67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2830 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_2830  Translation initiation factor IF2/IF5  100 
 
 		 203 aa  415  9.999999999999999e-116  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0985  Translation initiation factor IF2/IF5  93.1 
 
 		 203 aa  382  1e-105  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.849775  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0818  translation initiation factor IF-2 subunit beta  70.15 
 
 		 203 aa  305  3e-82  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.487297 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1324  Translation initiation factor IF2/IF5  65.52 
 
 		 203 aa  264  8e-70  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.337196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0779  translation initiation factor IF-2 subunit beta  63.05 
 
 		 204 aa  253  1.0000000000000001e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.157582  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1423  translation initiation factor IF-2 subunit beta  50.25 
 
 		 202 aa  207  9e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1372  translation initiation factor IF-2 subunit beta  50.25 
 
 		 202 aa  203  1e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0180  translation initiation factor IF-2 subunit beta  48.76 
 
 		 208 aa  201  8e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0080  translation initiation factor IF-2 subunit beta  45.18 
 
 		 203 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0971382 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0483  translation initiation factor IF-2 subunit beta  42.64 
 
 		 204 aa  173  1.9999999999999998e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.677558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2335  translation initiation factor IF-2 subunit beta  40.91 
 
 		 203 aa  165  4e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.153667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1249  translation initiation factor IF-2 subunit beta  41.71 
 
 		 204 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00922141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1117  translation initiation factor aIF-2, beta subunit  39.3 
 
 		 205 aa  149  3e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000692895  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2170  translation initiation factor IF-2 subunit beta  38.42 
 
 		 205 aa  144  9e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0820  translation initiation factor IF-2 subunit beta  49.18 
 
 		 129 aa  124  9e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1308  translation initiation factor IF-2 subunit beta  38.93 
 
 		 138 aa  109  3e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2410  Translation initiation factor IF2/IF5  49.21 
 
 		 129 aa  108  5e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.262641 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1376  translation initiation factor IF-2 subunit beta  39.69 
 
 		 138 aa  107  1e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0656  translation initiation factor IF-2 subunit beta  39.69 
 
 		 138 aa  107  2e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.432331  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1300  translation initiation factor IF-2 subunit beta  39.69 
 
 		 138 aa  107  2e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.756042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1501  translation initiation factor IF-2 subunit beta  37.69 
 
 		 139 aa  105  3e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.134545  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81624  eIF2  38.16 
 
 		 271 aa  88.2  8e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.571106 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0380  translation initiation factor IF5  34.59 
 
 		 141 aa  87.8  1e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00129968  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00740  translation initiation factor, putative  33.08 
 
 		 314 aa  75.9  0.0000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.15304  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0538  translation initiation factor IF-2 subunit beta  36.15 
 
 		 134 aa  73.9  0.000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00412353 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0190  Translation initiation factor IF2/IF5  31.3 
 
 		 139 aa  73.9  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_88846  predicted protein  36.36 
 
 		 213 aa  73.6  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0540099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0658  translation initiation factor IF-2 subunit beta  31.54 
 
 		 140 aa  72  0.000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000021043  hitchhiker  0.00876921 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0582  translation initiation factor IF-2 subunit beta  36.15 
 
 		 136 aa  71.6  0.000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00328068  hitchhiker  0.00124905 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1439  translation initiation factor IF-2 subunit beta  33.85 
 
 		 134 aa  70.9  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.121861  decreased coverage  0.00662959 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0835  translation initiation factor IF-2 subunit beta  35.07 
 
 		 134 aa  67.8  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1412  translation initiation factor IF2/IF5  28.35 
 
 		 140 aa  67  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0459  translation initiation factor IF-2 subunit beta  32.31 
 
 		 134 aa  67  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02992  translational initiation factor 2 beta (AFU_orthologue; AFUA_3G08600)  36.27 
 
 		 304 aa  66.2  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72556  predicted protein  30.69 
 
 		 401 aa  63.9  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_27282  predicted protein  32.61 
 
 		 171 aa  62.4  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_46171  predicted protein  29.81 
 
 		 436 aa  57.4  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.516415  normal  0.0761252 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06067  eukaryotic translation initiation factor 5, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08990)  30.1 
 
 		 423 aa  56.2  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02150  translation initiation factor, putative  29.36 
 
 		 402 aa  53.9  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.827258  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0165  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  48.15 
 
 		 261 aa  52.4  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47039  predicted protein  30.21 
 
 		 413 aa  50.4  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.915264  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2048  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  44.83 
 
 		 273 aa  49.7  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.875415  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1792  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  35.44 
 
 		 256 aa  50.1  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0453  deoxyribonuclease  38.1 
 
 		 79 aa  49.3  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1019  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  41.82 
 
 		 262 aa  47.4  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.35921 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1027  hypothetical protein  37.5 
 
 		 68 aa  47.8  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3306  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  30.65 
 
 		 137 aa  47.8  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1026  hypothetical protein  35.94 
 
 		 68 aa  47  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1025  hypothetical protein  41.07 
 
 		 68 aa  47  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2908  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  40 
 
 		 132 aa  47.4  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0872  deoxyribonuclease  40.74 
 
 		 69 aa  45.8  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.375829  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0604  hypothetical protein  37.5 
 
 		 67 aa  45.8  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0082041  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1601  deoxyribonuclease  40.74 
 
 		 69 aa  45.8  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.919266  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0835  deoxyribonuclease  44.44 
 
 		 67 aa  45.8  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00148307  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1075  deoxyribonuclease  40.74 
 
 		 69 aa  45.8  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3102  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  36.71 
 
 		 144 aa  45.4  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1028  hypothetical protein  42.86 
 
 		 68 aa  45.8  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1613  deoxyribonuclease  41.07 
 
 		 79 aa  45.4  0.0005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4614  cyclic nucleotide-binding protein  38.03 
 
 		 134 aa  45.4  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3210  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  37.31 
 
 		 136 aa  44.3  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.217613  normal  0.112347 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1298  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  36.99 
 
 		 133 aa  43.5  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1445  RNA-binding protein  39.29 
 
 		 63 aa  43.5  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1751  RNA methyltransferase  35.59 
 
 		 453 aa  43.1  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216476  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1821  deoxyribonuclease  39.29 
 
 		 80 aa  42.4  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2770  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  39.68 
 
 		 154 aa  42.4  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.776355  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1667  deoxyribonuclease  39.29 
 
 		 79 aa  42.4  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0304  hypothetical protein  32.81 
 
 		 68 aa  42  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>