58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3102 on replicon NC_012028
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012028  Hlac_3102  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  100 
 
 		 144 aa  287  4e-77  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1299  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  49.35 
 
 		 155 aa  133  7.000000000000001e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4614  cyclic nucleotide-binding protein  46.04 
 
 		 134 aa  119  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0552  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  42.45 
 
 		 138 aa  108  2.0000000000000002e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0697553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2908  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  42.45 
 
 		 132 aa  108  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1298  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  43.88 
 
 		 133 aa  105  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2770  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  42.86 
 
 		 154 aa  104  3e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.776355  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3306  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  41.01 
 
 		 137 aa  101  4e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3210  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  40.88 
 
 		 136 aa  100  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.217613  normal  0.112347 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3644  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  39.26 
 
 		 138 aa  98.6  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1027  hypothetical protein  48.48 
 
 		 68 aa  65.5  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1026  hypothetical protein  50 
 
 		 68 aa  66.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1028  hypothetical protein  50.77 
 
 		 68 aa  63.9  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1025  hypothetical protein  49.25 
 
 		 68 aa  61.6  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1143  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  32.76 
 
 		 255 aa  57  0.00000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0304  hypothetical protein  44.44 
 
 		 68 aa  55.8  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1019  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  53.57 
 
 		 262 aa  56.2  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.35921 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0604  hypothetical protein  45.9 
 
 		 67 aa  55.1  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0082041  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1423  translation initiation factor IF-2 subunit beta  38.03 
 
 		 202 aa  53.1  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1445  RNA-binding protein  44.26 
 
 		 63 aa  52  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1667  deoxyribonuclease  46.97 
 
 		 79 aa  52  0.000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0835  deoxyribonuclease  48.21 
 
 		 67 aa  52  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00148307  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1372  translation initiation factor IF-2 subunit beta  35.21 
 
 		 202 aa  51.2  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0165  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  39.13 
 
 		 261 aa  51.6  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1324  Translation initiation factor IF2/IF5  38.16 
 
 		 203 aa  50.8  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.337196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0180  translation initiation factor IF-2 subunit beta  35.94 
 
 		 208 aa  50.4  0.000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0453  deoxyribonuclease  37.18 
 
 		 79 aa  48.1  0.00004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1821  deoxyribonuclease  48.28 
 
 		 80 aa  47.8  0.00005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1601  deoxyribonuclease  44.64 
 
 		 69 aa  47.4  0.00007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.919266  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1075  deoxyribonuclease  44.64 
 
 		 69 aa  47.4  0.00007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0872  deoxyribonuclease  44.64 
 
 		 69 aa  47.4  0.00007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.375829  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2048  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  40.48 
 
 		 273 aa  47.4  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.875415  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0318  RNA methyltransferase  38.98 
 
 		 458 aa  47  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.875741  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0333  RNA methyltransferase  38.98 
 
 		 458 aa  47  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4938  RNA methyltransferase, TrmA family  38.98 
 
 		 454 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0464028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0365  RNA methyltransferase, TrmA family  38.98 
 
 		 458 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0363  RNA methyltransferase  38.98 
 
 		 460 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0407  RNA methyltransferase, TrmA family  38.98 
 
 		 458 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0313  RNA methyltransferase  38.98 
 
 		 458 aa  46.6  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0818  translation initiation factor IF-2 subunit beta  33.67 
 
 		 203 aa  46.2  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.487297 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0301  RNA methyltransferase  38.98 
 
 		 458 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0305  RNA methyltransferase  38.98 
 
 		 458 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0517475  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0779  translation initiation factor IF-2 subunit beta  42.62 
 
 		 204 aa  46.6  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.157582  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0381  RNA methyltransferase, TrmA family  38.98 
 
 		 454 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.432112  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1613  deoxyribonuclease  40.68 
 
 		 79 aa  45.4  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1249  translation initiation factor IF-2 subunit beta  29.58 
 
 		 204 aa  46.2  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00922141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0311  RNA methyltransferase  37.29 
 
 		 458 aa  44.7  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2335  translation initiation factor IF-2 subunit beta  30 
 
 		 203 aa  44.3  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.153667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1239  deoxyribonuclease  35 
 
 		 122 aa  43.9  0.0007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.331462  hitchhiker  0.00677702 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0985  Translation initiation factor IF2/IF5  36.84 
 
 		 203 aa  43.9  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.849775  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2830  Translation initiation factor IF2/IF5  36.84 
 
 		 203 aa  43.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0483  translation initiation factor IF-2 subunit beta  26.67 
 
 		 204 aa  43.5  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.677558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0080  translation initiation factor IF-2 subunit beta  27.03 
 
 		 203 aa  43.5  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0971382 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1431  deoxyribonuclease  35.38 
 
 		 74 aa  42.7  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1792  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  41.07 
 
 		 256 aa  42  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0581  deoxyribonuclease  36.21 
 
 		 74 aa  41.6  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0144298  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1117  translation initiation factor aIF-2, beta subunit  37.14 
 
 		 205 aa  40.4  0.008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000692895  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0690  RNA methyltransferase, TrmA family  36.51 
 
 		 449 aa  40  0.009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>