiation factor IF-2 subunit beta  36.36 
 
 		 140 aa  94.7  4e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000021043  hitchhiker  0.00876921 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1117  translation initiation factor aIF-2, beta subunit  37.98 
 
 		 205 aa  92.8  2e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000692895  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1376  translation initiation factor IF-2 subunit beta  39.53 
 
 		 138 aa  92.4  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0656  translation initiation factor IF-2 subunit beta  39.53 
 
 		 138 aa  90.5  8e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.432331  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1300  translation initiation factor IF-2 subunit beta  39.53 
 
 		 138 aa  90.5  8e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.756042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0080  translation initiation factor IF-2 subunit beta  39.1 
 
 		 203 aa  89.4  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0971382 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00740  translation initiation factor, putative  36.3 
 
 		 314 aa  86.3  1e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.15304  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0180  translation initiation factor IF-2 subunit beta  34.88 
 
 		 208 aa  83.2  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1423  translation initiation factor IF-2 subunit beta  36.64 
 
 		 202 aa  82.8  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2335  translation initiation factor IF-2 subunit beta  37.59 
 
 		 203 aa  82.8  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.153667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0483  translation initiation factor IF-2 subunit beta  31.82 
 
 		 204 aa  82.8  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.677558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1372  translation initiation factor IF-2 subunit beta  36.92 
 
 		 202 aa  80.9  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1501  translation initiation factor IF-2 subunit beta  34.11 
 
 		 139 aa  80.5  0.000000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.134545  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81624  eIF2  32.35 
 
 		 271 aa  80.5  0.000000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.571106 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2170  translation initiation factor IF-2 subunit beta  32.35 
 
 		 205 aa  79.3  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1412  translation initiation factor IF2/IF5  36.11 
 
 		 140 aa  79.3  0.00000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02992  translational initiation factor 2 beta (AFU_orthologue; AFUA_3G08600)  36.36 
 
 		 304 aa  79  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0779  translation initiation factor IF-2 subunit beta  33.09 
 
 		 204 aa  75.9  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.157582  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0820  translation initiation factor IF-2 subunit beta  33.33 
 
 		 129 aa  74.3  0.0000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_27282  predicted protein  31.34 
 
 		 171 aa  73.9  0.0000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2830  Translation initiation factor IF2/IF5  36.15 
 
 		 203 aa  71.2  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2410  Translation initiation factor IF2/IF5  33.86 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.262641 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0985  Translation initiation factor IF2/IF5  34.07 
 
 		 203 aa  70.5  0.000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.849775  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1324  Translation initiation factor IF2/IF5  30.88 
 
 		 203 aa  68.2  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.337196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_88846  predicted protein  30.5 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0540099  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0818  translation initiation factor IF-2 subunit beta  31.78 
 
 		 203 aa  60.8  0.000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.487297 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02150  translation initiation factor, putative  30.77 
 
 		 402 aa  51.2  0.000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.827258  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06067  eukaryotic translation initiation factor 5, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08990)  26.55 
 
 		 423 aa  47.8  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72556  predicted protein  27.83 
 
 		 401 aa  45.8  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47039  predicted protein  29.57 
 
 		 413 aa  45.4  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.915264  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>