40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_27282 on replicon NC_011676
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011676  PHATRDRAFT_27282  predicted protein  100 
 
 		 171 aa  357  4e-98  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_88846  predicted protein  49.7 
 
 		 213 aa  184  5e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0540099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81624  eIF2  47.56 
 
 		 271 aa  172  9.999999999999999e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.571106 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00740  translation initiation factor, putative  53.06 
 
 		 314 aa  166  2e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.15304  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02992  translational initiation factor 2 beta (AFU_orthologue; AFUA_3G08600)  46.94 
 
 		 304 aa  150  5.9999999999999996e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1117  translation initiation factor aIF-2, beta subunit  36.69 
 
 		 205 aa  88.2  6e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000692895  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1372  translation initiation factor IF-2 subunit beta  35.25 
 
 		 202 aa  82.4  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1308  translation initiation factor IF-2 subunit beta  32.17 
 
 		 138 aa  81.6  0.000000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1249  translation initiation factor IF-2 subunit beta  35.07 
 
 		 204 aa  81.3  0.000000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00922141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1423  translation initiation factor IF-2 subunit beta  34.31 
 
 		 202 aa  81.3  0.000000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1300  translation initiation factor IF-2 subunit beta  33.33 
 
 		 138 aa  79.7  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.756042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0656  translation initiation factor IF-2 subunit beta  33.33 
 
 		 138 aa  79.7  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.432331  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0180  translation initiation factor IF-2 subunit beta  34.78 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2335  translation initiation factor IF-2 subunit beta  32.12 
 
 		 203 aa  78.2  0.00000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.153667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1501  translation initiation factor IF-2 subunit beta  31.91 
 
 		 139 aa  77.4  0.00000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.134545  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0080  translation initiation factor IF-2 subunit beta  31.39 
 
 		 203 aa  77  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0971382 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1376  translation initiation factor IF-2 subunit beta  31.88 
 
 		 138 aa  75.1  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0483  translation initiation factor IF-2 subunit beta  34.55 
 
 		 204 aa  75.1  0.0000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.677558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2170  translation initiation factor IF-2 subunit beta  31.39 
 
 		 205 aa  74.3  0.0000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0582  translation initiation factor IF-2 subunit beta  31.34 
 
 		 136 aa  73.6  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00328068  hitchhiker  0.00124905 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0190  Translation initiation factor IF2/IF5  29.37 
 
 		 139 aa  70.9  0.000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0658  translation initiation factor IF-2 subunit beta  28.87 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000021043  hitchhiker  0.00876921 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0380  translation initiation factor IF5  26.21 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00129968  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1324  Translation initiation factor IF2/IF5  31.62 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.337196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0538  translation initiation factor IF-2 subunit beta  27.86 
 
 		 134 aa  63.9  0.000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00412353 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0820  translation initiation factor IF-2 subunit beta  28.46 
 
 		 129 aa  63.5  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0459  translation initiation factor IF-2 subunit beta  28.57 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0835  translation initiation factor IF-2 subunit beta  27.14 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1439  translation initiation factor IF-2 subunit beta  27.14 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.121861  decreased coverage  0.00662959 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2830  Translation initiation factor IF2/IF5  31.88 
 
 		 203 aa  62  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1412  translation initiation factor IF2/IF5  29.58 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72556  predicted protein  28.85 
 
 		 401 aa  57.8  0.00000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0818  translation initiation factor IF-2 subunit beta  29.71 
 
 		 203 aa  57  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.487297 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02150  translation initiation factor, putative  31.68 
 
 		 402 aa  56.6  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.827258  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2410  Translation initiation factor IF2/IF5  27.21 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.262641 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06067  eukaryotic translation initiation factor 5, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08990)  28 
 
 		 423 aa  56.2  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0985  Translation initiation factor IF2/IF5  30.5 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.849775  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0779  translation initiation factor IF-2 subunit beta  27.21 
 
 		 204 aa  53.9  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.157582  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47039  predicted protein  29 
 
 		 413 aa  52.8  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.915264  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_46171  predicted protein  23.76 
 
 		 436 aa  41.2  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.516415  normal  0.0761252 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>