55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2170 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_2170  translation initiation factor IF-2 subunit beta  100 
 
 		 205 aa  420  1e-117  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0483  translation initiation factor IF-2 subunit beta  68.78 
 
 		 204 aa  306  2.0000000000000002e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.677558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0080  translation initiation factor IF-2 subunit beta  63.05 
 
 		 203 aa  268  5e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0971382 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2335  translation initiation factor IF-2 subunit beta  58.62 
 
 		 203 aa  260  1e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.153667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1249  translation initiation factor IF-2 subunit beta  56.37 
 
 		 204 aa  248  5e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00922141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1372  translation initiation factor IF-2 subunit beta  51 
 
 		 202 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1423  translation initiation factor IF-2 subunit beta  50.75 
 
 		 202 aa  207  6e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0180  translation initiation factor IF-2 subunit beta  49.75 
 
 		 208 aa  202  2e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1117  translation initiation factor aIF-2, beta subunit  41.44 
 
 		 205 aa  144  7.0000000000000006e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000692895  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2830  Translation initiation factor IF2/IF5  38.38 
 
 		 203 aa  143  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0985  Translation initiation factor IF2/IF5  37.37 
 
 		 203 aa  143  1e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.849775  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1501  translation initiation factor IF-2 subunit beta  46.92 
 
 		 139 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.134545  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0818  translation initiation factor IF-2 subunit beta  33.67 
 
 		 203 aa  128  5.0000000000000004e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.487297 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1308  translation initiation factor IF-2 subunit beta  42.31 
 
 		 138 aa  128  6e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1376  translation initiation factor IF-2 subunit beta  43.08 
 
 		 138 aa  127  9.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0656  translation initiation factor IF-2 subunit beta  42.75 
 
 		 138 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.432331  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1300  translation initiation factor IF-2 subunit beta  42.75 
 
 		 138 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.756042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1324  Translation initiation factor IF2/IF5  35.32 
 
 		 203 aa  126  2.0000000000000002e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.337196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0779  translation initiation factor IF-2 subunit beta  33.66 
 
 		 204 aa  123  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.157582  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0820  translation initiation factor IF-2 subunit beta  41.8 
 
 		 129 aa  103  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02992  translational initiation factor 2 beta (AFU_orthologue; AFUA_3G08600)  38.74 
 
 		 304 aa  91.3  9e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0380  translation initiation factor IF5  33.83 
 
 		 141 aa  91.3  1e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00129968  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0658  translation initiation factor IF-2 subunit beta  34.35 
 
 		 140 aa  88.2  7e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000021043  hitchhiker  0.00876921 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1412  translation initiation factor IF2/IF5  33.82 
 
 		 140 aa  87.4  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00740  translation initiation factor, putative  34.31 
 
 		 314 aa  86.7  2e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.15304  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0190  Translation initiation factor IF2/IF5  35.11 
 
 		 139 aa  83.6  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2410  Translation initiation factor IF2/IF5  39.34 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.262641 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81624  eIF2  35.71 
 
 		 271 aa  81.6  0.000000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.571106 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0582  translation initiation factor IF-2 subunit beta  32.35 
 
 		 136 aa  79.3  0.00000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00328068  hitchhiker  0.00124905 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_88846  predicted protein  39.39 
 
 		 213 aa  77.4  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0540099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_27282  predicted protein  31.39 
 
 		 171 aa  74.3  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0459  translation initiation factor IF-2 subunit beta  30.6 
 
 		 134 aa  70.1  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0835  translation initiation factor IF-2 subunit beta  29.1 
 
 		 134 aa  68.6  0.00000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1439  translation initiation factor IF-2 subunit beta  28.36 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.121861  decreased coverage  0.00662959 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0538  translation initiation factor IF-2 subunit beta  28.36 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00412353 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06067  eukaryotic translation initiation factor 5, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08990)  26.27 
 
 		 423 aa  57.8  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72556  predicted protein  26.72 
 
 		 401 aa  56.2  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02150  translation initiation factor, putative  26.02 
 
 		 402 aa  55.5  0.0000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.827258  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_46171  predicted protein  30 
 
 		 436 aa  55.1  0.0000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.516415  normal  0.0761252 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47039  predicted protein  28.91 
 
 		 413 aa  53.1  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.915264  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0453  deoxyribonuclease  34.85 
 
 		 79 aa  47.8  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1239  deoxyribonuclease  44.44 
 
 		 122 aa  47.8  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.331462  hitchhiker  0.00677702 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1075  deoxyribonuclease  34.38 
 
 		 69 aa  45.1  0.0007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0872  deoxyribonuclease  34.38 
 
 		 69 aa  45.1  0.0007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.375829  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1601  deoxyribonuclease  34.38 
 
 		 69 aa  45.1  0.0007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.919266  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1028  hypothetical protein  37.04 
 
 		 68 aa  45.1  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1613  deoxyribonuclease  38.46 
 
 		 79 aa  44.3  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1821  deoxyribonuclease  39.58 
 
 		 80 aa  43.9  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1299  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  34.33 
 
 		 155 aa  43.5  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1667  deoxyribonuclease  33.93 
 
 		 79 aa  43.1  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1026  hypothetical protein  33.93 
 
 		 68 aa  42.4  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1027  hypothetical protein  33.93 
 
 		 68 aa  42.7  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1577  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  32.2 
 
 		 464 aa  42  0.006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1025  hypothetical protein  35.71 
 
 		 68 aa  42  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1438  RNA methyltransferase  40 
 
 		 459 aa  41.6  0.007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>