55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2335 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2335  translation initiation factor IF-2 subunit beta  100 
 
 		 203 aa  412  1e-114  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.153667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0483  translation initiation factor IF-2 subunit beta  63.37 
 
 		 204 aa  286  2e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.677558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0080  translation initiation factor IF-2 subunit beta  62.87 
 
 		 203 aa  281  5.000000000000001e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0971382 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1249  translation initiation factor IF-2 subunit beta  63.37 
 
 		 204 aa  280  9e-75  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00922141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2170  translation initiation factor IF-2 subunit beta  58.62 
 
 		 205 aa  260  1e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1372  translation initiation factor IF-2 subunit beta  51.52 
 
 		 202 aa  218  6e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1423  translation initiation factor IF-2 subunit beta  47.76 
 
 		 202 aa  217  1e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0180  translation initiation factor IF-2 subunit beta  50 
 
 		 208 aa  211  4.9999999999999996e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1324  Translation initiation factor IF2/IF5  42.21 
 
 		 203 aa  169  2e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.337196  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0818  translation initiation factor IF-2 subunit beta  41.71 
 
 		 203 aa  165  4e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.487297 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2830  Translation initiation factor IF2/IF5  40.91 
 
 		 203 aa  162  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1117  translation initiation factor aIF-2, beta subunit  46.41 
 
 		 205 aa  163  2.0000000000000002e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000692895  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0985  Translation initiation factor IF2/IF5  39.09 
 
 		 203 aa  161  5.0000000000000005e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.849775  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0779  translation initiation factor IF-2 subunit beta  39.8 
 
 		 204 aa  157  1e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.157582  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1376  translation initiation factor IF-2 subunit beta  44.62 
 
 		 138 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1501  translation initiation factor IF-2 subunit beta  42.31 
 
 		 139 aa  124  7e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.134545  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0656  translation initiation factor IF-2 subunit beta  43.85 
 
 		 138 aa  124  8.000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.432331  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1300  translation initiation factor IF-2 subunit beta  43.85 
 
 		 138 aa  124  8.000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.756042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1308  translation initiation factor IF-2 subunit beta  41.54 
 
 		 138 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0820  translation initiation factor IF-2 subunit beta  41.46 
 
 		 129 aa  106  2e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2410  Translation initiation factor IF2/IF5  40.94 
 
 		 129 aa  99  4e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.262641 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02992  translational initiation factor 2 beta (AFU_orthologue; AFUA_3G08600)  33.82 
 
 		 304 aa  94.4  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_88846  predicted protein  41.12 
 
 		 213 aa  90.1  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0540099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81624  eIF2  34.23 
 
 		 271 aa  90.5  2e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.571106 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00740  translation initiation factor, putative  33.1 
 
 		 314 aa  89  4e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.15304  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0658  translation initiation factor IF-2 subunit beta  34.35 
 
 		 140 aa  88.6  5e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000021043  hitchhiker  0.00876921 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1412  translation initiation factor IF2/IF5  35.61 
 
 		 140 aa  89  5e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0582  translation initiation factor IF-2 subunit beta  37.59 
 
 		 136 aa  82.8  0.000000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00328068  hitchhiker  0.00124905 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0380  translation initiation factor IF5  30.08 
 
 		 141 aa  82  0.000000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00129968  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_27282  predicted protein  32.12 
 
 		 171 aa  77.8  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0190  Translation initiation factor IF2/IF5  31.3 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0835  translation initiation factor IF-2 subunit beta  29.85 
 
 		 134 aa  74.7  0.0000000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1439  translation initiation factor IF-2 subunit beta  31.34 
 
 		 134 aa  73.6  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.121861  decreased coverage  0.00662959 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0538  translation initiation factor IF-2 subunit beta  28.36 
 
 		 134 aa  70.1  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00412353 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0459  translation initiation factor IF-2 subunit beta  29.1 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47039  predicted protein  27.05 
 
 		 413 aa  57.4  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.915264  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0453  deoxyribonuclease  40 
 
 		 79 aa  57  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06067  eukaryotic translation initiation factor 5, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08990)  29.82 
 
 		 423 aa  56.2  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1667  deoxyribonuclease  47.17 
 
 		 79 aa  55.8  0.0000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1613  deoxyribonuclease  46 
 
 		 79 aa  55.5  0.0000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_46171  predicted protein  30.25 
 
 		 436 aa  55.5  0.0000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.516415  normal  0.0761252 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72556  predicted protein  27.97 
 
 		 401 aa  54.7  0.0000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02150  translation initiation factor, putative  26.67 
 
 		 402 aa  54.7  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.827258  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1821  deoxyribonuclease  51.06 
 
 		 80 aa  53.9  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1239  deoxyribonuclease  38.46 
 
 		 122 aa  49.7  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.331462  hitchhiker  0.00677702 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0391  RNA methyltransferase, TrmA family  38.89 
 
 		 457 aa  48.5  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1028  hypothetical protein  33.96 
 
 		 68 aa  45.8  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1026  hypothetical protein  30 
 
 		 68 aa  45.4  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3102  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  30 
 
 		 144 aa  44.3  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1027  hypothetical protein  28.33 
 
 		 68 aa  44.7  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1019  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  32.76 
 
 		 262 aa  43.1  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.35921 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0304  hypothetical protein  32.76 
 
 		 68 aa  42  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1445  RNA-binding protein  31.03 
 
 		 63 aa  42  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0311  RNA methyltransferase  35.85 
 
 		 458 aa  42  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0702  tRNA methyltransferase, TrmA family  33.96 
 
 		 453 aa  41.2  0.009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.307327  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>