79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1423 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_1423  translation initiation factor IF-2 subunit beta  100 
 
 		 202 aa  412  1e-114  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1372  translation initiation factor IF-2 subunit beta  73.27 
 
 		 202 aa  327  7e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0180  translation initiation factor IF-2 subunit beta  63.37 
 
 		 208 aa  277  8e-74  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0483  translation initiation factor IF-2 subunit beta  49 
 
 		 204 aa  224  6e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.677558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1249  translation initiation factor IF-2 subunit beta  48.02 
 
 		 204 aa  220  9e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00922141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0080  translation initiation factor IF-2 subunit beta  48.5 
 
 		 203 aa  217  1e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0971382 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2335  translation initiation factor IF-2 subunit beta  47.76 
 
 		 203 aa  217  1e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.153667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2170  translation initiation factor IF-2 subunit beta  50.75 
 
 		 205 aa  207  6e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0985  Translation initiation factor IF2/IF5  49.25 
 
 		 203 aa  207  1e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.849775  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2830  Translation initiation factor IF2/IF5  50.25 
 
 		 203 aa  206  3e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0818  translation initiation factor IF-2 subunit beta  44 
 
 		 203 aa  192  2e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.487297 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1324  Translation initiation factor IF2/IF5  45.23 
 
 		 203 aa  178  5.999999999999999e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.337196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0779  translation initiation factor IF-2 subunit beta  43.28 
 
 		 204 aa  169  4e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.157582  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1117  translation initiation factor aIF-2, beta subunit  44.72 
 
 		 205 aa  169  4e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000692895  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0656  translation initiation factor IF-2 subunit beta  48.85 
 
 		 138 aa  141  7e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.432331  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1300  translation initiation factor IF-2 subunit beta  48.85 
 
 		 138 aa  141  7e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.756042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1376  translation initiation factor IF-2 subunit beta  48.09 
 
 		 138 aa  138  7e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1501  translation initiation factor IF-2 subunit beta  45.8 
 
 		 139 aa  137  1e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.134545  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1308  translation initiation factor IF-2 subunit beta  45.8 
 
 		 138 aa  136  2e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0820  translation initiation factor IF-2 subunit beta  47.15 
 
 		 129 aa  125  4.0000000000000003e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1412  translation initiation factor IF2/IF5  37.12 
 
 		 140 aa  100  1e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2410  Translation initiation factor IF2/IF5  40.94 
 
 		 129 aa  100  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.262641 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0380  translation initiation factor IF5  34.59 
 
 		 141 aa  93.6  2e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00129968  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02992  translational initiation factor 2 beta (AFU_orthologue; AFUA_3G08600)  34.13 
 
 		 304 aa  86.7  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_88846  predicted protein  34.38 
 
 		 213 aa  86.7  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0540099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81624  eIF2  34.72 
 
 		 271 aa  86.3  3e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.571106 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0658  translation initiation factor IF-2 subunit beta  32.82 
 
 		 140 aa  85.9  4e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000021043  hitchhiker  0.00876921 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00740  translation initiation factor, putative  31.69 
 
 		 314 aa  83.6  0.000000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.15304  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0582  translation initiation factor IF-2 subunit beta  36.64 
 
 		 136 aa  82.8  0.000000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00328068  hitchhiker  0.00124905 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_27282  predicted protein  33.8 
 
 		 171 aa  81.3  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0190  Translation initiation factor IF2/IF5  32.58 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0459  translation initiation factor IF-2 subunit beta  34.91 
 
 		 134 aa  75.5  0.0000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0835  translation initiation factor IF-2 subunit beta  30.08 
 
 		 134 aa  75.1  0.0000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0538  translation initiation factor IF-2 subunit beta  30.3 
 
 		 134 aa  74.7  0.000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00412353 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1439  translation initiation factor IF-2 subunit beta  28.79 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.121861  decreased coverage  0.00662959 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02150  translation initiation factor, putative  29.69 
 
 		 402 aa  71.2  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.827258  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06067  eukaryotic translation initiation factor 5, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08990)  31.2 
 
 		 423 aa  68.2  0.00000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1075  deoxyribonuclease  52.63 
 
 		 69 aa  62.8  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0872  deoxyribonuclease  52.63 
 
 		 69 aa  62.8  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.375829  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1601  deoxyribonuclease  52.63 
 
 		 69 aa  62.8  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.919266  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0835  deoxyribonuclease  49.21 
 
 		 67 aa  61.2  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00148307  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47039  predicted protein  29.75 
 
 		 413 aa  59.3  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.915264  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72556  predicted protein  26.72 
 
 		 401 aa  59.3  0.00000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1027  hypothetical protein  50 
 
 		 68 aa  57.4  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2048  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  43.86 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.875415  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1026  hypothetical protein  48.15 
 
 		 68 aa  57  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1025  hypothetical protein  46.3 
 
 		 68 aa  56.6  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0165  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  49.09 
 
 		 261 aa  55.8  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0604  hypothetical protein  45.61 
 
 		 67 aa  55.8  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0082041  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1028  hypothetical protein  47.37 
 
 		 68 aa  55.8  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_46171  predicted protein  28.93 
 
 		 436 aa  55.5  0.0000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.516415  normal  0.0761252 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1019  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  43.86 
 
 		 262 aa  54.7  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.35921 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0304  hypothetical protein  43.64 
 
 		 68 aa  53.5  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3102  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  38.03 
 
 		 144 aa  53.1  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1445  RNA-binding protein  43.86 
 
 		 63 aa  53.1  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1431  deoxyribonuclease  38.1 
 
 		 74 aa  49.3  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1298  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  30.59 
 
 		 133 aa  48.5  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0581  deoxyribonuclease  38.1 
 
 		 74 aa  48.1  0.00008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0144298  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1143  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  44.44 
 
 		 255 aa  48.1  0.00009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0703  RNA methyltransferase, TrmA family  50 
 
 		 448 aa  47.8  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0453  deoxyribonuclease  37.14 
 
 		 79 aa  47.8  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4614  cyclic nucleotide-binding protein  32.56 
 
 		 134 aa  47.4  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1089  deoxyribonuclease  45.61 
 
 		 69 aa  47.8  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3210  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  36.92 
 
 		 136 aa  46.6  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.217613  normal  0.112347 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1792  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  29.6 
 
 		 256 aa  46.2  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2908  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  38.33 
 
 		 132 aa  45.4  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2770  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  37.1 
 
 		 154 aa  45.1  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.776355  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1613  deoxyribonuclease  38.6 
 
 		 79 aa  45.1  0.0007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1821  deoxyribonuclease  40.35 
 
 		 80 aa  44.3  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1299  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  39.66 
 
 		 155 aa  43.1  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0348  RNA methyltransferase  39.29 
 
 		 455 aa  43.9  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.359971  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0357  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  39.29 
 
 		 455 aa  43.9  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3644  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  34.48 
 
 		 138 aa  43.1  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1239  deoxyribonuclease  36.54 
 
 		 122 aa  42.7  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.331462  hitchhiker  0.00677702 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1438  RNA methyltransferase  29.63 
 
 		 459 aa  42.4  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3306  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  37.93 
 
 		 137 aa  42  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1667  deoxyribonuclease  34.55 
 
 		 79 aa  42  0.007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0850  RNA methyltransferase, TrmA family  37.74 
 
 		 407 aa  41.6  0.008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0552  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  37.1 
 
 		 138 aa  41.6  0.009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0697553  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>