39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0658 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0658  translation initiation factor IF-2 subunit beta  100 
 
 		 140 aa  290  3e-78  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000021043  hitchhiker  0.00876921 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0190  Translation initiation factor IF2/IF5  68.38 
 
 		 139 aa  207  4e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0380  translation initiation factor IF5  39.44 
 
 		 141 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00129968  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1501  translation initiation factor IF-2 subunit beta  36.64 
 
 		 139 aa  101  3e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.134545  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0835  translation initiation factor IF-2 subunit beta  36.03 
 
 		 134 aa  96.7  8e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0582  translation initiation factor IF-2 subunit beta  36.36 
 
 		 136 aa  94.7  4e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00328068  hitchhiker  0.00124905 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0459  translation initiation factor IF-2 subunit beta  36.03 
 
 		 134 aa  94  6e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0538  translation initiation factor IF-2 subunit beta  34.56 
 
 		 134 aa  93.6  7e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00412353 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1439  translation initiation factor IF-2 subunit beta  35.29 
 
 		 134 aa  93.6  9e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.121861  decreased coverage  0.00662959 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1372  translation initiation factor IF-2 subunit beta  36.64 
 
 		 202 aa  93.2  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1117  translation initiation factor aIF-2, beta subunit  36.92 
 
 		 205 aa  92.4  2e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000692895  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0483  translation initiation factor IF-2 subunit beta  35.11 
 
 		 204 aa  92.4  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.677558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1376  translation initiation factor IF-2 subunit beta  36.09 
 
 		 138 aa  90.5  7e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1300  translation initiation factor IF-2 subunit beta  35.34 
 
 		 138 aa  89.7  1e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.756042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0656  translation initiation factor IF-2 subunit beta  35.34 
 
 		 138 aa  89.7  1e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.432331  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2335  translation initiation factor IF-2 subunit beta  34.35 
 
 		 203 aa  88.6  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.153667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2170  translation initiation factor IF-2 subunit beta  34.35 
 
 		 205 aa  88.2  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0080  translation initiation factor IF-2 subunit beta  35.88 
 
 		 203 aa  88.6  3e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0971382 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1249  translation initiation factor IF-2 subunit beta  32.82 
 
 		 204 aa  86.3  1e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00922141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1308  translation initiation factor IF-2 subunit beta  33.08 
 
 		 138 aa  86.7  1e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1423  translation initiation factor IF-2 subunit beta  32.82 
 
 		 202 aa  85.9  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0180  translation initiation factor IF-2 subunit beta  34.65 
 
 		 208 aa  84.7  4e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0820  translation initiation factor IF-2 subunit beta  29.6 
 
 		 129 aa  79.7  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02992  translational initiation factor 2 beta (AFU_orthologue; AFUA_3G08600)  29.93 
 
 		 304 aa  77.8  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2410  Translation initiation factor IF2/IF5  30.23 
 
 		 129 aa  77  0.00000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.262641 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00740  translation initiation factor, putative  29.08 
 
 		 314 aa  74.3  0.0000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.15304  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1412  translation initiation factor IF2/IF5  33.33 
 
 		 140 aa  74.3  0.0000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2830  Translation initiation factor IF2/IF5  31.54 
 
 		 203 aa  71.6  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_88846  predicted protein  29.37 
 
 		 213 aa  71.2  0.000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0540099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0985  Translation initiation factor IF2/IF5  30.77 
 
 		 203 aa  70.9  0.000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.849775  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0779  translation initiation factor IF-2 subunit beta  29.55 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.157582  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_27282  predicted protein  28.87 
 
 		 171 aa  66.2  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0818  translation initiation factor IF-2 subunit beta  28.46 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.487297 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1324  Translation initiation factor IF2/IF5  29.01 
 
 		 203 aa  60.8  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.337196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81624  eIF2  29.9 
 
 		 271 aa  60.8  0.000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.571106 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72556  predicted protein  28.43 
 
 		 401 aa  48.9  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06067  eukaryotic translation initiation factor 5, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08990)  29 
 
 		 423 aa  45.8  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02150  translation initiation factor, putative  23.53 
 
 		 402 aa  42.4  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.827258  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_46171  predicted protein  23.96 
 
 		 436 aa  42.7  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.516415  normal  0.0761252 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>