65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0985 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_0985  Translation initiation factor IF2/IF5  100 
 
 
203 aa  416  9.999999999999999e-116  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.849775  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2830  Translation initiation factor IF2/IF5  93.1 
 
 
203 aa  384  1e-106  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0818  translation initiation factor IF-2 subunit beta  69.15 
 
 
203 aa  307  8e-83  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.487297 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1324  Translation initiation factor IF2/IF5  64.53 
 
 
203 aa  265  5e-70  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.337196  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0779  translation initiation factor IF-2 subunit beta  64.04 
 
 
204 aa  263  2e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.157582  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1423  translation initiation factor IF-2 subunit beta  49.75 
 
 
202 aa  210  9e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1372  translation initiation factor IF-2 subunit beta  48.74 
 
 
202 aa  201  4e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0180  translation initiation factor IF-2 subunit beta  47.26 
 
 
208 aa  200  9.999999999999999e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0080  translation initiation factor IF-2 subunit beta  45.69 
 
 
203 aa  184  7e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0971382 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0483  translation initiation factor IF-2 subunit beta  41.12 
 
 
204 aa  171  9e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.677558  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2335  translation initiation factor IF-2 subunit beta  39.09 
 
 
203 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.153667  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1249  translation initiation factor IF-2 subunit beta  40.2 
 
 
204 aa  161  7e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00922141  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1117  translation initiation factor aIF-2, beta subunit  39.3 
 
 
205 aa  152  2.9999999999999998e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000692895  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2170  translation initiation factor IF-2 subunit beta  37.86 
 
 
205 aa  145  5e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0820  translation initiation factor IF-2 subunit beta  48.36 
 
 
129 aa  125  3e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2410  Translation initiation factor IF2/IF5  50 
 
 
129 aa  111  8.000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.262641 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0656  translation initiation factor IF-2 subunit beta  39.69 
 
 
138 aa  107  1e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.432331  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1300  translation initiation factor IF-2 subunit beta  39.69 
 
 
138 aa  107  1e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.756042  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1376  translation initiation factor IF-2 subunit beta  39.69 
 
 
138 aa  107  1e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1308  translation initiation factor IF-2 subunit beta  37.4 
 
 
138 aa  107  1e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1501  translation initiation factor IF-2 subunit beta  36.92 
 
 
139 aa  106  2e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.134545  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0380  translation initiation factor IF5  34.59 
 
 
141 aa  91.7  8e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00129968  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81624  eIF2  35.62 
 
 
271 aa  79.7  0.00000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.571106 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00740  translation initiation factor, putative  30.65 
 
 
314 aa  71.6  0.000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.15304  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0538  translation initiation factor IF-2 subunit beta  33.85 
 
 
134 aa  71.6  0.000000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00412353 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0582  translation initiation factor IF-2 subunit beta  34.07 
 
 
136 aa  71.2  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00328068  hitchhiker  0.00124905 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0658  translation initiation factor IF-2 subunit beta  30.77 
 
 
140 aa  70.9  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000021043  hitchhiker  0.00876921 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1439  translation initiation factor IF-2 subunit beta  31.54 
 
 
134 aa  68.6  0.00000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.121861  decreased coverage  0.00662959 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_88846  predicted protein  32.52 
 
 
213 aa  67.8  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0540099  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02992  translational initiation factor 2 beta (AFU_orthologue; AFUA_3G08600)  33.04 
 
 
304 aa  65.9  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0459  translation initiation factor IF-2 subunit beta  30.77 
 
 
134 aa  65.1  0.0000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1412  translation initiation factor IF2/IF5  28.24 
 
 
140 aa  65.5  0.0000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72556  predicted protein  29.31 
 
 
401 aa  65.1  0.0000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0835  translation initiation factor IF-2 subunit beta  32.31 
 
 
134 aa  65.1  0.0000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_46171  predicted protein  28.57 
 
 
436 aa  60.5  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.516415  normal  0.0761252 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_27282  predicted protein  30.5 
 
 
171 aa  56.6  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06067  eukaryotic translation initiation factor 5, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08990)  28.16 
 
 
423 aa  53.5  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0165  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  33.7 
 
 
261 aa  52.8  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47039  predicted protein  28.12 
 
 
413 aa  51.6  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.915264  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02150  translation initiation factor, putative  28.57 
 
 
402 aa  50.8  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.827258  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2048  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  44.83 
 
 
273 aa  50.1  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.875415  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3306  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  32.26 
 
 
137 aa  50.4  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0453  deoxyribonuclease  36.9 
 
 
79 aa  48.9  0.00005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1792  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  34.18 
 
 
256 aa  48.5  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1027  hypothetical protein  38.1 
 
 
68 aa  47.8  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1025  hypothetical protein  41.07 
 
 
68 aa  47.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1026  hypothetical protein  36.51 
 
 
68 aa  47.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2908  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  37.14 
 
 
132 aa  46.6  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1028  hypothetical protein  42.86 
 
 
68 aa  46.2  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0604  hypothetical protein  38.1 
 
 
67 aa  46.2  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0082041  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1019  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  40 
 
 
262 aa  46.2  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.35921 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1075  deoxyribonuclease  38.89 
 
 
69 aa  44.7  0.0008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0835  deoxyribonuclease  42.59 
 
 
67 aa  45.1  0.0008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00148307  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0872  deoxyribonuclease  38.89 
 
 
69 aa  44.7  0.0008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.375829  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1601  deoxyribonuclease  38.89 
 
 
69 aa  44.7  0.0008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.919266  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3102  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  36.84 
 
 
144 aa  44.7  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1298  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  35.62 
 
 
133 aa  44.3  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4614  cyclic nucleotide-binding protein  41.38 
 
 
134 aa  44.7  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1613  deoxyribonuclease  39.29 
 
 
79 aa  44.3  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3210  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  38.1 
 
 
136 aa  43.5  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.217613  normal  0.112347 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1445  RNA-binding protein  39.29 
 
 
63 aa  43.9  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1751  RNA methyltransferase  35.59 
 
 
453 aa  43.5  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216476  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0304  hypothetical protein  33.33 
 
 
68 aa  42.4  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2770  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  39.68 
 
 
154 aa  42.4  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.776355  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1821  deoxyribonuclease  37.5 
 
 
80 aa  41.2  0.01  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>