68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1324 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1324  Translation initiation factor IF2/IF5  100 
 
 		 203 aa  415  9.999999999999999e-116  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.337196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0779  translation initiation factor IF-2 subunit beta  73.04 
 
 		 204 aa  301  4.0000000000000003e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.157582  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0818  translation initiation factor IF-2 subunit beta  63.68 
 
 		 203 aa  270  8.000000000000001e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.487297 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0985  Translation initiation factor IF2/IF5  64.53 
 
 		 203 aa  261  6e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.849775  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2830  Translation initiation factor IF2/IF5  65.52 
 
 		 203 aa  260  1e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1423  translation initiation factor IF-2 subunit beta  45.23 
 
 		 202 aa  178  5.999999999999999e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1372  translation initiation factor IF-2 subunit beta  46 
 
 		 202 aa  175  3e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0180  translation initiation factor IF-2 subunit beta  43.07 
 
 		 208 aa  170  1e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2335  translation initiation factor IF-2 subunit beta  42.21 
 
 		 203 aa  169  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.153667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1249  translation initiation factor IF-2 subunit beta  41.5 
 
 		 204 aa  166  2e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00922141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0483  translation initiation factor IF-2 subunit beta  38.61 
 
 		 204 aa  160  1e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.677558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0080  translation initiation factor IF-2 subunit beta  38.31 
 
 		 203 aa  159  3e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0971382 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1117  translation initiation factor aIF-2, beta subunit  40.39 
 
 		 205 aa  149  3e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000692895  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2170  translation initiation factor IF-2 subunit beta  35.32 
 
 		 205 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0820  translation initiation factor IF-2 subunit beta  47.97 
 
 		 129 aa  111  9e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2410  Translation initiation factor IF2/IF5  46.03 
 
 		 129 aa  94.7  8e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.262641 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1376  translation initiation factor IF-2 subunit beta  33.83 
 
 		 138 aa  89.7  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1501  translation initiation factor IF-2 subunit beta  34.09 
 
 		 139 aa  88.6  5e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.134545  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1300  translation initiation factor IF-2 subunit beta  33.08 
 
 		 138 aa  87.8  1e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.756042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0656  translation initiation factor IF-2 subunit beta  33.08 
 
 		 138 aa  87.8  1e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.432331  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1308  translation initiation factor IF-2 subunit beta  32.58 
 
 		 138 aa  85.9  4e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0380  translation initiation factor IF5  31.58 
 
 		 141 aa  80.9  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00129968  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81624  eIF2  33.56 
 
 		 271 aa  76.3  0.0000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.571106 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1412  translation initiation factor IF2/IF5  30.16 
 
 		 140 aa  71.6  0.000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_88846  predicted protein  32.12 
 
 		 213 aa  69.7  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0540099  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00740  translation initiation factor, putative  32.35 
 
 		 314 aa  68.6  0.00000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.15304  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0582  translation initiation factor IF-2 subunit beta  30.88 
 
 		 136 aa  68.2  0.00000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00328068  hitchhiker  0.00124905 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0538  translation initiation factor IF-2 subunit beta  31.54 
 
 		 134 aa  67.4  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00412353 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_27282  predicted protein  31.62 
 
 		 171 aa  64.7  0.0000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1439  translation initiation factor IF-2 subunit beta  29.23 
 
 		 134 aa  64.3  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.121861  decreased coverage  0.00662959 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0835  translation initiation factor IF-2 subunit beta  30.77 
 
 		 134 aa  63.5  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0459  translation initiation factor IF-2 subunit beta  29.23 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0658  translation initiation factor IF-2 subunit beta  29.01 
 
 		 140 aa  60.8  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000021043  hitchhiker  0.00876921 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02992  translational initiation factor 2 beta (AFU_orthologue; AFUA_3G08600)  28.78 
 
 		 304 aa  60.1  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0190  Translation initiation factor IF2/IF5  29.77 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72556  predicted protein  30.48 
 
 		 401 aa  57.8  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1025  hypothetical protein  43.86 
 
 		 68 aa  54.7  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06067  eukaryotic translation initiation factor 5, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08990)  28.28 
 
 		 423 aa  54.7  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_46171  predicted protein  28.57 
 
 		 436 aa  54.7  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.516415  normal  0.0761252 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1026  hypothetical protein  42.11 
 
 		 68 aa  53.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1027  hypothetical protein  43.86 
 
 		 68 aa  53.9  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0604  hypothetical protein  43.08 
 
 		 67 aa  53.5  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0082041  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3306  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  41.03 
 
 		 137 aa  52.4  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0304  hypothetical protein  41.54 
 
 		 68 aa  52.4  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0453  deoxyribonuclease  34.52 
 
 		 79 aa  50.8  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1028  hypothetical protein  42.11 
 
 		 68 aa  50.8  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3102  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  38.16 
 
 		 144 aa  50.8  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1445  RNA-binding protein  42.11 
 
 		 63 aa  50.8  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1613  deoxyribonuclease  38.6 
 
 		 79 aa  49.7  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47039  predicted protein  26 
 
 		 413 aa  47.8  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.915264  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0165  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  40.74 
 
 		 261 aa  47.8  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1792  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  38.18 
 
 		 256 aa  47.4  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1019  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  38.18 
 
 		 262 aa  47.4  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.35921 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1821  deoxyribonuclease  38.6 
 
 		 80 aa  47  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1667  deoxyribonuclease  38.6 
 
 		 79 aa  46.6  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2048  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  40.74 
 
 		 273 aa  45.8  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.875415  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0963  RNA methyltransferase, TrmA family  39.62 
 
 		 457 aa  45.4  0.0005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.128465  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02150  translation initiation factor, putative  28.3 
 
 		 402 aa  45.8  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.827258  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0690  RNA methyltransferase, TrmA family  37.5 
 
 		 449 aa  44.7  0.0009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4614  cyclic nucleotide-binding protein  41.67 
 
 		 134 aa  43.9  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0581  deoxyribonuclease  38.89 
 
 		 74 aa  43.5  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0144298  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1431  deoxyribonuclease  44 
 
 		 74 aa  43.5  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1751  RNA methyltransferase  37.5 
 
 		 453 aa  43.9  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216476  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0835  deoxyribonuclease  39.62 
 
 		 67 aa  42.4  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00148307  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1298  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  34.67 
 
 		 133 aa  41.6  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1601  deoxyribonuclease  33.33 
 
 		 69 aa  41.6  0.008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.919266  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0872  deoxyribonuclease  33.33 
 
 		 69 aa  41.6  0.008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.375829  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1075  deoxyribonuclease  33.33 
 
 		 69 aa  41.6  0.008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>